burkholdac B | 1278522-67-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 肽模拟物
• 英文名称: burkholdac B
• 英文别名: Thailandepsin A；(1S,5S,6R,9S,15E,20R)-6-[(2S)-butan-2-yl]-5-hydroxy-20-(2-methylsulfanylethyl)-2-oxa-11,12-dithia-7,19,22-triazabicyclo[7.7.6]docos-15-ene-3,8,18,21-tetrone
• CAS: 1278522-67-0
• 化学式: C₂₃H₃₇N₃O₆S₃
• 分子量: 547.761
• InChiKey: VJXBYUITQBTTQM-DSRNDQRRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.4
• 重原子数：
  35
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.74
• 拓扑面积：
  210
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  D-methionine methyl ester 在 吗啉 、 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 四(三苯基膦)钯 、 N-羟基-7-氮杂苯并三氮唑 、 2-甲基-6-硝基苯甲酸酐 、 benzotriazol-1-yloxyl-tris-(pyrrolidino)-phosphonium hexafluorophosphate 、 碘 、 氟化氢吡啶 、 N,N-二异丙基乙胺 、 2,3-二氯-5,6-二氰基-1,4-苯醌 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 、 lithium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 40.83h， 生成 burkholdac B
  参考文献：
  名称：

  burkholdacs A和B和5,6,20-tri- epi -burkholdac A的总合成：HDAC抑制作用和抗增殖活性

  摘要：

  双环二肽组蛋白去乙酰化酶（HDAC）抑制剂burkholdacs A和B以高度收敛和统一的方式高效合成。合成功能的酰胺耦合d -valine- d -cysteine-或d -异体-isoleucine- d段与含半胱氨酸- d含蛋氨酸片段直接装配相应的开环-acids，用于macrolactonization关键前体。使用同样的方法，5,6,20三-外延还合成了-burkholdacA。合成的双肽肽的HDAC抑制试验和细胞生长抑制分析表明，与临床批准的双肽肽FK228（romidepsin）相比，这类双环双肽肽的效价顺序更高。还揭示了这类化合物中的新型结构-活性关系。

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2014.02.044

文献信息

• Total synthesis of burkholdacs A and B and 5,6,20-tri-epi-burkholdac A: HDAC inhibition and antiproliferative activity
  作者：Yurie Fukui、Koichi Narita、Singo Dan、Takao Yamori、Akihiro Ito、Minoru Yoshida、Tadashi Katoh

  DOI：10.1016/j.ejmech.2014.02.044

  日期：2014.4

  The bicyclic depsipeptide histone deacetylase (HDAC) inhibitors burkholdacs A and B were efficiently synthesized in a highly convergent and unified manner. The synthesis features the amide coupling of a d-valine-d-cysteine- or d-allo-isoleucine-d-cysteine-containing segment with a d-methionine-containing segment to directly assemble the corresponding seco-acids, key precursors for macrolactonization

  双环二肽组蛋白去乙酰化酶（HDAC）抑制剂burkholdacs A和B以高度收敛和统一的方式高效合成。合成功能的酰胺耦合d -valine- d -cysteine-或d -异体-isoleucine- d段与含半胱氨酸- d含蛋氨酸片段直接装配相应的开环-acids，用于macrolactonization关键前体。使用同样的方法，5,6,20三-外延还合成了-burkholdacA。合成的双肽肽的HDAC抑制试验和细胞生长抑制分析表明，与临床批准的双肽肽FK228（romidepsin）相比，这类双环双肽肽的效价顺序更高。还揭示了这类化合物中的新型结构-活性关系。