3-cyano-7-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid methyl ester | 1026526-39-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: 3-cyano-7-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid methyl ester
• 英文别名: methyl 3-cyano-7-methyl-1H-indole-2-carboxylate
• CAS: 1026526-39-5
• 化学式: C₁₂H₁₀N₂O₂
• 分子量: 214.224
• InChiKey: UTCJTJHQGPIPLU-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.3
• 重原子数：
  16
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.17
• 拓扑面积：
  65.9
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-cyano-7-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid methyl ester 、 alkaline earth salt of/the/ methylsulfuric acid 在 sodium hydride 、 sodium hydroxide 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成
  参考文献：
  名称：

  探查因子Xa的子链揭示了基于2-羧基吲哚支架的抑制剂的两种结合模式：结合结构-活性关系和X射线晶体学的研究。

  摘要：

  描述了一系列结合了中性P1配体的高效能2-羧基吲哚基因子Xa抑制剂之间的结构活性关系，尤其着重于解决因子Xa酶亚口袋的结构要求。通过系统地取代2-羧基吲哚支架与优先的P1和P4取代基来探索与亚口袋的相互作用。在吲哚核上结合最有利的取代基导致发现显示K（i）值为0.07 nM的非常有效的Xa抑制剂。与因子Xa结合的抑制剂的X射线晶体学分析揭示了抑制剂结合模式的取代基依赖性转换，并为获得的SAR提供了理论依据。

  DOI：

  10.1021/jm0490540
• 作为产物：
  描述：

  3-iodo-7-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid methyl ester 、 氰化亚铜 在 1,1'-双(二苯基膦)二茂铁 、 tris(dibenzylideneacetone)dipalladium (0) 、 氰化四乙基铵 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 5.0h， 以13%的产率得到3-cyano-7-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid methyl ester
  参考文献：
  名称：

  探查因子Xa的子链揭示了基于2-羧基吲哚支架的抑制剂的两种结合模式：结合结构-活性关系和X射线晶体学的研究。

  摘要：

  描述了一系列结合了中性P1配体的高效能2-羧基吲哚基因子Xa抑制剂之间的结构活性关系，尤其着重于解决因子Xa酶亚口袋的结构要求。通过系统地取代2-羧基吲哚支架与优先的P1和P4取代基来探索与亚口袋的相互作用。在吲哚核上结合最有利的取代基导致发现显示K（i）值为0.07 nM的非常有效的Xa抑制剂。与因子Xa结合的抑制剂的X射线晶体学分析揭示了抑制剂结合模式的取代基依赖性转换，并为获得的SAR提供了理论依据。

  DOI：

  10.1021/jm0490540

文献信息

• Probing the Subpockets of Factor Xa Reveals Two Binding Modes for Inhibitors Based on a 2-Carboxyindole Scaffold:  A Study Combining Structure-Activity Relationship and X-ray Crystallography
  作者：Marc Nazaré、David W. Will、Hans Matter、Herman Schreuder、Kurt Ritter、Matthias Urmann、Melanie Essrich、Armin Bauer、Michael Wagner、Jörg Czech、Martin Lorenz、Volker Laux、Volkmar Wehner

  DOI：10.1021/jm0490540

  日期：2005.7.1

  remarkably potent factor Xa inhibitor displaying a K(i) value of 0.07 nM. X-ray crystallography of inhibitors bound to factor Xa revealed substituent-dependent switching of the inhibitor binding mode and provided a rationale for the SAR obtained. These results underscore the key role played by the P1 ligand not only in determining the binding affinity of the inhibitor by direct interaction but also in

  描述了一系列结合了中性P1配体的高效能2-羧基吲哚基因子Xa抑制剂之间的结构活性关系，尤其着重于解决因子Xa酶亚口袋的结构要求。通过系统地取代2-羧基吲哚支架与优先的P1和P4取代基来探索与亚口袋的相互作用。在吲哚核上结合最有利的取代基导致发现显示K（i）值为0.07 nM的非常有效的Xa抑制剂。与因子Xa结合的抑制剂的X射线晶体学分析揭示了抑制剂结合模式的取代基依赖性转换，并为获得的SAR提供了理论依据。