7-[(S)-1-(4-iodo-5-methoxy-2-nitrophenyl)-2,2-dimethylpropyloxy]methyl-7-deaza-2’-deoxyadenosine | 1427311-54-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: 7-[(S)-1-(4-iodo-5-methoxy-2-nitrophenyl)-2,2-dimethylpropyloxy]methyl-7-deaza-2’-deoxyadenosine
• CAS: 1427311-54-3
• 化学式: C₂₄H₃₀IN₅O₇
• 分子量: 627.436
• InChiKey: ISIYBQNHPCVRNR-HKJQZYRSSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.48
• 重原子数：
  37.0
• 可旋转键数：
  8.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  168.02
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  11.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  7-[(S)-1-(4-iodo-5-methoxy-2-nitrophenyl)-2,2-dimethylpropyloxy]methyl-7-deaza-2’-deoxyadenosine 在 2,4,6-三甲基吡啶 、 三氯硫磷 、 ammonium hydroxide 、 copper(l) iodide 、 四(三苯基膦)钯 、 磷酸三乙酯 、 三乙胺 作用下， 以 水 、 二甲基亚砜 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 28.03h， 生成 5-[3-[4-[(1S)-1-[[4-amino-7-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-[[hydroxy-[hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxyphosphinothioyl]oxymethyl]oxolan-2-yl]pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-5-yl]methoxy]-2,2-dimethylpropyl]-2-methoxy-5-nitrophenyl]prop-2-ynylcarbamoyl]-2-(3-amino-6-imino-4,5-disulfoxanthen-9-yl)benzoic acid
  参考文献：
  名称：

  [EN] 5-METHOXY. 3'-OH UNBLOCKED, FAST PHOTOCLEAVABLE TERMINATING NUCLEOTIDES AND METHODS FOR NUCLEIC ACID SEQUENCING
  [FR] 5-MÉTHOXY-NUCLÉOTIDES À TERMINAISON RAPIDEMENT PHOTOCLIVABLE NON BLOQUÉS EN 3'OH ET PROCÉDÉS DE SÉQUENÇAGE D'ACIDE NUCLÉIQUE

  摘要：

  本发明通常涉及用于DNA和RNA测序和分析方法及系统中的3'-OH未阻断核苷酸和核苷的标记和未标记的5-甲氧基取代硝基苯基光致裂解终止基团。这些化合物可用作可逆终止剂，因为它们表现出快速的核苷酸结合动力学、单碱基终止、高核苷酸选择性和快速的终止基团裂解，导致自然发生的核苷酸。

  公开号：

  WO2013040257A1
• 作为产物：
  描述：

  9-(β-D-2'-deoxyribofuranosyl)-6-chloro-7-iodo-7-deazapurine 在 吡啶 、 咪唑 、 4-二甲氨基吡啶 、 锂硼氢 、 cis-dichlorobis(benzonitrile)palladium(II) 、 四丁基氟化铵 、 氨 、 三乙胺 、 对甲苯磺酰氯 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 119.67h， 生成 7-[(S)-1-(4-iodo-5-methoxy-2-nitrophenyl)-2,2-dimethylpropyloxy]methyl-7-deaza-2’-deoxyadenosine
  参考文献：
  名称：

  [EN] 5-METHOXY. 3'-OH UNBLOCKED, FAST PHOTOCLEAVABLE TERMINATING NUCLEOTIDES AND METHODS FOR NUCLEIC ACID SEQUENCING
  [FR] 5-MÉTHOXY-NUCLÉOTIDES À TERMINAISON RAPIDEMENT PHOTOCLIVABLE NON BLOQUÉS EN 3'OH ET PROCÉDÉS DE SÉQUENÇAGE D'ACIDE NUCLÉIQUE

  摘要：

  本发明通常涉及用于DNA和RNA测序和分析方法及系统中的3'-OH未阻断核苷酸和核苷的标记和未标记的5-甲氧基取代硝基苯基光致裂解终止基团。这些化合物可用作可逆终止剂，因为它们表现出快速的核苷酸结合动力学、单碱基终止、高核苷酸选择性和快速的终止基团裂解，导致自然发生的核苷酸。

  公开号：

  WO2013040257A1