[(2R,4S,5S)-5-(N-Boc-amino)-4-[(tert-butyldimethylsilyl)oxy]-2,7-dimethyloctanoyl] N'-isobutyl amide | 937799-86-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: [(2R,4S,5S)-5-(N-Boc-amino)-4-[(tert-butyldimethylsilyl)oxy]-2,7-dimethyloctanoyl] N'-isobutyl amide
• 英文别名: tert-butyl N-[(4S,5S,7R)-5-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-2,7-dimethyl-8-(2-methylpropylamino)-8-oxooctan-4-yl]carbamate
• CAS: 937799-86-5
• 化学式: C₂₅H₅₂N₂O₄Si
• 分子量: 472.784
• InChiKey: XMZQBGQYSUJLCE-HKBOAZHASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.11
• 重原子数：
  32
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.92
• 拓扑面积：
  76.7
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  [(2R,4S,5S)-5-(N-Boc-amino)-4-[(tert-butyldimethylsilyl)oxy]-2,7-dimethyloctanoyl] N'-isobutyl amide 在 N-甲基吗啉 、 四丁基氟化铵 、 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 36.5h， 生成 [(2R,4S,5S)-5-(N-Boc-L-phenylalanylamido)-4-hydroxy-2,7-dimethyloctanoyl] N'-isobutyl amide
  参考文献：
  名称：

  含羟基乙烯二肽等排体的β-分泌酶抑制剂的合成

  摘要：

  摘要 近年来，具有 Leu*Ala 羟基乙烯二肽 (HED) 等排体的 β-分泌酶抑制剂一直是一个特别有趣的话题。本研究合成了模板化合物17，其P2'位置截断，P2和P3发生变化，与其他报道的强效抑制剂不同。目的是探索最佳反应条件并构建抑制剂库以研究理想的蛋白质-底物相互作用。

  DOI：

  10.1080/00397910600977509
• 作为产物：
  描述：

  (S)-5-tert-Butoxycarbonylamino-4-hydroxy-7-methyl-octanoic acid ethyl ester 在 N-甲基吗啉 、 咪唑 、 lithium hydroxide 、 1-羟基苯并三唑 、 溶剂黄146 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 lithium hexamethyldisilazane 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 为溶剂， 反应 64.58h， 生成 [(2R,4S,5S)-5-(N-Boc-amino)-4-[(tert-butyldimethylsilyl)oxy]-2,7-dimethyloctanoyl] N'-isobutyl amide
  参考文献：
  名称：

  含羟基乙烯二肽等排体的β-分泌酶抑制剂的合成

  摘要：

  摘要 近年来，具有 Leu*Ala 羟基乙烯二肽 (HED) 等排体的 β-分泌酶抑制剂一直是一个特别有趣的话题。本研究合成了模板化合物17，其P2'位置截断，P2和P3发生变化，与其他报道的强效抑制剂不同。目的是探索最佳反应条件并构建抑制剂库以研究理想的蛋白质-底物相互作用。

  DOI：

  10.1080/00397910600977509

文献信息

• Synthesis and preliminary evaluation of peptidomimetic inhibitors of human β-secretase
  作者：Yan Niu、Yuehua Wang、Xiaomin Zou、Xiaoming Yang、Chao Ma、Yang Lü、Bo Zhou、Yue Yuan、Guanhua Du、Ping Xu

  DOI：10.1016/j.ejmech.2010.01.044

  日期：2010.5

  Based on the structure of OM99-2 and the X-ray crystal structure of its complex with beta-secretase, a series of compounds containing the Leu*Ala hydroxyethylene isostere as a scissile bond substitution were designed. 31 compounds were synthesized and their beta-secretase inhibition activities were measured. It was found that isobutyl group was a better R(3) substitution as C-terminus in our target compounds, and 4-nitrobenzyl group was the best R(2) side chain. With the aid of molecular modeling, the binding modes of compounds 9 and 22 with beta-secretase were compared. The result revealed a stronger bonding mode of 22 than 9. This explored that the optimal length of this series of peptidomimetic inhibitors was P3-P2'. The molecular weights of compounds with this length are around 600. (C) 2010 Elsevier Masson SAS. All rights reserved.