(2R,3R,4R,5R)-2-(6-amino-9H-purin-9-yl)-5-(((tert-butyldimethylsilyl)oxy)methyl)-4-((pivaloyloxy)methoxy)tetrahydrofuran-3-yl 4-oxopentanoate | 1259402-49-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: (2R,3R,4R,5R)-2-(6-amino-9H-purin-9-yl)-5-(((tert-butyldimethylsilyl)oxy)methyl)-4-((pivaloyloxy)methoxy)tetrahydrofuran-3-yl 4-oxopentanoate
• CAS: 1259402-49-7
• 化学式: C₂₇H₄₃N₅O₈Si
• 分子量: 593.753
• InChiKey: IXDPVZRVKTYELW-FGSUIDRYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.54
• 重原子数：
  41.0
• 可旋转键数：
  11.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.7
• 拓扑面积：
  166.98
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  13.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2R,3R,4R,5R)-2-(6-amino-9H-purin-9-yl)-5-(((tert-butyldimethylsilyl)oxy)methyl)-4-((pivaloyloxy)methoxy)tetrahydrofuran-3-yl 4-oxopentanoate 在 吡啶 、 一水合肼 、 溶剂黄146 、 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 8.5h， 生成 2'-O-[bis(diethylamino)phosphanyl]-5'-O-[(tert-butyl)(dimethyl)silyl]-3'-O-{[(2,2-dimethylpropanoyl)oxy]methyl}-N6-[(4-methoxyphenyl)(diphenyl)methyl]adenosine
  参考文献：
  名称：

  可生物降解保护的二核苷酸2'，5'-单磷酸酯的合成和酶促脱保护：3'-O-（酰氧基甲基）腺苷基-2'，5'-的3-（乙酰氧基）-2,2-双（乙氧基羰基）丙基磷酸酯腺苷。

  摘要：

  迈向针对短寡核糖核苷酸（例如2-5A及其同类物）的可行前药策略的第一步，是在末端带有3-（乙酰氧基）-2,2-双（乙氧基羰基）丙基的腺苷基2'，5'-腺苷制备磷酸酯部分，并制备2'-连接核苷的（乙酰氧基）甲基或（新戊酰氧基）甲基保护的3'-OH基。已经研究了通过猪肝脏羧酯酶在pH 7.5和37°下用酶触发的方法去除这些保护基。事实证明，（乙酰氧基）甲基对于3'-O-保护来说太不稳定了，它的去除速度比磷酸酯保护基要快，这导致2'，5'-到3'，5'-异构化。核苷间磷酸酯键。另外，原料意外地转化为5'-O-乙酰化衍生物。（新戊酰氧基）甲基似乎更适合该目的。完全脱保护的2'，5'-ApA作为主要产物积累，尽管即使在这种情况下，也会发生原料的异构化。

  DOI：

  10.1002/cbdv.201000288
• 作为产物：
  描述：

  5'-O,N⁶-bis(4-methoxytrityl)-3'-O-[(pivaloyloxy)methyl]adenosine 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 水 、 溶剂黄146 作用下， 反应 5.0h， 生成 (2R,3R,4R,5R)-2-(6-amino-9H-purin-9-yl)-5-(((tert-butyldimethylsilyl)oxy)methyl)-4-((pivaloyloxy)methoxy)tetrahydrofuran-3-yl 4-oxopentanoate
  参考文献：
  名称：

  可生物降解保护的二核苷酸2'，5'-单磷酸酯的合成和酶促脱保护：3'-O-（酰氧基甲基）腺苷基-2'，5'-的3-（乙酰氧基）-2,2-双（乙氧基羰基）丙基磷酸酯腺苷。

  摘要：

  迈向针对短寡核糖核苷酸（例如2-5A及其同类物）的可行前药策略的第一步，是在末端带有3-（乙酰氧基）-2,2-双（乙氧基羰基）丙基的腺苷基2'，5'-腺苷制备磷酸酯部分，并制备2'-连接核苷的（乙酰氧基）甲基或（新戊酰氧基）甲基保护的3'-OH基。已经研究了通过猪肝脏羧酯酶在pH 7.5和37°下用酶触发的方法去除这些保护基。事实证明，（乙酰氧基）甲基对于3'-O-保护来说太不稳定了，它的去除速度比磷酸酯保护基要快，这导致2'，5'-到3'，5'-异构化。核苷间磷酸酯键。另外，原料意外地转化为5'-O-乙酰化衍生物。（新戊酰氧基）甲基似乎更适合该目的。完全脱保护的2'，5'-ApA作为主要产物积累，尽管即使在这种情况下，也会发生原料的异构化。

  DOI：

  10.1002/cbdv.201000288