N²-(10''-decarbamoyl-2''β,7''-diaminomitosen-1''α-yl)-2'-deoxyguanosine | 105214-47-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: N²-(10''-decarbamoyl-2''β,7''-diaminomitosen-1''α-yl)-2'-deoxyguanosine
• 英文别名: (2S,3R)-2,6-diamino-3-[[9-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-6-oxo-1H-purin-2-yl]amino]-4-(hydroxymethyl)-7-methyl-2,3-dihydro-1H-pyrrolo[1,2-a]indole-5,8-dione
• CAS: 105214-47-9
• 化学式: C₂₃H₂₆N₈O₇
• 分子量: 526.509
• InChiKey: PKSCEAAYGWVEOU-HHHUMZEGSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.3
• 重原子数：
  38
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.43
• 拓扑面积：
  232
• 氢给体数：
  7
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  乙酸酐 、 N²-(10''-decarbamoyl-2''β,7''-diaminomitosen-1''α-yl)-2'-deoxyguanosine 在 4-二甲氨基吡啶 作用下， 以 吡啶 为溶剂， 反应 1.0h， 生成 Acetic acid (1R,2S)-1-[9-((2R,4S,5R)-4-acetoxy-5-acetoxymethyl-tetrahydro-furan-2-yl)-6-oxo-6,9-dihydro-1H-purin-2-ylamino]-2-acetylamino-7-amino-6-methyl-5,8-dioxo-2,3,5,8-tetrahydro-1H-pyrrolo[1,2-a]indol-9-ylmethyl ester
  参考文献：
  名称：

  Isolation and characterization of a major adduct between mitomycin C and DNA

  摘要：

  DOI：

  10.1021/ja00225a048
• 作为产物：
  描述：

  Deoxyguanosine N²-monoadduct of mitomycin C 在 水 作用下， 反应 1.0h， 生成 N²-(10''-decarbamoyl-2''β,7''-diaminomitosen-1''α-yl)-2'-deoxyguanosine
  参考文献：
  名称：

  加合物X的结构，在EMT6小鼠乳腺肿瘤细胞中形成的丝裂霉素C的六个主要DNA加合物中最后一个未知数。

  摘要：

  用丝裂霉素C（MC）处理EMT6小鼠乳腺肿瘤细胞会导致形成六种主要的MC-DNA加合物。我们确定了这些的最后一个未知数（“加合物X”）为2，7-二氨基油松烯（2,7-DAM）的鸟嘌呤N（2）加合物，其中，在它的C-10位置，将油松烯连接到鸟嘌呤N （2）。分配的结构基于直接从细胞中分离出的加合物X的UV和质谱，以及其差异UV，二阶导数UV和圆二色性光谱，由[8-（3）H]脱氧鸟苷合成和观察其热稳定性。这些测试总共使用17微克合成材料进行。加合物X的形成机理涉及MC还原代谢为2,7-DAM，然后进行第二轮还原活化以将DNA烷基化，生成加合物X和另外的2，7-DAM-鸟嘌呤加合物（加合物Y），在鸟嘌呤N7与光油连接。先前已经描述了加合物Y。加合物X优先在GpC上形成，而加合物Y有利于GpG序列。与MC-DNA加合物相反，2,7-DAM-DNA加合物没有细胞毒性。

  DOI：

  10.1021/tx000024j

文献信息

• Synthesis of Mitomycin C and Decarbamoylmitomycin C N2 deoxyguanosine-adducts
  作者：Elise Champeil、Shu-Yuan Cheng、Bik Tzu Huang、Marta Conchero-Guisan、Thibaut Martinez、Manuel M. Paz、Anne-Marie Sapse

  DOI：10.1016/j.bioorg.2016.02.003

  日期：2016.4

  Mitomycin C (MC) and Decarbamoylmitomycin C (DMC) – a derivative of MC lacking the carbamate on C10 – are DNA alkylating agents. Their cytotoxicity is attributed to their ability to generate DNA monoadducts as well as intrastrand and interstrand cross-links (ICLs). The major monoadducts generated by MC and DMC in tumor cells have opposite stereochemistry at carbon one of the guanine–mitosene bond:

  丝裂霉素C（MC）和脱氨基甲酰丝裂霉素C（DMC）是MC的衍生物，在C10上缺少氨基甲酸酯，它们是DNA烷基化剂。它们的细胞毒性归因于它们产生DNA单加合物以及链内和链间交联（ICL）的能力。MC和DMC在肿瘤细胞中产生的主要单加合物在鸟嘌呤-次油烯键的碳原子上具有相反的立体化学：MC的反式（或α）和DMC的顺式（或β）。我们假设从反式或顺式加合物的DNA结构的局部破坏是由MC和DMC产生不同的生化反应的原因。获得带有顺式和反式MC / DMC损伤的DNA底物对于验证这一假设至关重要。带有反式损伤的合成寡核苷酸可以通过仿生方法获得。但是，这种方法不会产生顺式加合物。该报告介绍了顺式次生多面体DNA加合物的首次化学合成。我们还通过分析脱氧鸟苷与MC或DMC在多种激活条件下反应中顺式和反式加合物的形成，研究了这两种药物在单核苷酸水平上表现出的立体偏好。此外，我们进行了密度泛函理论计算，以评估这
• Chromium(II) perchlorate: an effective reagent for the preparation of mitomycin C nucleophilic substituted compounds
  作者：Y. P. Hong、Harold Kohn

  DOI：10.1021/jo00022a049

  日期：1991.10
• Reaction of sodium dithionite-activated mitomycin C with guanine at noncrosslinkable sequences of oligonucleotides
  作者：Brian F. McGuinness、Roselyn Lipman、Koji Nakanishi、Maria Tomasz

  DOI：10.1021/jo00016a005

  日期：1991.8

  The reaction of sodium dithionite activated mitomycin C with guanine at non-cross-linkable sequences in oligonucleotides (as well as DNA) yielded a mixed 1''-deoxyguanosine, 10''-sulfonate mitosene derivative, which has implications for published model activation and DNA alkylation studies of this antitumor antibiotic as well as its in vivo mode of action.