tert-butyl N-[2-[[(2R,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-5-[(2S,3R,4S,5S,6R)-4-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-4-hydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]carbamothioylamino]ethyl]carbamate | 1144564-48-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: tert-butyl N-[2-[[(2R,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-5-[(2S,3R,4S,5S,6R)-4-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-4-hydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]carbamothioylamino]ethyl]carbamate
• CAS: 1144564-48-6
• 化学式: C₃₀H₅₃N₅O₁₇S
• 分子量: 787.84
• InChiKey: VJBIGHPXJVERLW-PEWNXGMGSA-N

物化性质

• 密度：
  1.52±0.1 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -5.2
• 重原子数：
  53
• 可旋转键数：
  15
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.87
• 拓扑面积：
  361
• 氢给体数：
  13
• 氢受体数：
  18

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  tert-butyl N-[2-[[(2R,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-5-[(2S,3R,4S,5S,6R)-4-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-4-hydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]carbamothioylamino]ethyl]carbamate 在 盐酸 、 recombinant β1,3-galactosyltransferase from Escherichia coli O55:H7 、 magnesium chloride 、 alkaline phosphatase 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 48.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  N-乙酰乳糖胺 (LacNAc) 1 型低聚物的酶法合成和作为多价半乳糖凝集素配体的表征

  摘要：

  二糖单元 N-乙酰乳糖胺 (LacNAc) 的重复以糖蛋白和糖脂上的 1 型（Galβ1、3GlcNAc）和 2 型（Galβ1、4GlcNAc）糖基化基序形式出现。LacNAc 基序充当凝集素的结合配体，并参与许多生物识别事件。据我们所知，我们首次使用来自大肠杆菌的重组 β1,3-半乳糖基转移酶和来自幽门螺杆菌的 β1,3-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶合成 LacNAc 1 型寡聚体。分别在还原或非还原端呈递 LacNAc 1 型重复或 LacNAc 1 型的四糖聚糖通过方形接头化学与牛血清白蛋白结合作为蛋白质支架。在酶联凝集素测定 (ELLA) 中，进一步研究了由此产生的多价 LacNAc 1 型呈递新糖蛋白的肿瘤相关人半乳糖凝集素 3 (Gal-3) 及其截短的对应物 Gal-3Δ 的特异性结合。我们观察到 Gal-3∆ 对呈递 LacNAc 1 型重复单元的多价新糖蛋白的亲和力显着增加。这是

  DOI：

  10.3390/molecules22081320
• 作为产物：
  描述：

  UDP-Gal 在 β1,3-N-acetylglucosaminyltransferase from Helicobacter pylori 、 His₆-propeptide-catβ4GalT-1 from human 、 UDP-Glc/GlcNAc 4'-epimerase 、 potassium chloride 、 sodium hydroxide 、 magnesium chloride 、 manganese(ll) chloride 、 1,4-二巯基-2,3-丁二醇 作用下， 以 aq. phosphate buffer 为溶剂， 反应 48.0h， 生成 tert-butyl N-[2-[[(2R,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-5-[(2S,3R,4S,5S,6R)-4-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-4-hydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]carbamothioylamino]ethyl]carbamate
  参考文献：
  名称：

  糖基转移酶和糖合酶在顺序反应和一锅反应中的组合，用于合成1型和2型N-乙酰乙酰氨基低聚物

  摘要：

  N-乙酰基乳糖胺（LacNAc）1型和2型以及poly-LacNAc的二糖单元参与许多生物识别事件。我们通过两种重组糖基转移酶β1,3的组合报告了1型（3Galβ1-3GlcNAcβ1-; Gal = d-半乳糖，GlcNAc = N-乙酰基d-葡糖胺）和2型（3Galβ1-4GlcNAcβ1-4）的LacNAc寡聚体的模块化设计。- ñ从-acetylglucosaminyltransferase幽门螺杆菌和人类β1,4半乳糖转移酶1，用galactosynthase他6 BgaC / Glu233Gly从环状芽孢杆菌。他的6 BgaC / Glu233Gly和β1,3- N的组合顺序或单罐模式下的‐乙酰氨基葡萄糖氨基转移酶可产生最多四个LacNAc单元的LacNAc 1型寡聚体。此外，顺序使用所有这三种酶可以访问各种neo-LacNAc低聚物。我们介绍了由1型和2型交替单元和1型终止的LacNAc

  DOI：

  10.1002/cctc.201500645

文献信息

• Chemo-Enzymatic Synthesis of Branched<i>N</i>-Acetyllactosamine Glycan Oligomers for Galectin-3 Inhibition
  作者：Dominic Laaf、Hanna Steffens、Helena Pelantová、Pavla Bojarová、Vladimír Křen、Lothar Elling

  DOI：10.1002/adsc.201700969

  日期：2017.11.23

  concept for the synthesis of branched N‐acetyllactosamine (LacNAc) glycan structures. Through a combination of sequential enzymatic and chemical reactions of Leloir‐glycosyltransferases, galactose oxidase and reductive amination, we obtained branched glycan oligomers with a variation of LacNAc and/or N′,N′′‐diacetyllactosamine (LacdiNAc) glycan epitopes. Incorporation of a branching point was accomplished

  我们在这里提出了一个新的概念，用于合成支链N-乙酰基乳糖胺（LacNAc）聚糖结构。通过Leloir糖基转移酶，半乳糖氧化酶和还原胺化的顺序酶促和化学反应的组合，我们获得了具有LacNAc和/或N'，N''变异的支链聚糖低聚物-二乙酰基乳糖胺（LacdiNAc）聚糖表位。分支点的引入是通过优化的半乳糖氧化酶方案实现的，该方案可在LacNAc低聚物的末端半乳糖上呈现C-6醛官能团。通过糖基转移酶延长聚糖链后，将含C-6醛的线性结构单元与胺连接基官能化的聚糖偶联。发现甲醇和50°C的温度是α-甲基吡啶硼烷催化的还原胺化反应的最佳条件。在制备批次中，以高合成产率（约81％）获得了化学支链的聚糖。通过制备型HPLC分离产物，总收率良好（> 60％）。通过ESI-MS和NMR证明了结构的完整性。本文合成的分支LacNAc低聚物具有Lac（di）NAc表位的变异，并被证实是人Galectin-3（Ga
• Tailored Multivalent Neo-Glycoproteins: Synthesis, Evaluation, and Application of a Library of Galectin-3-Binding Glycan Ligands
  作者：Dominic Laaf、Pavla Bojarová、Helena Pelantová、Vladimír Křen、Lothar Elling

  DOI：10.1021/acs.bioconjchem.7b00520

  日期：2017.11.15

  albumin (BSA) was accomplished by dialkyl squarate coupling to lysine residues resulting in a library of defined multivalent neo-glycoproteins. Solid-phase binding assays with immobilized neo-glycoproteins revealed distinct affinity and specificity of the multivalent glycan epitopes for Gal-3 binding. In particular, neo-glycoproteins decorated with N′,N″-diacetyllactosamine (GalNAcβ1,4GlcNAc; LacdiNAc) epitopes

  Galectin-3（Gal-3）是β-半乳糖苷结合凝集素家族的成员，是一种肿瘤生物标志物，参与肿瘤血管生成和转移。因此，Gal-3被认为是早期癌症诊断和抗癌治疗的有希望的靶标。我们在这里提出了定制的多价新糖蛋白文库的合成，并评估了它们的Gal-3结合特性。通过结合使用糖基转移酶和化学酶促反应，我们首先合成了一组N-乙酰基乳糖胺（Galβ1,4GlcNAc； LacNAc 2型）为基础的寡糖，分别具有五个不同的终止糖基化表位。牛血清白蛋白（BSA）的新糖基化是通过将二烷基方酸与赖氨酸残基偶联而完成的，从而形成一个确定的多价新糖蛋白文库。固定化的新糖蛋白的固相结合测定显示了多价聚糖表位对Gal-3结合的独特亲和力和特异性。特别是，用N '，N修饰的新糖蛋白″-二乙酰基乳糖胺（GalNAcβ1,4GlcNAc; LacdiNAc）表位显示出高选择性，并被证明可以高亲和力从人血清中捕获Gal-3
• [EN] GLYCOPOLYMER, METHOD OF PREPARATION THEREOF, USE THEREOF AS MEDICAMENT<br/>[FR] GLYCOPOLYMÈRE, SON PROCÉDÉ DE PRÉPARATION, SON UTILISATION EN TANT QUE MÉDICAMENT
  申请人：USTAV MAKROMOLEKULARNI CHEMIE AV CR V V I

  公开号：WO2021047699A1

  公开（公告）日：2021-03-18

  The invention relates to multivalent glycopolymers based on HPMA polymers (copolymers or homopolymers) with carbohydrate structures containing a terminal monosaccharide in the galacto-configuration, which are effective as galectin inhibitors. These glycopolymers can be used as drugs for the therapy and prevention of oncological diseases associated with overproduction of galectins, especially of human galectin-3 (Gal-3).

  该发明涉及基于HPMA聚合物（共聚物或同聚物）的多价糖聚合物，其含有以半乳糖构型为终端的碳水化合物结构，可作为半乳糖凝集素抑制剂。这些糖聚合物可用作治疗和预防与过度产生凝集素有关的肿瘤性疾病的药物，特别是人类凝集素-3（Gal-3）。
• Towards Keratan Sulfate - Chemoenzymatic Cascade Synthesis of Sulfated<i>N</i>-Acetyllactosamine (LacNAc) Glycan Oligomers
  作者：Bastian Lange、Anna Šimonová、Thomas Fischöder、Helena Pelantová、Vladimír Křen、Lothar Elling

  DOI：10.1002/adsc.201500916

  日期：2016.2.18

  We report on a novel chemoenzymatic cascade for the synthesis of sulfated N‐acetyllactosamine [(3Galβ1,4GlcNAcβ1,)n, LacNAc] oligomer structures. Starting from a linker modified GlcNAc substrate di‐ and trisaccharides were first synthesized by sequential use of human β4‐galactosyltransferase‐1 (β4GalT‐1) and β3‐N‐acetylglucosaminyltransferase from Helicobacter pylori (β3GlcNAcT). Subsequent regioselective

  我们报告了一种新型的化学酶联级联反应，用于合成硫酸化的N-乙酰基乳糖胺[（3Galβ1,4GlcNAcβ1，）n，LacNAc]低聚物结构。从接头修饰的GlcNAc底物开始，首先依次使用人幽门螺杆菌（Helicobacter pylori）的人β4-半乳糖基转移酶-1（β4GalT-1）和β3- N-乙酰氨基葡萄糖氨基转移酶（β3GlcNAcT）合成二糖和三糖。随后的区域选择性化学硫酸化使C-6单，二和三O硫酸化产品收率很高。β4GalT-1和β3GlcNAcT在顺序模式下进一步的酶促延伸产生6 O硫酸化的LacNAc低聚物，直至六糖的长度，且硫酸化程度可变。这些碳水化合物结构模仿硫酸角质素中发现的硫酸化模式，并且是不同类别的聚糖结合蛋白的潜在配体。
• Combinatorial One-Pot Synthesis of Poly-N-acetyllactosamine Oligosaccharides with Leloir-Glycosyltransferases
  作者：Claudia Rech、Ruben R. Rosencrantz、Karel Křenek、Helena Pelantová、Pavla Bojarová、Christiane E. Römer、Franz-Georg Hanisch、Vladimír Křen、Lothar Elling

  DOI：10.1002/adsc.201100375

  日期：2011.9

  AbstractPoly‐N‐acetyllactosamine (Poly‐LacNAc, [3Galβ1,4GlcNAcβ1]n) glycans play an essential role in carbohydrate‐protein interactions. The synthesis of poly‐LacNAc, both chemical and enzymatic, is typically characterized by high losses of product during sequential synthesis, due to deprotection and/or purification steps. In this work we present a one‐pot synthesis of poly‐LacNAc oligosaccharides by combining recombinant glycosyltransferases. By fractionation of the poly‐LacNAc glycan mixture we were able to isolate glycans with up to six N‐acetyllactosamine (LacNAc) units. Activity measurements of the involved recombinant β1,4‐galactosyltransferase‐1 (β4GalT‐1) and β1,3‐N‐acetylglucosaminyltransferase (β3GlcNAcT) with isolated glycan substrates of up to eight sugar units revealed a preference of β3GlcNAcT for the tetrasaccharide and no preference of β4GalT‐1 for a specific glycan length. These findings led us to the optimization of combinatorial one‐pot synthesis by variation of substrate and enzyme ratios, as well as starting the synthesis with various poly‐LacNAc chain lengths. Consequently, we present here an optimized poly‐LacNAc synthesis by the combination of two glycosyltransferases and a uridine‐diphospho‐glucose/N‐acetylglucosamine 4′‐epimerase as one‐pot strategy resulting in long poly‐LacNAc glycans with up to six LacNAc units in high yields while minimizing reaction time and product loss. The obtained products are important ligands for the biofunctionalization of biomaterial surfaces and the construction of an artificial extracellular matrix for tissue engineering.