3-methyl 1-(2,2,2-trichloroethyl) 4-(((S)-sec-butyl)carbamoyl)pyrrolidine-1,3-dicarboxylate | 1313289-00-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: 3-methyl 1-(2,2,2-trichloroethyl) 4-(((S)-sec-butyl)carbamoyl)pyrrolidine-1,3-dicarboxylate
• CAS: 1313289-00-7
• 化学式: C₁₄H₂₁Cl₃N₂O₅
• 分子量: 403.69
• InChiKey: YVTAVENSUNFWLD-IDKOKCKLSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.13
• 重原子数：
  24.0
• 可旋转键数：
  5.0
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.79
• 拓扑面积：
  84.94
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  5.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-methyl 1-(2,2,2-trichloroethyl) 4-(((S)-sec-butyl)carbamoyl)pyrrolidine-1,3-dicarboxylate 在 lithium hydroxide monohydrate 、 盐酸 作用下， 以 水 、 叔丁醇 为溶剂， 生成
  参考文献：
  名称：

  靶向蛋白质-蛋白质和肽-受体相互作用的 β-Turn 模拟文库的设计、合成和验证

  摘要：

  描述了作为小分子库的关键组成部分的 β 转角模拟库的设计和合成，该库针对涉及蛋白质-蛋白质相互作用的主要识别基序。对蛋白质数据库 (PDB) 中 10,245 个 β-转角的几何特征分析表明，反式-吡咯烷-3,4-二甲酰胺可作为有效且可合成的文库模板。这通过最初针对一系列识别内源性配体中的 β-转角结构的肽激活 GPCR 筛选选定化合物而得到证实。这项验证研究通过对 κ-阿片受体 (KOR) 具有高亲和力的非碱性和碱性小分子（分别为 K(i) = 390 和 23 nM）的鉴定而得到强调。与合作者的筛选能力一致并经过设计验证，完整的文库被组装为 20 种化合物的 210 种混合物，提供总共 4200 种化合物，旨在模拟天然存在的 β-转角中 4 个残基中的 3 个的所有可能排列. 独特的设计，并且由于模板的 C(2) 对称性，典型的 20 × 20 × 20 混合物（8000 种化合物制备为

  DOI：

  10.1021/ja201878v
• 作为产物：
  描述：

  3-benzyl 4-methyl trans-1-benzylpyrrolidine-3,4-dicarboxylate 在 2,6-二甲基吡啶 、 N-羟基-7-氮杂苯并三氮唑 、 20 % Pd(OH)2/C 、 氢气 、 碳酸氢钠 、 sodium carbonate 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 16.0h， 生成 3-methyl 1-(2,2,2-trichloroethyl) 4-(((S)-sec-butyl)carbamoyl)pyrrolidine-1,3-dicarboxylate
  参考文献：
  名称：

  靶向蛋白质-蛋白质和肽-受体相互作用的 β-Turn 模拟文库的设计、合成和验证

  摘要：

  描述了作为小分子库的关键组成部分的 β 转角模拟库的设计和合成，该库针对涉及蛋白质-蛋白质相互作用的主要识别基序。对蛋白质数据库 (PDB) 中 10,245 个 β-转角的几何特征分析表明，反式-吡咯烷-3,4-二甲酰胺可作为有效且可合成的文库模板。这通过最初针对一系列识别内源性配体中的 β-转角结构的肽激活 GPCR 筛选选定化合物而得到证实。这项验证研究通过对 κ-阿片受体 (KOR) 具有高亲和力的非碱性和碱性小分子（分别为 K(i) = 390 和 23 nM）的鉴定而得到强调。与合作者的筛选能力一致并经过设计验证，完整的文库被组装为 20 种化合物的 210 种混合物，提供总共 4200 种化合物，旨在模拟天然存在的 β-转角中 4 个残基中的 3 个的所有可能排列. 独特的设计，并且由于模板的 C(2) 对称性，典型的 20 × 20 × 20 混合物（8000 种化合物制备为

  DOI：

  10.1021/ja201878v

文献信息

• Small molecule peptidomimetic inhibitors of importin α/β mediated nuclear transport
  作者：Géza Ambrus、Landon R. Whitby、Eric L. Singer、Oleg Trott、Euna Choi、Arthur J. Olson、Dale L. Boger、Larry Gerace

  DOI：10.1016/j.bmc.2010.08.038

  日期：2010.11

  Nucleocytoplasmic transport of macromolecules is a fundamental process of eukaryotic cells. Translocation of proteins and many RNAs between the nucleus and cytoplasm is carried out by shuttling receptors of the beta-karyopherin family, also called importins and exportins. Leptomycin B, a small molecule inhibitor of the exportin CRM1, has proved to be an invaluable tool for cell biologists, but up to now no small molecule inhibitors of nuclear import have been described. We devised a microtiter plate based permeabilized cell screen for small molecule inhibitors of the importin alpha/beta pathway. By analyzing peptidomimetic libraries, we identified beta-turn and alpha-helix peptidomimetic compounds that selectively inhibit nuclear import by importin alpha/beta but not by transportin. Structure-activity relationship analysis showed that large aromatic residues and/or a histidine side chain are required for effective import inhibition by these compounds. Our validated inhibitors can be useful for in vitro studies of nuclear import, and can also provide a framework for synthesis of higher potency nuclear import inhibitors. (C) 2010 Elsevier Ltd. All rights reserved.