benzyl (2,4,5,7,8-penta-O-acetyl-3-deoxy-α-D-manno-oct-2-ulopyranosyl)onate | 113955-18-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: benzyl (2,4,5,7,8-penta-O-acetyl-3-deoxy-α-D-manno-oct-2-ulopyranosyl)onate
• 英文别名: benzyl 2,4,5,7,8-penta-O-acetyl-3-deoxy-α-D-manno-2-octulosonate；Benzyl 2,4,5,7,8-penta-O-acetyl-3-deoxy-alpha-D-manno-2-octulosonate；benzyl (2S,4R,5R,6R)-2,4,5-triacetyloxy-6-[(1R)-1,2-diacetyloxyethyl]oxane-2-carboxylate
• CAS: 113955-18-3
• 化学式: C₂₅H₃₀O₁₃
• 分子量: 538.505
• InChiKey: BKPBJKYTTRKCKA-BBPVLXATSA-N

物化性质

• 沸点：
  596.8±50.0 °C(predicted)
• 密度：
  1.32±0.1 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.3
• 重原子数：
  38
• 可旋转键数：
  16
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.52
• 拓扑面积：
  167
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  13

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  benzyl (2,4,5,7,8-penta-O-acetyl-3-deoxy-α-D-manno-oct-2-ulopyranosyl)onate 在 4-二甲氨基吡啶 、 4 A molecular sieve 、 氰化汞 、 溴化钛(IV) 、 mercury dibromide 作用下， 反应 42.33h， 生成 benzyl 6-O-(benzyl 4,5,7,8-tetra-O-acetyl-3-deoxy-β-D-manno-2-octulopyranosylonate)-2-deoxy-4-O-diphenylphosphono-2-(2,2,2-trichloroethoxycarbonyl)amino-3-O-(2,2,2-trichloroethoxycarbonyl)-β-D-glucopyranoside
  参考文献：
  名称：

  脂质A和相关化合物。十六。生物活性的四乙酰基-3-脱氧-D-甘露糖-2-辛磺酸（KDO）-（α2 ---- 6）-D-葡糖胺-4-磷酸的合成，脂质A的非还原糖部分的新类似物。

  摘要：

  描述了生物活性四乙酰基-3-脱氧-D-甘露糖-2-八烯酸-(α2→6)-D-氨基葡萄糖-4-磷酸的脂质A类似物的合成。

  DOI：

  10.1248/cpb.35.4537
• 作为产物：
  描述：

  3-deoxy-D-manno-octulosonic acid ammonium salt 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 caesium carbonate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 18.0h， 生成 benzyl (2,4,5,7,8-penta-O-acetyl-3-deoxy-α-D-manno-oct-2-ulopyranosyl)onate
  参考文献：
  名称：

  4'-甲氧基苯酰基辅助合成β-Kdo糖苷

  摘要：

  3-脱氧β- d -甘露-oct-2-ulosonic acid（β-Kdo）糖苷主要存在于革兰氏阴性细菌的荚膜多糖和细胞外胞外多糖中。这些化合物在免疫反应中具有深远的生物学意义，并充当毒力因子。我们已经开发了一种新颖的方法，可通过在过乙酰化的β-Kdo硫代糖苷C1位置使用4'-甲氧基苯甲酰基（Phen）辅助基团来立体选择性合成β-Kdo糖苷。在NIS / AgOTf在乙腈中的促进下，合成了一系列Kdo糖苷，具有良好的收率和β选择性，同时最大程度地减少了不良糖的形成。糖基化的立体选择性显示出受多种因素调节，例如启动子，溶剂，供体的端基异构体比例，受体的性质和Phen取代。在Zn / HOAc的作用下，对Phen基团进行了化学选择性切割。DFT计算和实验结果表明，α-三氟甲磺酸盐和六元α-spiroPhen是反应的合理中间产物，说明了β-Kdo糖苷形成的增加。所开发的方法可以应用于由病原菌合成含β-Kdo的聚糖。

  DOI：

  10.1021/acs.joc.6b01431

文献信息

• Synthesis of 3-deoxy-D-manno-2-octulosonic acid (KDO) and its analogs based on KDO aldolase-catalyzed reactions
  作者：Takeshi Sugai、Gwo Jenn Shen、Yoshitaka Ichikawa、Chi Huey Wong

  DOI：10.1021/ja00055a008

  日期：1993.1

  3-Deoxy-D-manno-2-octulosonic acid (D-KDO) was synthesized from D-arabinose and pyruvate in 67% yield by using KDO aldolase (EC 4.1.2.21) from Aureobacterium barkerei strain KDO-37-2 (ATCC 49977). Studies on the substrate specificity of the enzyme with more than 20 natural and unnatural sugars indicate that this enzyme widely accepts trioses, tetroses, pentoses, and hexoses as substrates, especially

  3-脱氧-D-甘露糖-2-辛糖酸 (D-KDO) 使用来自巴氏金杆菌菌株 KDO-37-2 (ATCC) 的 KDO 醛缩酶 (EC 4.1.2.21) 从 D-阿拉伯糖和丙酮酸以 67% 的产率合成49977）。对该酶具有 20 多种天然和非天然糖的底物特异性的研究表明，该酶广泛接受丙糖、丁糖、戊糖和己糖作为底物，尤其是在 1 位具有 R 构型的酶。2位取代基对羟醛反应影响不大
• KDO Aldolase and condensation reactions employed therewith
  申请人：The Scripps Research Institute

  公开号：US05358859A1

  公开（公告）日：1994-10-25

  Aureobacterium barkerei strain KDO-37-2 (ATCC 49977) KDO aldolase (EC 4.1.2.23) isolated therefrom are disclosed. The DKDO aldolase is further disclosed to have a broad substrate specificity with respect to its reverse reaction, i.e. the condensation of aldoses with pyruvate to form a wide range of 2-keto-3-deoxy-onic acids, including 2-keto-3-deoxy-nonulosonic acid, 2-keto-3-deoxy-octulosonic acid, 2-keto-3-deoxy-heptulosonic acid, and 2-keto-3-deoxy-hexulosonic acid. In particular, 3-deoxy-D-manno-2-octulosonic acid (D-KDO), a vital component of lipopolysaccharides found in the bacterial outer membrane may be synthesized from D-arabinose and pyruvate in 67% yield. Additionally, protected forms of the KDO aldolase products, e.g. hexaacetyl 2-keto-3-deoxy-nonulosonic acid and pentaacetyl 2-keto-3-deoxy-octulosonic acid, may be decarboxylated to form the corresponding 2-deoxy-aldoses, e.g. 2-deoxy-octulose and 2-deoxy-heptulose respectively.

  本文介绍了从Aureobacterium barkerei菌株KDO-37-2（ATCC 49977）中分离出的KDO-37-2（ATCC 49977）KDO醛缩酶（EC 4.1.2.23）。进一步披露了DKDO醛缩酶在其反向反应方面具有广泛的底物特异性，即醛糖与丙酮酸的缩合反应，形成广泛的2-酮-3-去氧-酮酸，包括2-酮-3-去氧-非烯酸、2-酮-3-去氧-辛烯酸、2-酮-3-去氧-庚烯酸和2-酮-3-去氧-己烯酸。特别是，3-去氧-D-曼诺-2-辛烯酸（D-KDO），一种在细菌外膜中发现的脂多糖的重要组成部分，可以从D-阿拉伯糖和丙酮酸中合成，产率为67％。此外，KDO醛缩酶产品的保护形式，例如六乙酰化2-酮-3-去氧-非烯酸和五乙酰化2-酮-3-去氧-辛烯酸，可以脱羧形成相应的2-去氧醛糖，例如2-去氧-辛糖和2-去氧-庚糖。
• Method for synthesizing 2-ketoaldonic acids
  申请人：The Scripps Research Institute

  公开号：US05759825A1

  公开（公告）日：1998-06-02

  2-Ketoaldonic acid is synthesized by aldolase condensation reaction involving pyruvate and an aldose acceptor in the presence of excess pyruvate. After the reaction is substantially complete, the excess pyruvate is removed from the reaction mixture by treatment with pyruvate decarboxylase.

  2-酮醛酸是通过在过量丙酮酸存在下，以丙酮酸和醛类受体为基础进行的醛缩合成反应合成的。反应基本完成后，通过使用丙酮酸脱羧酶处理反应混合物，从中去除过量的丙酮酸。
• Biologically pure culture of aureobacterium barkeri KDO-37-2
  申请人：The Scripps Research Institute

  公开号：US05869316A1

  公开（公告）日：1999-02-09

  Aureobacterium barkeri strain KDO-37-2 (ATCC 49977) and KDO aldolase (EC 4.1.2.23) isolated therefrom are disclosed. The KDO aldolase is further disclosed to have a broad substrate specificity with respect to its reverse reaction, i.e. the condensation of aldoses with pyruvate to form a wide range of 2-keto-3-deoxy-onic acids, including 2-keto-3-deoxy-nonulosonic acid, 2-keto-3-deoxy-octulosonic acid, 2-keto-3-deoxy-heptulosonic acid, and 2-keto-3-deoxy-hexulosonic acid. In particular, 3-deoxy-D-manno-2-octulosonic acid (D-KDO), a vital component of lipopolysaccharides found in the bacterial outer membrane may be synthesized from D-arabinose and pyruvate in 67% yield. Additionally, protected forms of the KDO aldolase products, e.g. hexaacetyl 2-keto-3-deoxy-nonulosonic acid and pentaacetyl 2-keto-3-deoxy-octulosonic acid, may be decarboxylated to form the corresponding 2-deoxy-aldoses, e.g. 2-deoxy-octulose and 2-deoxy-heptulose respectively.

  本文介绍了从Aureobacterium barkeri菌株KDO-37-2（ATCC 49977）中分离出的KDO aldolase（EC 4.1.2.23）。进一步揭示了KDO aldolase在反应方面具有广泛的底物特异性，即将醛糖与丙酮缩合形成各种2-酮基-3-去氧酸，包括2-酮基-3-去氧-非烯酸，2-酮基-3-去氧-八烯酸，2-酮基-3-去氧-庚烯酸和2-酮基-3-去氧-己烯酸。特别地，可以从D-阿拉伯糖和丙酮中合成3-去氧-D-曼诺-2-八烯酸（D-KDO），这是细菌外膜中发现的脂多糖的重要组成部分，产率为67％。此外，KDO aldolase产物的受保护形式，例如六乙酰基2-酮基-3-去氧-非烯酸和五乙酰基2-酮基-3-去氧-八烯酸，可以脱羧形成相应的2-去氧醛糖，例如2-去氧-八糖和2-去氧-庚糖，分别。