2-N-isobutyryl-2'-O-tert-butyldimethylsilyl-3'-O-(H-thiophosphonate)guanosine sodium salt | 1203453-35-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 2-N-isobutyryl-2'-O-tert-butyldimethylsilyl-3'-O-(H-thiophosphonate)guanosine sodium salt
• 英文别名: 2-N-isobutyryl-2'-O-tert-butyldimethylsilyl-3'-O-(H-thiophosphonate)-guanosine sodium salt
• CAS: 1203453-35-3
• 化学式: C₂₀H₃₃N₅O₇PSSi*Na
• 分子量: 569.626
• InChiKey: LGTGRDUKUALECT-CATZXYISSA-M

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.68
• 重原子数：
  36.0
• 可旋转键数：
  8.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.7
• 拓扑面积：
  157.66
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  11.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-N-isobutyryl-2'-O-tert-butyldimethylsilyl-3'-O-(H-thiophosphonate)guanosine sodium salt 、 N2-isobutyryl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-tertbutyl(dimethylsilyl)guanine-3'-O-[O-(2-cyanoethyl)-N,N-(diisopropyl)]phosphoramidite 在 三氟乙酸吡啶 、 吡啶 、 1,2,3,4,5,6,7,8-八硫杂环辛烷 、 sodium hydrogen sulfate 作用下， 以 乙腈 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.17h， 生成 2-N-isobutyryl-2'-O-tert-butyldimethylsilyl-P-thioguanosinylyl (3'->5')-2-N-isobutyryl-2'-O-tert-butyldimethylsilyl-3'-O-(H-thiophosphonate)-guanosine sodium salt
  参考文献：
  名称：

  SYNTHESIS OF CYCLIC DIGUANOSINE MONOPHOSPHATE AND THIOPHOSPHATE ANALOGS THEREOF

  摘要：

  本发明提供了合成环状双核苷酸及其硫代磷酸酯类似物的方法，以及包含一系列七个硫代磷酸酯衍生物的环状二鸟苷酸单磷酸酯的新类似物，其中包括单硫、双硫和三硫磷酸酯的对映异构体。

  公开号：

  US20120178710A1
• 作为产物：
  描述：

  5'-O-[双(4-甲氧基苯基)苯基甲基]-2'-O-[(叔丁基)二甲基硅基]-N-(2-甲基-1-氧代丙基)鸟苷 在 吡啶 、 亚磷酸二苯酯 、 lithium sulfide 、 碳酸氢钠 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 0.92h， 以71%的产率得到2-N-isobutyryl-2'-O-tert-butyldimethylsilyl-3'-O-(H-thiophosphonate)guanosine sodium salt
  参考文献：
  名称：

  SYNTHESIS OF CYCLIC DIGUANOSINE MONOPHOSPHATE AND THIOPHOSPHATE ANALOGS THEREOF

  摘要：

  本发明提供了合成环状双核苷酸及其硫代磷酸酯类似物的方法，以及包含一系列七个硫代磷酸酯衍生物的环状二鸟苷酸单磷酸酯的新类似物，其中包括单硫、双硫和三硫磷酸酯的对映异构体。

  公开号：

  US20120178710A1

文献信息

• Thiophosphate Analogs of c-di-GMP: Impact on Polymorphism
  作者：Jianwei Zhao、Elizabeth Veliath、Seho Kim、Barbara L. Gaffney、Roger A. Jones

  DOI：10.1080/15257770903044523

  日期：2009.8.11

  Seven phosphorothioate analogs of c-di-GMP (all diastereomers of mono-, di-, and trithiophosphates) were prepared to assess the impact of the thioate substitutions on c-di-GMP polymorphism using 1D H-1 and P-31 NMR, along with 2D NOESY and DOSY, for both the Na+ and K+ salts. The K+ salts display more extensive higher order complex formation than the Na+ salts, resulting primarily in octamolecular complexes with K+, but tetramolecular complexes with Na+. Further, the presence of one or two [S-P] sulfurs specifically stabilizes anti complexes and/or destabilizes syn complexes, while the presence of two [S-P] sulfurs Promotes extensive aggregation.