3-甲基尿苷 | 2140-69-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 中文名称: 3-甲基尿苷
• 英文名称: 3-methyluridine
• 英文别名: m³U；1-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-3-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 2140-69-4
• 化学式: C₁₀H₁₄N₂O₆
• 分子量: 258.231
• InChiKey: UTQUILVPBZEHTK-ZOQUXTDFSA-N

物化性质

• 熔点：
  108-110 °C
• 沸点：
  501.1±60.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.605±0.06 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  DMSO（微溶加热）、甲醇（微溶加热）、水（微溶超声处理）
• 碰撞截面：
  164.2 Ų [M+Na]+ [CCS Type: DT, Method: single field calibrated with Agilent tune mix (Agilent)]

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.8
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  111
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  6

安全信息

• 危险性防范说明：
  P261,P280,P301+P312,P302+P352,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H302,H315,H319,H335

制备方法与用途

生物活性

3-甲基尿苷（N3-甲基尿苷）是一种修饰的细胞RNA核苷。它通常以RNA修饰的形式出现，能够在古菌的23S rRNA、真细菌的16S和23S rRNA以及真核核糖体的18S、25S和28SrRNA中被检测到。

靶点

• 人内源性代谢物

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-甲基尿苷 在 manganese(IV) oxide 、 C₁₇H₂₀N₄O₉P^(1-)*Na⁽¹⁺⁾ 、 氧气 作用下， 以 水 、 乙腈 为溶剂， 20.0 ℃ 、101.33 kPa 条件下， 反应 7.0h， 以98%的产率得到尿嘧啶核苷
  参考文献：
  名称：

  黄素单核苷酸作为细胞活性人工 N6-甲基腺苷 RNA 脱甲基酶的鉴定。

  摘要：

  N 6 ‐甲基腺苷 (m 6 A) 是真核 RNA 中一种常见且高度动态的修饰，可影响各种细胞通路。天然双加氧酶如 FTO 和 ALKBH5 是使mRNA 中的m 6 A 残基去甲基化的酶。在本文中，首次鉴定了一种具有人工 m 6 A 脱甲基酶功能的小分子调节剂。黄素单核苷酸 (FMN) 是核黄素激酶产生的代谢物，可介导活细胞中 RNA的 m 6 A 残基的大量光化学去甲基化。该研究为理解 m 6的去甲基化提供了新的视角mRNA 中的 A 残基，揭示了强大的小分子作为 RNA 脱甲基酶和用于 RNA 生物学的新探针的开发。

  DOI：

  10.1002/anie.201900901
• 作为产物：
  描述：

  2’,3’邻异亚丙基尿苷 在 盐酸 、 水 、 sodium hydride 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 12.0h， 生成 3-甲基尿苷
  参考文献：
  名称：

  2'，3'- O-异亚丙基神经氨酸与碘甲烷的选择性N 3-和5'- O-烷基化

  摘要：

  在2'，3'- Ô -isopropylideneuridine（1）反应用MeI在过量的NaH的THF存在下给予2'，3'- ö异亚丙基-5'- Ö -methyluridine（2）。延长的反应时间产生2′，3′ - O-异亚丙基-3，5′- O-二甲基尿苷（4）。等摩尔量的碱和烷基化剂的使用主要导致在N（3）（3）处的甲基化。

  DOI：

  10.1002/hlca.19970800319

文献信息

• [EN] BIOACTIVE CONJUGATES FOR OLIGONUCLEOTIDE DELIVERY<br/>[FR] CONJUGUÉS BIOACTIFS POUR L'ADMINISTRATION D'OLIGONUCLÉOTIDES
  申请人：UNIV MASSACHUSETTS

  公开号：WO2017030973A1

  公开（公告）日：2017-02-23

  Provided herein are self-delivering oligonucleotides that are characterized by efficient RISC entry, minimum immune response and off-target effects, efficient cellular uptake without formulation, and efficient and specific tissue distribution.

  本文提供的自递送寡核苷酸具有高效的RISC进入、最小的免疫反应和非靶效应、无需配方的高效细胞摄取，以及高效和特异的组织分布。
• Noncanonical RNA Nucleosides as Molecular Fossils of an Early Earth-Generation by Prebiotic Methylations and Carbamoylations
  作者：Christina Schneider、Sidney Becker、Hidenori Okamura、Antony Crisp、Tynchtyk Amatov、Michael Stadlmeier、Thomas Carell

  DOI：10.1002/anie.201801919

  日期：2018.5.14

  prebiotic routes towards RNA. Contemporary RNA, however, is not only constructed from the four canonical nucleobases (A, C, G, and U), it also contains many chemically modified (noncanonical) bases. A still open question is whether these noncanonical bases were formed in parallel to the canonical bases (chemical origin) or later, when life demanded higher functional diversity (biological origin). Here

  RNA世界假说假设地球上的生命始于催化其自身形成的小RNA分子。对该假设至关重要的是，需要针对RNA的益生元途径。然而，当代RNA不仅由四个规范的核碱基（A，C，G和U）构建，而且还包含许多化学修饰的（非规范）碱基。一个尚待解决的问题是，当生命需要更高的功能多样性（生物起源）时，这些非规范碱基是否与规范碱基（化学起源）平行或更晚地形成。在这里，我们显示异氰酸酯与亚硝酸钠的组合建立了与地球早期条件相容的甲基化和氨基甲酰化反应性。这些反应导致仍然存在的甲基化和氨基酸修饰的核苷的形成。
• The invention of radical reactions. Part XXXI. Diphenylsilane: a reagent for deoxygenation of alcohols via their thiocarbonyl derivatives, deamination via isonitriles, and dehalogenation of bromo- and iodo- compounds by radical chain chemistry
  作者：Derek H.R. Barton、Doo Ok Jang、Joseph Cs. Jaszberenyi

  DOI：10.1016/s0040-4020(01)87198-2

  日期：1993.8

  Various thionocarbonates and xanthates of alcohols and bis-xanthates of vic-diols are readily deoxygenated to the corresponding hydrocarbons or olefins, while bromides and iodides are dehalogenated with diphenylphenylsilane in good yield.

  各种thionocarbonates和醇的黄原酸盐和二的-xanthates VIC -diols容易脱氧成相应的烃或烯烃，而溴化物和碘化物与以良好的收率diphenylphenylsilane脱卤。
• Compounds for modulating RNA interference
  申请人：——

  公开号：US20040204420A1

  公开（公告）日：2004-10-14

  The present invention pertains to compounds effective at modulating (inhibiting or enhancing) RNA interference in a cell or organism. Featured compounds are set forth and exemplified herein. Therapeutic methods and pharmaceutical compositions featuring the compounds are also provided. The invention further pertains to knock-out or knock-down cells and organisms including the compounds, and methods of analysis of gene expression profiles and proteomes.

  本发明涉及一种在细胞或生物体中调节（抑制或增强）RNA干扰的有效化合物。所述的特定化合物在此处列出并且进行了示范。还提供了以这些化合物为特色的治疗方法和药物组合物。该发明还涉及包括这些化合物的敲除或敲低细胞和生物体，以及基因表达谱和蛋白质组的分析方法。
• [EN] NOVEL PHOSPHOROUS (V)-BASED REAGENTS, PROCESSES FOR THE PREPARATION THEREOF, AND THEIR USE IN MAKING STEREO-DEFINED ORGANOPHOSHOROUS (V) COMPOUNDS<br/>[FR] NOUVEAUX RÉACTIFS À BASE DE PHOSPHORE (V), LEURS PROCÉDÉS DE PRÉPARATION ET LEUR UTILISATION DANS LA FABRICATION DE COMPOSÉS ORGANOPHOSHOREUX (V) STÉRÉODÉFINIS
  申请人：BRISTOL MYERS SQUIBB CO

  公开号：WO2019200273A1

  公开（公告）日：2019-10-17

  The present invention relates to novel phosphorous (V) (P(V)) reagents, methods for preparing thereof, and methods for preparing organophosphorous (V) compounds by using the novel reagents.

  本发明涉及新型磷（V）（P(V)）试剂，其制备方法以及利用这种新型试剂制备有机磷（V）化合物的方法。