4-(3-(1-methyl-4-(1-methyl-4-nitropyrrole-2-carboxamido)pyrrole-2-carboxamido)propyl)morpholine | 299974-87-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: 4-(3-(1-methyl-4-(1-methyl-4-nitropyrrole-2-carboxamido)pyrrole-2-carboxamido)propyl)morpholine
• CAS: 299974-87-1
• 化学式: C₁₉H₂₆N₆O₅
• 分子量: 418.453
• InChiKey: PFFVAJISDSGDNK-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.98
• 重原子数：
  30.0
• 可旋转键数：
  8.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.47
• 拓扑面积：
  123.67
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  8.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-(3-(1-methyl-4-(1-methyl-4-nitropyrrole-2-carboxamido)pyrrole-2-carboxamido)propyl)morpholine 在 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 、 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 1-methyl-4-(1-methyl-4-(3-(p-tolylthio)propanamido)-1H-pyrrole-2-carboxamido)-N-(3-morpholinopropyl)-1H-pyrrole-2-carboxamide TFA salt
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and Evaluation of Novel DNA Minor Groove Binders as Antiamoebic Agents

  摘要：

  自由生活的阿米巴原虫 Acanthamoeba castellanii 是造成中枢神经感染肉芽肿阿米巴脑炎和危及视力感染 Acanthamoeba 角膜炎的罪魁祸首。此外，目前还没有有效的治疗方法，只能采用联合药物治疗。本研究合成了 12 种 DNA 小沟结合剂（MGBs），并通过阿米巴杀灭试验、阿米巴囊肿形成试验、阿米巴外囊形成试验和细胞致病性试验测试其抗阿米巴活性。结果发现，在杀阿米巴试验中，化合物 MGB3、MGB6、MGB22、MGB24 和 MGB16 能显著降低阿米巴的存活率，分别为 76.20%、59.45%、66.5%、39.32% 和 43.21%。此外，化合物 MGB6、MGB20、MGB22、MGB28、MGB30、MGB32 和 MGB16 还能显著抑制阿卡阿米巴囊肿，使囊肿发育率分别降至 46.3%、39%、30.3%、29.6%、27.8%、41.5% 和 45.6%。此外，化合物 MGB3、MGB4、MGB6、MGB22、MGB24、MGB28、MGB32 和 MGB16 还能显著减少包囊向滋养体的再萌发，有活力的滋养体只占 64.3%、47.3%、41.4%、52.9%、55.4%、40.6%、62.1% 和 51.7%。此外，MGB3、MGB4 和 MGB6 化合物对阿米巴介导的宿主细胞死亡的降低幅度最大，分别降低了 41.5%、49.4% 和 49.5%。有了以下确定的结果，今后就可以开展体内研究，以了解化合物对小鼠等动物模型的影响。

  DOI：

  10.3390/antibiotics11070935
• 作为产物：
  描述：

  N-甲基吡咯 在 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 、 硝酸 、 乙酸酐 、 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 三乙胺 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 61.0h， 生成 4-(3-(1-methyl-4-(1-methyl-4-nitropyrrole-2-carboxamido)pyrrole-2-carboxamido)propyl)morpholine
  参考文献：
  名称：

  基于结构的DNA小沟结合剂药物设计及其抗菌和抗癌特性评价

  摘要：

  抗菌素和化疗耐药性正在日益成为最重要的医疗问题。然而，新型抗菌剂和抗癌剂的研究仍然落后。根据报道的医学应用，DNA 小沟结合物 (MGB) 值得探索。在这项研究中，采用基于结构的药物设计方法生成了 11 种 MGB 化合物，其中包括一类新型生物活性炔连接的 MGB。 NCI 筛选方案用于评估目标 MGB 的抗肿瘤活性。此外，使用这些 MGB 对 6 种医学相关细菌进行了各种杀菌、细胞致病性、MIC90 和细胞毒性测定： 、 、 和 。此外，利用分子对接、分子动力学模拟、DNA熔解和等温滴定量热法（ITC）分析来探索最有效的MGB和DNA双链体d（CGACTAGTCG）之间的结合模式和相互作用。 NCI 结果表明，炔连接的 MGB（26 和 28）在 NCI-60 组中表现出最显着的生长抑制作用。此外，化合物MGB3、MGB4、MGB28和MGB32显示出显着的杀菌作用，抑制和介导细胞病变性，并且表现出低细胞毒性。

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2024.116440

文献信息

• The Synthesis of Some Head to Head Linked DNA Minor Groove Binders
  作者：Abedawn I. Khalaf、Andrew R. Pitt、Martin Scobie、Colin J. Suckling、John Urwin、Roger D. Waigh、Robert V. Fishleigh、Steven C. Young、William A. Wylie

  DOI：10.1016/s0040-4020(00)00432-4

  日期：2000.7

  A series of head to head linked dimers of heterocyclic amino acids has been prepared for investigation of affinity and selectivity in binding to the minor groove of DNA. The selection of targets for synthesis was led by computer based design. Several novel dicarboxylic acid linkers including indoles, phenanthrenes, a fluorenone, and a bisbenzothiophene have been included. Analysis of binding to DNA

  已经制备了一系列首尾相连的杂环氨基酸二聚体，用于研究与DNA小沟结合的亲和力和选择性。合成目标的选择由基于计算机的设计主导。已经包括几种新颖的二羧酸连接基，包括吲哚，菲，芴酮和双苯并噻吩。通过印迹分析与DNA的结合表明对衍生自2,7-二氢菲二羧酸的化合物具有很高的亲和力，并且对包含至少4个AT对的AT富集区域具有主要选择性，但具有跨越两个CG碱基对的能力。
• An evaluation of Minor Groove Binders as anti- Trypanosoma brucei brucei therapeutics
  作者：Fraser J. Scott、Abedawn I. Khalaf、Federica Giordani、Pui Ee Wong、Sandra Duffy、Michael Barrett、Vicky M. Avery、Colin J. Suckling

  DOI：10.1016/j.ejmech.2016.03.064

  日期：2016.6

  A series of 32, structurally diverse MGBs, derived from the natural product distamycin, was evaluated for activity against Trypanosoma brucei brucei. Four compounds have been found to possess significant activity, in the nanomolar range, and represent hits for further optimisation towards novel treatments for Human and Animal African Trypanosomiases. Moreover, SAR indicates that the head group linking moiety is a significant modulator of biological activity. (C) 2016 The Authors. Published by Elsevier Masson SAS. This is an open access article under the CC BY license (http://creativecommons.orgilicensesiby/4.0/).