2-(3-丁炔基氮二丙啶-3-基)乙酸 | 2049109-24-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 中文名称: 2-(3-丁炔基氮二丙啶-3-基)乙酸
• 英文名称: 2-(3-(but-3-yn-1-yl)-3H-diazirin-3-yl)acetic acid
• 英文别名: 2-(3-but-3-ynyldiazirin-3-yl)acetic acid
• CAS: 2049109-24-0
• 化学式: C₇H₈N₂O₂
• 分子量: 152.153
• InChiKey: TWWYBNRREWIKHQ-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.6
• 重原子数：
  11
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.57
• 拓扑面积：
  62
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

安全信息

• 包装等级：
  II
• 危险类别：
  3,8
• 危险性防范说明：
  P210,P240,P242,P243,P264,P271,P280,P301+P330+P331,P303+P361+P353,P304+P340,P305+P351+P338,P310,P363,P370+P378,P403+P233,P501
• 危险品运输编号：
  2924
• 危险性描述：
  H226,H314

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-(3-丁炔基氮二丙啶-3-基)乙酸 在 四氢呋喃 、 magnesium sulfate 、 1-丙基磷酸酐 、 N,N-二异丙基乙胺 、 manganese(ll) chloride 、 三氯氧磷 作用下， 以 四氢呋喃 、 formamide 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 叔丁醇 为溶剂， 反应 3.08h， 生成
  参考文献：
  名称：

  [EN] A PLATFORM FOR SCREENING NAD+ BINDING PROTEINS IN A CELLULAR CONTEXT
  [FR] PLATE-FORME PERMETTANT DE CRIBLER DES PROTÉINES DE LIAISON NAD+ DANS UN CONTEXTE CELLULAIRE

  摘要：

  本文提供了一些新型化合物、组合物，可用作可点击的、光亲和标记（PAL）探针，用于筛选与NAD+结合的蛋白质的方法。

  公开号：

  WO2021262548A1
• 作为产物：
  描述：

  2-(3-(but-3-ynyl)diaziridin-3-yl)ethanol 在 Jones reagent 、 碘 、 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 丙酮 为溶剂， 生成 2-(3-丁炔基氮二丙啶-3-基)乙酸
  参考文献：
  名称：

  磷黄酮 A 靶向 ATP 合酶

  摘要：

  一种新的 ATP 合成酶抑制剂：通过光亲和标记和化学蛋白质组学分析，发现并随后验证了磷黄酮 A 是 ATP 合成酶的抑制剂。这一发现可能会激发针对 ATP 合酶 β 亚基的新型抑制剂的设计。

  DOI：

  10.1002/chem.202202397

文献信息

• Photochemical Probe Identification of a Small‐Molecule Inhibitor Binding Site in Hedgehog Acyltransferase (HHAT)**
  作者：Thomas Lanyon‐Hogg、Markus Ritzefeld、Leran Zhang、Sebastian A. Andrei、Balazs Pogranyi、Milon Mondal、Lea Sefer、Callum D. Johnston、Claire E. Coupland、Jake L. Greenfield、Joshua Newington、Matthew J. Fuchter、Anthony I. Magee、Christian Siebold、Edward W. Tate

  DOI：10.1002/anie.202014457

  日期：2021.6.7

  sensing. MBOATs are attractive drug targets in cancer and obesity; however, information on the binding site and molecular mechanisms underlying small-molecule inhibition is elusive. This study reports rational development of a photochemical probe to interrogate a novel small-molecule inhibitor binding site in the human MBOAT Hedgehog acyltransferase (HHAT). Structure-activity relationship investigation

  哺乳动物膜结合O-酰基转移酶 (MBOAT) 超家族参与生长、发育和食欲感知等生物过程。 MBOAT 是治疗癌症和肥胖症的有吸引力的药物靶点；然而，有关小分子抑制的结合位点和分子机制的信息尚不清楚。本研究报告了一种光化学探针的合理开发，用于探究人 MBOAT Hedgehog 酰基转移酶 (HHAT) 中的新型小分子抑制剂结合位点。构效关系研究确定了单一对映体IMP-1575 （迄今为止报道的最有效的 HHAT 抑制剂），并指导设计了保持 HHAT 抑制效力的光交联探针。 HHAT 的光交联和蛋白质组测序鉴定了哺乳动物 MBOAT 中的第一个小分子结合位点。拓扑和同源性数据表明了 HHAT 抑制的潜在机制，并通过动力学分析得到了证实。我们的结果提供了最佳的 HHAT 工具抑制剂IMP-1575 ( K i = 38 nM) 和绘制 MBOAT 中小分子相互作用位点的策略。
• Chemical proteomics reveals ligustilide targets SMAD3, inhibiting collagen synthesis in aortic endothelial cells
  作者：Wei Lei、Fukui Shen、Nianwei Chang、Lin Niu、Yuanyuan Hou、Boli Zhang、Min Jiang、Gang Bai

  DOI：10.1016/j.cclet.2020.10.049

  日期：2021.1

  In this paper, we designed a Lig-derived photoaffinity labelling (PAL) probe to identify potential therapeutic targets of Lig via chemical proteomics approach. Mothers against decapentaplegic homologue 3 (SMAD3), a signal transmitter of transforming growth factor-β (TGF-β) which promotes the development of vascular fibrosis, was identified as a potential target of Lig. Lig suppressed the phosphorylation

  摘要动脉粥样硬化是一种持续的炎症状态，而血管内皮纤维化是动脉粥样硬化发展的主要原因之一。尽管在先前的研究中显示川gust嗪（Lig）具有明显的抗动脉粥样硬化作用，但其确切机制尚未得到深入讨论。在本文中，我们设计了Lig衍生的光亲和标记（PAL）探针，以通过化学蛋白质组学方法鉴定Lig的潜在治疗靶标。抵抗十足功能障碍同系物3（SMAD3）的母亲被确定为Lig的潜在靶点，SMAD3是促进血管纤维化发展的转化生长因子-β（TGF-β）的信号传递者。Lig通过阻止SMAD3与TGF-β受体1之间的相互作用来抑制SMAD3的磷酸化和核易位，从而抑制胶原蛋白的合成过程。因此，开发新型SMAD3抑制剂可能为预防血管纤维化提供有前途的治疗选择。
• Development of Photolenalidomide for Cellular Target Identification
  作者：Zhi Lin、Yuka Amako、Farah Kabir、Hope A. Flaxman、Bogdan Budnik、Christina M. Woo

  DOI：10.1021/jacs.1c11920

  日期：2022.1.12

  of cereblon (CRBN), a substrate receptor for the CRL4 E3 ubiquitin ligase. Here, we report the development of photolenalidomide (pLen), a Len probe with a photoaffinity label and enrichment handle, designed for target identification by chemical proteomics. pLen preserves the substrate degradation profile, phenotypic antiproliferative and immunomodulatory properties of Len, and enhances interactions

  沙利度胺类似物来那度胺 (Len) 是一种临床治疗药物，可改变 cereblon (CRBN) 的底物接合，CRBN 是 CRL4 E3 泛素连接酶的底物受体。在此，我们报告了光来那度胺 (pLen) 的开发，这是一种带有光亲和标签和富集手柄的 Len 探针，旨在通过化学蛋白质组学进行靶标识别。 pLen 保留了 Len 的底物降解特征、表型抗增殖和免疫调节特性，并增强了与 CRBN 沙利度胺结合域的相互作用，如结合位点作图和分子建模所揭示的。使用 pLen，我们从多发性骨髓瘤 MM.1S 细胞中捕获了已知靶标 IKZF1 和 CRBN，并进一步从 HEK293T 细胞中鉴定了一个新靶标，即真核翻译起始因子 3 亚基 i (eIF3i)。 eIF3i 直接被 pLen 标记，并在 Len 存在的情况下在多个上皮细胞系中与 CRBN 形成三元复合物，但其本身不被泛素化或降解。这些数据表明存在由
• Cell- and Tissue-Based Proteome Profiling and Dual Imaging of Apoptosis Markers with Probes Derived from Venetoclax and Idasanutlin
  作者：Dongsheng Zhu、Haijun Guo、Yu Chang、Yun Ni、Lin Li、Zhi-Min Zhang、Piliang Hao、Yong Xu、Ke Ding、Zhengqiu Li

  DOI：10.1002/anie.201802003

  日期：2018.7.20

  relationships of their protein targets, competitive affinity‐based proteome profiling coupled with bioimaging was employed to characterize their protein targets in the same cancer cell line and tumor tissue. A series of protein hits, including ITPR1, GSR, RER1, PDIA3, Apoa1, and Tnfrsf17 were simultaneously identified by pull‐down/LC–MS/MS with the two sets of affinity‐based probes. Dual imaging was successfully

  Venetoclax（ABT-199）和idasanutlin（RG7388）是有效的抗癌药物，分别靶向两种重要的凋亡标记物Bcl-2和MDM2。最近的研究表明，在体外和体内，这两种药物的组合可显着提高抗癌功效。为了揭示其蛋白质靶标之间的关系，采用了基于竞争亲和力的蛋白质组图谱与生物成像相结合的方法来表征其在同一癌细胞系和肿瘤组织中的蛋白质靶标。使用两组基于亲和力的探针同时通过下拉/ LC-MS / MS同时鉴定了一系列蛋白质命中，包括ITPR1，GSR，RER1，PDIA3，Apoa1和Tnfrsf17。成功地进行了双重成像，同时检测了各种癌细胞中的Bcl-2和MDM2表达。
• Induction of Lysosome Membrane Permeabilization as a Therapeutic Strategy to Target Pancreatic Cancer Stem Cells
  作者：Timothy P. Cash、Sonia Alcalá、María del Rosario Rico-Ferreira、Elena Hernández-Encinas、Jennifer García、María Isabel Albarrán、Sandra Valle、Javier Muñoz、Sonia Martínez-González、Carmen Blanco-Aparicio、Joaquín Pastor、Manuel Serrano、Bruno Sainz

  DOI：10.3390/cancers12071790

  日期：——

  Despite significant efforts to improve pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) clinical outcomes, overall survival remains dismal. The poor response to current therapies is partly due to the existence of pancreatic cancer stem cells (PaCSCs), which are efficient drivers of PDAC tumorigenesis, metastasis and relapse. To find new therapeutic agents that could efficiently kill PaCSCs, we screened a chemical library of 680 compounds for candidate small molecules with anti-CSC activity, and identified two compounds of a specific chemical series with potent activity in vitro and in vivo against patient-derived xenograft (PDX) cultures. The anti-CSC mechanism of action of this specific chemical series was found to rely on induction of lysosomal membrane permeabilization (LMP), which is likely associated with the increased lysosomal mass observed in PaCSCs. Using the well characterized LMP-inducer siramesine as a tool molecule, we show elimination of the PaCSC population in mice implanted with tumors from two PDX models. Collectively, our approach identified lysosomal disruption as a promising anti-CSC therapeutic strategy for PDAC.

  尽管已经做出了重大努力改善胰腺导管腺癌（PDAC）的临床结果，但总体生存率仍然令人沮丧。目前治疗的效果不佳部分原因是由于胰腺癌干细胞（PaCSCs）的存在，它们是PDAC肿瘤发生、转移和复发的高效驱动因子。为了寻找可以有效杀灭PaCSCs的新治疗药物，我们筛选了一个包含680种化合物的化学库，找到了两种特定化学系列的化合物，对患者来源的异种移植（PDX）培养物在体内外表现出强大的抗-CSC活性。这种特定化学系列的抗-CSC作用机制被发现依赖于诱导溶酶体膜通透性（LMP），这可能与PaCSCs中观察到的溶酶体质量增加有关。利用已经确定的LMP诱导剂siramesine作为工具分子，我们展示了在携带来自两个PDX模型肿瘤的小鼠中消除PaCSC种群。总的来说，我们的方法确定了溶酶体破坏作为一种有前途的PDAC抗-CSC治疗策略。