9-<2,3,5-tris-O-(tert-butyldimethylsilyl)-β-D-arabinofuranosyl>adenine | 90362-52-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 9-<2,3,5-tris-O-(tert-butyldimethylsilyl)-β-D-arabinofuranosyl>adenine
• 英文别名: 9-[2',3',5'-tri-O-(tert-butyldimethylsilyl)-β-D-arabinofuranosyl]adenine；2',3',5'-tri-O-tert-butyldimethylsilyladenine-9-β-D-arabinofuranoside；2',3',5'-O-tri(tert-butyldimethylsilyl)vidarabine；9-[2,3,5-tris-O-(tert-butyldimethylsilyl)-β-D-arabinofuranosyl]adenine
• CAS: 90362-52-0
• 化学式: C₂₈H₅₅N₅O₄Si₃
• 分子量: 610.032
• InChiKey: YZHKRXBIMOGRMG-XBZNOJLSSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.11
• 重原子数：
  40.0
• 可旋转键数：
  8.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.82
• 拓扑面积：
  106.54
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  9.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  9-<2,3,5-tris-O-(tert-butyldimethylsilyl)-β-D-arabinofuranosyl>adenine 在 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 18.0h， 以58%的产率得到2',3'-di-O-tert-butyldimethylsilyladenine-9-β-D-arabinofuranoside
  参考文献：
  名称：

  一系列细胞色素 P4503A 激活的前药（HepDirect 前药）的设计、合成和表征，可用于将基于磷（上）酸盐的药物靶向肝脏§

  摘要：

  描述了一类新的磷酸盐和膦酸盐前药，称为 HepDirect 前药，它结合了快速肝脏裂解的特性与高血浆和组织稳定性，以实现肝脏中药物水平的增加。前药是取代的环状 1,3-丙酸酯，设计用于经历由主要在肝脏中表达的细胞色素 P(450) (CYP) 催化的氧化裂解反应。本文报道了在 C4 上含有芳基取代基的前药系列的发现及其用于将基于核苷的药物递送至肝脏的用途。阿糖腺苷、拉米夫定 (3TC) 和阿糖胞苷的 5'-单磷酸酯前药以及膦酸阿德福韦在暴露于肝脏匀浆后显示出裂解，并在血液和其他组织中表现出良好的稳定性。前药裂解需要在顺式构型中存在芳基，但相对独立于 C4 的核苷和绝对立体化学。机理研究表明，前药裂解通过初始 CYP3A 催化氧化为中间体开环一元酸，随后通过 β-消除反应转化为磷酸（on）酸酯和芳基乙烯基酮。在原代大鼠肝细胞和正常大鼠中比较 3TC 和相应的 HepDirect 前药的研究表

  DOI：

  10.1021/ja031818y
• 作为产物：
  描述：

  叔丁基二甲基氯硅烷 、 阿糖腺苷 在 咪唑 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以74%的产率得到9-<2,3,5-tris-O-(tert-butyldimethylsilyl)-β-D-arabinofuranosyl>adenine
  参考文献：
  名称：

  一系列细胞色素 P4503A 激活的前药（HepDirect 前药）的设计、合成和表征，可用于将基于磷（上）酸盐的药物靶向肝脏§

  摘要：

  描述了一类新的磷酸盐和膦酸盐前药，称为 HepDirect 前药，它结合了快速肝脏裂解的特性与高血浆和组织稳定性，以实现肝脏中药物水平的增加。前药是取代的环状 1,3-丙酸酯，设计用于经历由主要在肝脏中表达的细胞色素 P(450) (CYP) 催化的氧化裂解反应。本文报道了在 C4 上含有芳基取代基的前药系列的发现及其用于将基于核苷的药物递送至肝脏的用途。阿糖腺苷、拉米夫定 (3TC) 和阿糖胞苷的 5'-单磷酸酯前药以及膦酸阿德福韦在暴露于肝脏匀浆后显示出裂解，并在血液和其他组织中表现出良好的稳定性。前药裂解需要在顺式构型中存在芳基，但相对独立于 C4 的核苷和绝对立体化学。机理研究表明，前药裂解通过初始 CYP3A 催化氧化为中间体开环一元酸，随后通过 β-消除反应转化为磷酸（on）酸酯和芳基乙烯基酮。在原代大鼠肝细胞和正常大鼠中比较 3TC 和相应的 HepDirect 前药的研究表

  DOI：

  10.1021/ja031818y

文献信息

• Hydrolysis and Solvent-Dependent 2′→5′ and 3′→5′ Acyl Migration in Prodrugs of 9-β-d-Arabinofuranosyladenine
  作者：Bradley D. Anderson、Man-Cheong Fung、Shiv D. Kumar、David C. Baker

  DOI：10.1002/jps.2600740805

  日期：1985.8

  As a prerequisite to quantitative in vivo studies to further explore the promising topical activity of the 2',3'-di-O-acetyl derivative of 9-beta-D-arabinofuranosyladenine (ara-A) against herpes virus infections, the kinetics of solution degradation of the 2',3'-di-O-acetyl derivative and the 2'-,3'-, and 5'-monoacetates were investigated. The rates of aqueous solution hydrolysis were found to be consistent

  作为进一步进行定量体内研究的先决条件，以进一步探索9-β-D-阿拉伯呋喃糖基腺嘌呤（ara-A）的2'，3'-二-O-乙酰基衍生物对疱疹病毒感染的动力学活性研究了2'，3'-二-O-乙酰基衍生物以及2'-，3'-和5'-单乙酸酯的溶液降解。基于对取代基效应的考虑，发现水溶液水解的速率与等级排序预测一致。然而，初步的体内水解数据与这种预测无关，这表明需要对分子结构对酶催化水解的影响进行更系统的研究。2'-3'-二酯和3'-单酯在水溶液中的重要反应，除了酯水解外，还有3'。---- 5'的酰基迁移。乙腈中的研究证实，2'---- 5'酰基迁移不会在水中发生，而是在有机溶剂中的主要迁移途径。1 H NMR光谱用于研究糖环的构象对溶剂环境的依赖性。尽管确实发生了C（2'）内基和C（3'）内基构象状态之间的平衡变化，但这不是一个戏剧性的变化，不能解释在酰基迁移动力学中观察到的溶剂选择性。
• Reaction intermediate analogues as bisubstrate inhibitors of pantothenate synthetase
  作者：Zhixiang Xu、Wei Yin、Leonardo K. Martinelli、Joanna Evans、Jinglei Chen、Yang Yu、Daniel J. Wilson、Valerie Mizrahi、Chunhua Qiao、Courtney C. Aldrich

  DOI：10.1016/j.bmc.2014.01.017

  日期：2014.3

  The biosynthesis of pantothenate, the core of coenzyme A (CoA), has been considered an attractive target for the development of antimicrobial agents since this pathway is essential in prokaryotes, but absent in mammals. Pantothenate synthetase, encoded by the gene panC, catalyzes the final condensation of pantoic acid with beta-alanine to afford pantothenate via an intermediate pantoyl adenylate. We describe the synthesis and biochemical characterization of five PanC inhibitors that mimic the intermediate pantoyl adenylate. These inhibitors are competitive inhibitors with respect to pantoic acid and possess submicromolar to micromolar inhibition constants. The observed SAR is rationalized through molecular docking studies based on the reported co-crystal structure of 1a with PanC. Finally, whole cell activity is assessed against wild-type Mtb as well as a PanC knockdown strain where PanC is depleted to less than 5% of wild-type levels. (C) 2014 Elsevier Ltd. All rights reserved.