p-tolyl 6-O-acetyl-2-azido-3-O-benzyl-4-O-tert-butyldimethylsilyl-2-deoxy-1-thio-β-D-glucopyranoside | 1242437-13-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: p-tolyl 6-O-acetyl-2-azido-3-O-benzyl-4-O-tert-butyldimethylsilyl-2-deoxy-1-thio-β-D-glucopyranoside
• 英文别名: [(2R,3S,4R,5R,6S)-5-azido-3-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-6-(4-methylphenyl)sulfanyl-4-phenylmethoxyoxan-2-yl]methyl acetate
• CAS: 1242437-13-3
• 化学式: C₂₈H₃₉N₃O₅SSi
• 分子量: 557.786
• InChiKey: KIJJNZGDCHWZTR-ACFIUOAZSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.03
• 重原子数：
  38
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.54
• 拓扑面积：
  93.6
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  p-tolyl 6-O-acetyl-2-azido-3-O-benzyl-4-O-tert-butyldimethylsilyl-2-deoxy-1-thio-β-D-glucopyranoside 在 1,2-二甲基咪唑 、 甲醇 、 4-二甲氨基吡啶 、 magnesium hydroxide 、 水 、 silver trifluoromethanesulfonate 、 1-(3-二甲基氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺 、 2,3-二氯-5,6-二氰基-1,4-苯醌 作用下， 以 乙醚 、 二氯甲烷 为溶剂， -78.0~80.0 ℃ 、1.2 MPa 条件下， 反应 19.49h， 生成 p-tolyl 2-azido-3-O-benzyl-4-O-tert-butyldimethylsilyl-2-deoxy-6-O-(2,2,2-trichloroethylsulfuryl)-α-D-glucopyranosyl-(1->4)-2-O-benzoyl-3-O-benzyl-6-O-levulinoyl-1-thio-β-D-glucopyranoside
  参考文献：
  名称：

  预装硫酸酯的不同肝素寡糖合成

  摘要：

  肝素寡糖的传统化学合成首先涉及全长寡糖骨架的组装，然后是硫酸化。在此，我们报告了一种替代策略，其中在组装全长寡糖之前，将O-硫酸盐作为三氯乙酯引入糖基结构单元。这允许从常见的高级中间体中不同地制备硫酸化和非硫酸化结构单元。该Ø发现 ‐硫酸酯在糖基化过程中以及在肝素寡糖合成过程中遇到的典型合成操作过程中是稳定的。此外，糖基供体和受体中硫酸酯的存在不会对糖基化产率产生不利影响，这使我们能够用预装的 6- O-硫酸盐组装多种肝素寡糖。

  DOI：

  10.1002/chem.201101108
• 作为产物：
  描述：

  p-methylphenyl 2-azido-6-O-acetyl-2-deoxy-3-O-benzyl-1-thio-β-D-glucopyranoside 、 叔丁基二甲硅基三氟甲磺酸酯 在 2,6-二甲基吡啶 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 5.0h， 以90%的产率得到p-tolyl 6-O-acetyl-2-azido-3-O-benzyl-4-O-tert-butyldimethylsilyl-2-deoxy-1-thio-β-D-glucopyranoside
  参考文献：
  名称：

  基于预激活的一锅法组合合成肝素样六糖，用于分析肝素-蛋白质相互作用

  摘要：

  肝素（HP）和硫酸乙酰肝素（HS）在许多生物事件中发挥着重要作用。越来越多的证据表明，HP 和 HS 的生物学功能很大程度上取决于它们的精确结构，包括艾杜糖醛酸的位置和硫酸化模式。然而，由于巨大的结构变化，破解 HP 代码极具挑战性。为了克服这一障碍，我们研究了使用基于预激活的一锅糖基化方法组装 HP/HS 寡糖文库的可能性。 HP/HS 寡糖合成的一个主要挑战是葡萄糖胺和糖醛酸之间顺式1,4 连接形成的立体选择性。通过筛选，在匹配的糖基供体和受体上鉴定出合适的保护基团，从而导致 HP 中存在的顺式‐1,4- 和反式‐1,4- 连接的立体特异性形成。设计的保护基化学也非常灵活。从两种先进的硫代糖基二糖中间体，文库制备所需的所有二糖模块都可以以不同的方式生成，这大大简化了构建块的制备。此外，基于预激活的一锅法的反应独立性使我们能够混合构建块。这使得十二种 HP/HS 六糖能够以组合方式快速组

  DOI：

  10.1002/chem.201000987

文献信息

• Chemical Synthesis of a Heparan Sulfate Glycopeptide: Syndecan-1
  作者：Bo Yang、Keisuke Yoshida、Zhaojun Yin、Hang Dai、Herbert Kavunja、Mohammad H. El-Dakdouki、Suttipun Sungsuwan、Steven B. Dulaney、Xuefei Huang

  DOI：10.1002/anie.201205601

  日期：2012.10.1

  assembled. The protective groups utilized, as well as the sequences for formation of the glycosyl linkages and protecting group removal are critical to the success of the synthesis. This first preparation of a heparan sulfate glycopeptide lays the foundation for accessing other members of this class of molecules.

  首先完成：组装了标题化合物的高度复杂结构（见图）。所使用的保护基团以及用于形成糖基连接和保护基团去除的序列对于合成的成功至关重要。硫酸乙酰肝素糖肽的首次制备为获得此类分子的其他成员奠定了基础。
• Obstacles and solutions for chemical synthesis of syndecan-3 (53–62) glycopeptides with two heparan sulfate chains
  作者：Weizhun Yang、Keisuke Yoshida、Bo Yang、Xuefei Huang

  DOI：10.1016/j.carres.2016.10.005

  日期：2016.11

  cassettes, which were utilized towards syndecan-3 glycopeptides. The glycopeptides presented many obstacles for post-glycosylation manipulation, peptide elongation, and deprotection. Following screening of multiple synthetic sequences, a successful strategy was finally established by constructing partially deprotected single glycan chain containing glycopeptides first, followed by coupling of the glycan-bearing

  蛋白聚糖在许多生物学事件中起关键作用。由于它们的结构复杂性，迫切需要合成这类带有明确定义的聚糖链的糖肽的策略。在这项工作中，我们全面介绍了含有两条不同硫酸乙酰肝素链的syndecan-3糖肽（53-62）的合成。为了组装聚糖，开发了一种收敛的3 + 2 + 3方法，可产生两个不同的八糖氨基酸盒，这些盒可用于syndecan-3糖肽。糖肽为糖基化后的操作，肽的延伸和去保护提供了许多障碍。在筛选了多个合成序列之后，通过首先构建包含糖肽的部分脱保护的单聚糖链，最终建立了成功的策略，
• Divergent Synthesis of Heparan Sulfate Oligosaccharides
  作者：Steven B. Dulaney、Yongmei Xu、Peng Wang、Gopinath Tiruchinapally、Zhen Wang、Jolian Kathawa、Mohammad H. El-Dakdouki、Bo Yang、Jian Liu、Xuefei Huang

  DOI：10.1021/acs.joc.5b02172

  日期：2015.12.18

  Heparan sulfates are implicated in a wide range of biological processes. A major challenge in deciphering their structure and activity relationship is the synthetic difficulties to access diverse heparan sulfate oligosaccharides with well-defined sulfation patterns. In order to expedite the synthesis, a divergent synthetic strategy was developed. By integrating chemical synthesis and two types of O-sulfo

  硫酸乙酰肝素与多种生物过程有关。破译其结构和活性关系的一个主要挑战是获得具有明确硫酸化模式的各种硫酸乙酰肝素寡糖的合成困难。为了加速合成，开发了不同的合成策略。通过整合化学合成和两种类型的O-磺基转移酶，从单一六糖前体中获得了七种不同的六糖。这种方法结合了化学合成的灵活性和酶催化硫酸化的选择性，从而简化了整个合成操作。为了建立硫酸乙酰肝素与其受体结合的结构活性关系，将合成的寡糖整合到聚糖微阵列上，并检查它们与生长因子 FGF-2 的结合。化学和酶方法的独特组合扩大了寡糖合成的能力。此外，明确的硫酸乙酰肝素结构有助于揭示生物合成酶的精细底物特异性，并确认生物合成中酶促反应的潜在序列。