5'-O-DMT-N2-(dimethylaminomethylene)-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-N1-(6-nitropiperonyloxymethylene) guanosine 3'-[(2-cyanoethyl)-N,N-diisopropylaminophosphoramidite] | 1221574-29-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 5'-O-DMT-N2-(dimethylaminomethylene)-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-N1-(6-nitropiperonyloxymethylene) guanosine 3'-[(2-cyanoethyl)-N,N-diisopropylaminophosphoramidite]
• CAS: 1221574-29-3
• 化学式: C₅₉H₇₆N₉O₁₃PSi
• 分子量: 1178.36
• InChiKey: RQJOSNRGYNMAJG-UUINEEEFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  11.16
• 重原子数：
  83.0
• 可旋转键数：
  26.0
• 环数：
  8.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.47
• 拓扑面积：
  230.78
• 氢给体数：
  0.0
• 氢受体数：
  20.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  5-[1-(chloromethoxy)ethyl]-6-nitro-1,3-benzodioxole 在 4-二甲氨基吡啶 吡啶 、 N-甲基咪唑 、 2,4,6-三甲基吡啶 、 pyridine hydrofluoride 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 20.0h， 生成 5'-O-DMT-N2-(dimethylaminomethylene)-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-N1-(6-nitropiperonyloxymethylene) guanosine 3'-[(2-cyanoethyl)-N,N-diisopropylaminophosphoramidite]
  参考文献：
  名称：

  Caged nucleotides and oligonucleotides and their application

  摘要：

  披露了具有保护或“笼罩”基团的核苷酸和核苷酸类似物。进一步披露了形成具有保护或“笼罩”基团的寡核苷酸和寡核苷酸类似物。进一步披露了一种去笼罩具有保护或“笼罩”基团的核苷酸和核苷酸类似物以及具有笼罩基团的寡核苷酸和寡核苷酸类似物的方法。

  公开号：

  US08247540B2