N2-isobutyryl-3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-2'-O-(tert-butyldithiomethyl)guanosine | 913645-92-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: N2-isobutyryl-3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-2'-O-(tert-butyldithiomethyl)guanosine
• 英文别名: N²-isobutyryl-3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-2'-O-(tert-butyldithiomethyl)guanosine
• CAS: 913645-92-8
• 化学式: C₃₁H₅₅N₅O₇S₂Si₂
• 分子量: 730.11
• InChiKey: LYDUTBUGZJAOHC-UQCYUJMQSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.09
• 重原子数：
  47.0
• 可旋转键数：
  11.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.81
• 拓扑面积：
  138.82
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  12.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N2-isobutyryl-3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-2'-O-(tert-butyldithiomethyl)guanosine 在 四丁基氟化铵 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 吡啶 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 N2-isobutyryl-O6-diphenylcarbamoyl-2'-O-(tert-butyldithiomethyl)guanosine
  参考文献：
  名称：

  使用 2'-O-DTM 保护合成 RNA

  摘要：

  叔丁基二硫甲基 (DTM) 是一种新型的羟基保护基团，可在还原条件下裂解，被开发并应用于固相 RNA 合成过程中的 2'-OH 保护。此功能与寡核苷酸合成中使用的所有标准保护基团兼容，并允许快速、高产地合成 RNA。含有 2'-O-DTM 基团的寡核苷酸可以在尽可能温和的水性和均相条件下轻松脱保护。保留的 5'-O-DMTr 功能可用于高通量盒式 RNA 纯化。

  DOI：

  10.1021/ja0636587
• 作为产物：
  描述：

  N²-isobutyryl-2'-O-methylthiomethyl-5',3'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxan-1,3-diyl)guanosine 在 磺酰氯 、 3 Angstroem MS 、 环己烯 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 2.5h， 生成 N2-isobutyryl-3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-2'-O-(tert-butyldithiomethyl)guanosine
  参考文献：
  名称：

  使用 2'-O-DTM 保护合成 RNA

  摘要：

  叔丁基二硫甲基 (DTM) 是一种新型的羟基保护基团，可在还原条件下裂解，被开发并应用于固相 RNA 合成过程中的 2'-OH 保护。此功能与寡核苷酸合成中使用的所有标准保护基团兼容，并允许快速、高产地合成 RNA。含有 2'-O-DTM 基团的寡核苷酸可以在尽可能温和的水性和均相条件下轻松脱保护。保留的 5'-O-DMTr 功能可用于高通量盒式 RNA 纯化。

  DOI：

  10.1021/ja0636587

文献信息

• [EN] 2'-MODIFIED NUCLEOSIDE BASED OLIGONUCLEOTIDE PRODRUGS<br/>[FR] PROMÉDICAMENTS OLIGONUCLÉOTIDIQUES À BASE DE NUCLÉOSIDES MODIFIÉS EN 2'
  申请人：[en]ALNYLAM PHARMACEUTICALS, INC.

  公开号：WO2022147223A2

  公开（公告）日：2022-07-07

  This invention relates to an oligonucleotide comprising one or more 2'-modified nucleosides, wherein the 2'-position of the nucleoside has a structure of formula (I). The invention also relates to a pharmaceutical composition comprising the oligonucleotide described herein and a method of reducing or inhibiting the expression of a target gene by administering to the subject a therapeutically effective amount of the oligonucleotide described herein. The invention also relates to a method of bioactivating an oligonucleotide comprising one or more 2'-modified nucleosides, wherein the 2'-position of the nucleoside is modified by a bio-cleavable linking group, wherein the bio-cleavable linking group comprises acetal, disulfide, carbamate, amide, sulfonamide, a biocleavable carbohydrate linker, or combinations thereof, said method comprising the step of: exposing the oligonucleotide to a physiological condition that causes the bio-cleavable linking group to be cleaved from the 2'-modified nucleoside, thereby regenerating the 2'-OH group of the nucleoside.