3-(2-azidoethyl)-5-nitro-1H-indole | 1246776-62-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: 3-(2-azidoethyl)-5-nitro-1H-indole
• CAS: 1246776-62-4
• 化学式: C₁₀H₉N₅O₂
• 分子量: 231.214
• InChiKey: IJJIKTHZONXXNS-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.2
• 重原子数：
  17
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.2
• 拓扑面积：
  76
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-(2-azidoethyl)-5-nitro-1H-indole 、 (1R,3R,4R,5S)-3-[2-O-benzoyl-3-O-((1S)-1-carboxy-2-cyclohexylethyl)-(β-D-galactopyranosyl)oxy]-N-(but-3-yn-1-yl)-4-[(α-L-fucopyranosyl)oxy]-5-methylcyclohexanecarboxamide 在 copper(ll) sulfate pentahydrate 、 sodium ascorbate 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 、 叔丁醇 为溶剂， 以70%的产率得到(1R,3R,4R,5S)-3-[2-O-benzoyl-3-O-((1S)-1-carboxy-2-cyclohexylethyl)-(β-D-galactopyranosyl)oxy]-4-[(α-L-fucopyranosyl)oxy]-5-methyl-N-(2-{1-[2-(6-nitro-1H-indol-3-yl)ethyl]-1H-1,2,3-triazol-4-yl}ethyl)cyclohexanecarboxamide
  参考文献：
  名称：

  Nanomolar E-Selectin Antagonists with Prolonged Half-Lives by a Fragment-Based Approach

  摘要：

  Selectins, a family of C-type lectins, play a key role in inflammatory diseases (e.g., asthma and arthritis). However, the only millimolar affinity of sialyl Lewis(x) (sLe(x)), which is the common tetrasaccharide epitope of all physiological selectin ligands, has been a major obstacle to the development of selectin antagonists for therapeutic applications. In a fragment-based approach guided by NMR, ligands binding to a second site in close proximity to a sLe(x) mimic were identified. A library of antagonists obtained by connecting the sLe(x) mimic to the best second-site ligand via triazole linkers of different lengths was evaluated by surface plasmon resonance. Detailed analysis of the five most promising candidates revealed antagonists with K-D values ranging from 30 to 89 nM. In contrast to carbohydratelectin complexes with typical half-lives (t(1/2)) in the range of one second or even less, these fragment-based selectin antagonists show t(1/2) of several minutes. They exhibit a promising starting point for the development of novel anti-inflammatory drugs.

  DOI：

  10.1021/ja4029582
• 作为产物：
  描述：

  3-(2-hydroxyethyl)-5-nitroindole 在 15-冠醚-5 sodium azide 、 四溴化碳 、 三苯基膦 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 18.0h， 生成 3-(2-azidoethyl)-5-nitro-1H-indole
  参考文献：
  名称：

  [EN] E-SELECTIN ANTAGONISTS
  [FR] ANTAGONISTES DE L'E-SÉLECTINE

  摘要：

  提供了抑制E-选择素结合介导的体内外过程的化合物、组合物和方法。更具体地，描述了特定的糖类拟态化合物，其中这些化合物是E-选择素拮抗剂。

  公开号：

  WO2012037034A1

文献信息

• A Fragment-Based In Situ Combinatorial Approach To Identify High-Affinity Ligands for Unknown Binding Sites
  作者：Sachin V. Shelke、Brian Cutting、Xiaohua Jiang、Hendrik Koliwer-Brandl、Daniel S. Strasser、Oliver Schwardt、Soerge Kelm、Beat Ernst

  DOI：10.1002/anie.200907254

  日期：——

  the lead: The title method for the identification of ligands is particularly useful for binding sites where little or no structural information is available. In a fragment‐based approach, a suitable pair of first‐ and second‐site ligands is identified by NMR experiments. By applying a receptor‐mediated in situ combinatorial approach, the two ligands are then linked to generate a new high‐affinity lead

  潜在客户：鉴定配体的标题方法特别适用于很少或没有结构信息的结合位点。在基于片段的方法中，通过NMR实验确定了合适的一对第一位和第二位配体。通过应用受体介导的原位组合方法，然后将两个配体连接起来以生成新的高亲和力铅结构（参见图片）。