N⁶-benzoyl-2'-O-{2-[(N,N-dimethylamino)oxy]ethyl}adenosine | 212061-65-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: N⁶-benzoyl-2'-O-{2-[(N,N-dimethylamino)oxy]ethyl}adenosine
• 英文别名: N6-Benzoyl-2'-O-(dimethylaminooxyethyl)adenosine；N-[9-[(2R,3R,4R,5R)-3-[2-(dimethylaminooxy)ethoxy]-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]purin-6-yl]benzamide
• CAS: 212061-65-9
• 化学式: C₂₁H₂₆N₆O₆
• 分子量: 458.474
• InChiKey: LAUXQOBEYVJJRE-VGKBRBPRSA-N

物化性质

• 密度：
  1.49±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.5
• 重原子数：
  33
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.43
• 拓扑面积：
  144
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N⁶-benzoyl-2'-O-{2-[(N,N-dimethylamino)oxy]ethyl}adenosine 在 4-二甲氨基吡啶 、 二异丙基铵盐四氮唑 作用下， 以 吡啶 、 乙腈 为溶剂， 反应 12.0h， 生成 N⁶-benzoyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-{2-[(N,N-dimethylamino)oxy]ethyl}adenosine-3'-[(2-cyanoethyl)-N,N-diisopropyl]phosphoroamidite
  参考文献：
  名称：

  2'-O- [2-[（N，N-二甲基氨基）氧基]乙基]修饰的核苷和寡核苷酸的合成。

  摘要：

  已开发出一种通用的合成路线，用于合成2'-O- [2-[（N，N-二甲基氨基）氧基]乙基]（缩写为2'-O-DMAOE）修饰的嘌呤和嘧啶核苷及其相应的核苷亚磷酰胺和固体支持物。为了合成2'-O-DMAOE嘌呤核苷，通过将碳-碳键氧化裂解为相应的醛，从2'-O-烯丙基嘌呤核苷（13a和15）获得关键中间体B（方案1）通过减少。为了合成嘧啶核苷，用乙二醇的硼酸酯打开2,2'-脱水-5-甲基尿苷5，得到了关键的中间体B。将2'-O-（2-羟乙基）核苷进行了高产率的转化，通过区域选择性的Mitsunobu反应，形成相应的2'-O- [2-[（1,3-dihydro-1，3-二氧代-2H-异吲哚-2-基）氧基]乙基]核苷（18、19和20）。随后将这些化合物脱保护并转化为2'-O- [2-[（[亚甲基氨基）氧基]乙基]衍生物（22、23和24）。还原并用甲醛进行第二次还原胺化，得到相应的2'-O-

  DOI：

  10.1021/jo0103975
• 作为产物：
  描述：

  N-(9-{(2R,3R,4R,5R)-5-(tert-Butyl-diphenyl-silanyloxymethyl)-4-hydroxy-3-[2-(N-methyl-aminooxy)-ethoxy]-tetrahydro-furan-2-yl}-9H-purin-6-yl)-benzamide 在 triethylamine trihydrofluoride 、 4-甲基苯磺酸吡啶 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 水 为溶剂， 反应 24.0h， 生成 N⁶-benzoyl-2'-O-{2-[(N,N-dimethylamino)oxy]ethyl}adenosine
  参考文献：
  名称：

  2'-O- [2-[（N，N-二甲基氨基）氧基]乙基]修饰的核苷和寡核苷酸的合成。

  摘要：

  已开发出一种通用的合成路线，用于合成2'-O- [2-[（N，N-二甲基氨基）氧基]乙基]（缩写为2'-O-DMAOE）修饰的嘌呤和嘧啶核苷及其相应的核苷亚磷酰胺和固体支持物。为了合成2'-O-DMAOE嘌呤核苷，通过将碳-碳键氧化裂解为相应的醛，从2'-O-烯丙基嘌呤核苷（13a和15）获得关键中间体B（方案1）通过减少。为了合成嘧啶核苷，用乙二醇的硼酸酯打开2,2'-脱水-5-甲基尿苷5，得到了关键的中间体B。将2'-O-（2-羟乙基）核苷进行了高产率的转化，通过区域选择性的Mitsunobu反应，形成相应的2'-O- [2-[（1,3-dihydro-1，3-二氧代-2H-异吲哚-2-基）氧基]乙基]核苷（18、19和20）。随后将这些化合物脱保护并转化为2'-O- [2-[（[亚甲基氨基）氧基]乙基]衍生物（22、23和24）。还原并用甲醛进行第二次还原胺化，得到相应的2'-O-

  DOI：

  10.1021/jo0103975

文献信息

• Regioselective synthesis of 2′-O-modified nucleosides
  申请人：ISIS Pharmaceuticals, Inc.

  公开号：US06403779B1

  公开（公告）日：2002-06-11

  Methods for the regioselective alkylation at the 2′-hydroxy position over the 3′-hydroxy position of nucleosides and nucleoside analogs, forming 2′-O-ester modified compounds, are disclosed. Reduction and derivatization of the 2′-O-ester provides 2′-O-modified nucleosides and nucleoside analogs useful for the synthesis of oligomeric compounds having improved hybridization affinity and nuclease resistance.

  本发明揭示了在核苷和核苷类似物的2'-羟基位置上进行选择性烷基化而不是在3'-羟基位置上进行的方法，形成2'-O-酯修饰化合物。对2'-O-酯的还原和衍生化提供了对合成寡聚合物化合物具有改善的杂交亲和性和核酸酶抗性的2'-O-修饰核苷和核苷类似物。
• Regioselective synthesis of 2'-O-modified nucleosides
  申请人：——

  公开号：US20030078415A1

  公开（公告）日：2003-04-24

  Methods for the regioselective alkylation at the 2′-hydroxy position over the 3′-hydroxy position of nucleosides and nucleoside analogs, forming 2′-O-ester modified compounds, are disclosed. Reduction and derivatization of the 2′-O-ester provides 2′-O-modified nucleosides and nucleoside analogs useful for the synthesis of oligomeric compounds having improved hybridization affinity and nuclease resistance.

  本文揭示了在核苷和核苷类似物的2'-羟基位置上进行区域选择性烷基化的方法，而不是在3'-羟基位置上进行烷基化，形成2'-O-酯修饰化合物。对2'-O-酯的还原和衍生化提供了有用的2'-O-修饰核苷和核苷类似物，用于合成具有改善的杂交亲和力和核酸酶抵抗力的寡聚物化合物。
• US6403779B1
  申请人：——

  公开号：US6403779B1

  公开（公告）日：2002-06-11
• US6624294B2
  申请人：——

  公开号：US6624294B2

  公开（公告）日：2003-09-23
• US6639062B2
  申请人：——

  公开号：US6639062B2

  公开（公告）日：2003-10-28