methyl 2-deoxy-2-trifluoroacetamido-β-D-glucopyranoside | 40299-08-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: methyl 2-deoxy-2-trifluoroacetamido-β-D-glucopyranoside
• 英文别名: N-[(2R,3R,4R,5S,6R)-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)-2-methoxyoxan-3-yl]-2,2,2-trifluoroacetamide
• CAS: 40299-08-9
• 化学式: C₉H₁₄F₃NO₆
• 分子量: 289.208
• InChiKey: FCSFAAYDXNHLDC-NYMZXIIRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.9
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.89
• 拓扑面积：
  108
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl 2-deoxy-2-trifluoroacetamido-β-D-glucopyranoside 在 potassium carbonate 、 对甲苯磺酸 、 三乙胺 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 (4aR,6R,7R,8R,8aR)-6-Methoxy-2,2-dimethyl-8-triethylsilanyloxy-hexahydro-pyrano[3,2-d][1,3]dioxin-7-ylamine
  参考文献：
  名称：

  新型嵌合支架可扩展受体空间的探索：广泛筛选的混合β-d-葡萄糖-苯并二氮杂卓结构。酰胺烷基化对环化反应过程的影响

  摘要：

  设计，合成并功能化了新的分子平台，该平台是两个支架（β- d-葡萄糖和苯并二氮杂hybrid）的杂交体，每个支架都可以结合几种蛋白质，可以用作广泛生物学筛选的探针。在这里，我们描述了这些新型嵌合支架的合成和化学性质。尝试将官能化的类似物（-）- 96和（-）- 97环化，得到相应的二聚体（-）- 98和（-）- 99在各种反应条件下，甚至在浓度仅为0.001 N的情况下也是如此。考虑到影响酰胺键构象的因素及其对环化反应的影响，我们使酰胺键烷基化。如所预期的，N-甲基衍生物（-）- 110的环化仅提供了单分子环化产物（+）- 111。这些化合物现在才进行广泛的筛选，因此目前代表着“勘探库”。

  DOI：

  10.1021/jo0352068
• 作为产物：
  描述：

  methyl 3,4,6-tri-O-acetyl-2-deoxy-2-trifluoroacetamido-β-D-glucopyranoside 在 甲醇 、 sodium methylate 作用下， 生成 methyl 2-deoxy-2-trifluoroacetamido-β-D-glucopyranoside
  参考文献：
  名称：

  使用多重线性自由能关系探索糖苷水解酶O-GlcNAcase中两种催化策略之间的协同作用

  摘要：

  人类 O-GlcNAcase 在调节丝氨酸和苏氨酸残基与 β-O 连接的 N-乙酰氨基葡萄糖单糖单元 (O-GlcNAc) 的翻译后修饰方面发挥着重要作用。O-GlcNAcase 的机制涉及底物的 2-乙酰氨基基团的亲核参与以取代糖苷连接的离去基团。这种酶对底物结构变化的耐受性使我们能够使用几个系列的底物来表征 O-GlcNAcase 过渡态，以产生多个同时的自由能关系。观察到伴随亲核强度和离去基团能力变化的机制、过渡态和速率决定步骤的变化模式。观察到的机制变化反映了酶通酸和催化亲核试剂所起的作用。重要的是，这些结果说明了酶如何协同利用两种催化模式；许多小分子催化模型都没有的特征。这些研究还表明了氧代碳鎓离子中间体在 O-GlcNAcase 催化的氨基葡萄糖水解中的动力学意义，探索了使用酶过渡态结构的非原子研究可能学到的知识的局限性，并提供了关于保留超家族的一般见解糖苷水解酶作为有效的催化剂。

  DOI：

  10.1021/ja904506u

文献信息

• Stereoselective synthesis of [13C]methyl 2-[15N]amino-2-deoxy-β-d-glucopyranoside derivatives
  作者：Fabien P Boulineau、Alexander Wei

  DOI：10.1016/s0008-6215(01)00203-8

  日期：2001.9

  Efficient syntheses of three [13C]methyl 2-[15N]amino-2-deoxy-beta-D-glucopyranoside derivatives are described. Amination of the D-glucal with (saltmen)Mn(15N) proceeded with 11:1 stereoselectivity favoring the gluco configuration; subsequent methylation of the [15N]lactol using [13C]iodomethane and silver(I) oxide afforded the doubly labeled beta glucoside in high yield. This compound served as the

  描述了三种[13C]甲基2- [15N]氨基-2-脱氧-β-D-吡喃葡萄糖苷衍生物的有效合成。用（盐）Mn（15N）胺化D-葡萄糖时，其立体选择性为11：1，有利于葡萄糖的构型。随后，使用[13C]碘甲烷和氧化银（I）对[15N]内酯进行甲基化，可以高收率获得双标记的β糖苷。该化合物用作三种[13C]甲基2- [15N]氨基葡萄糖苷的常见前体：（2- [15N]三氟乙酰基-），（2- [15N]乙酰基-）和（2- [15N]叠氮基-） 。报告了选择的异核偶联常数。
• A Chemoenzymatic Approach to Glycopeptide Antibiotics
  作者：Hening Lin、Christopher T. Walsh

  DOI：10.1021/ja045147v

  日期：2004.11.1

  Many biologically active natural products are constrained by macrocyclization and modified with carbohydrates. These two types of modifications are essential for their biological activities. Here we report a chemoenzymatic approach to make carbohydrate-modified cyclic peptide antibiotics. Using a thioesterase domain from the decapeptide tyrocidine synthetase, 13 head-to-tail cyclized tyrocidine derivatives were obtained with one to three propargylglycines incorporated at positions 3-8. These cyclic peptides were then conjugated to 21 azido sugars via copper(I)-catalyzed cycloaddition. Antibacterial and hemolytic assays showed that the two best glycopeptides, Tyc4PG-14 and Tyc4PG-15, have a 6-fold better therapeutic index than the natural tyrocidine. We believe this method will also be useful for modifying other natural products to search for new therapeutics.
• Design and Synthesis of Novel Scaffolds for Drug Discovery:  Hybrids of β-<scp>d</scp>-Glucose with 1,2,3,4-Tetrahydrobenzo[<i>e</i>][1,4]diazepin-5-one, the Corresponding 1-Oxazepine, and 2- and 4-Pyridyldiazepines
  作者：Leïla Abrous、John Hynes、Sarah R. Friedrich、Amos B. Smith、Ralph Hirschmann

  DOI：10.1021/ol015698f

  日期：2001.4.1

  [GRAPHICS]We describe the syntheses of novel tricyclic scaffolds that incorporate a fusion of a substituted pyranose ring with the seven-membered rings of 1,2,3,4 tetrahydrobenzo[e][1,4]diazepin-5-one and the corresponding oxazepine and pyridyldiazepine to generate the benzodiazepines, and the related heterocycles. In each instance, the pyranose rings contain three protected hydroxyls, suitable for selective derivatization.
• Novel Chimeric Scaffolds to Extend the Exploration of Receptor Space:  Hybrid β-<scp>d</scp>-Glucose−Benzoheterodiazepine Structures for Broad Screening. Effect of Amide Alkylation on the Course of Cyclization Reactions
  作者：Leïla Abrous、Patrick A. Jokiel、Sarah R. Friedrich、John Hynes,、Amos B. Smith、Ralph Hirschmann

  DOI：10.1021/jo0352068

  日期：2004.1.1

  functionalized analogues (−)-96 and (−)-97 afforded the corresponding dimers (−)-98 and (−)-99, respectively, under a variety of reaction conditions, even at concentrations of only 0.001 N. Consideration of factors affecting the conformation of amide bonds and their effects on cyclization reactions led us to alkylate the amide bond. As expected, the cyclization of the N-methyl derivative (−)-110 afforded exclusively

  设计，合成并功能化了新的分子平台，该平台是两个支架（β- d-葡萄糖和苯并二氮杂hybrid）的杂交体，每个支架都可以结合几种蛋白质，可以用作广泛生物学筛选的探针。在这里，我们描述了这些新型嵌合支架的合成和化学性质。尝试将官能化的类似物（-）- 96和（-）- 97环化，得到相应的二聚体（-）- 98和（-）- 99在各种反应条件下，甚至在浓度仅为0.001 N的情况下也是如此。考虑到影响酰胺键构象的因素及其对环化反应的影响，我们使酰胺键烷基化。如所预期的，N-甲基衍生物（-）- 110的环化仅提供了单分子环化产物（+）- 111。这些化合物现在才进行广泛的筛选，因此目前代表着“勘探库”。
• Probing Synergy between Two Catalytic Strategies in the Glycoside Hydrolase <i>O</i>-GlcNAcase Using Multiple Linear Free Energy Relationships
  作者：Ian R. Greig、Matthew S. Macauley、Ian H. Williams、David J. Vocadlo

  DOI：10.1021/ja904506u

  日期：2009.9.23

  revealing changes in mechanism, transition state, and rate-determining step upon concomitant variation of both nucleophilic strength and leaving group abilities are observed. The observed changes in mechanism reflect the roles played by the enzymic general acid and the catalytic nucleophile. Significantly, these results illustrate how the enzyme synergistically harnesses both modes of catalysis; a feature that

  人类 O-GlcNAcase 在调节丝氨酸和苏氨酸残基与 β-O 连接的 N-乙酰氨基葡萄糖单糖单元 (O-GlcNAc) 的翻译后修饰方面发挥着重要作用。O-GlcNAcase 的机制涉及底物的 2-乙酰氨基基团的亲核参与以取代糖苷连接的离去基团。这种酶对底物结构变化的耐受性使我们能够使用几个系列的底物来表征 O-GlcNAcase 过渡态，以产生多个同时的自由能关系。观察到伴随亲核强度和离去基团能力变化的机制、过渡态和速率决定步骤的变化模式。观察到的机制变化反映了酶通酸和催化亲核试剂所起的作用。重要的是，这些结果说明了酶如何协同利用两种催化模式；许多小分子催化模型都没有的特征。这些研究还表明了氧代碳鎓离子中间体在 O-GlcNAcase 催化的氨基葡萄糖水解中的动力学意义，探索了使用酶过渡态结构的非原子研究可能学到的知识的局限性，并提供了关于保留超家族的一般见解糖苷水解酶作为有效的催化剂。