methyl (S)-3-(4-(2-bromoethoxy)phenyl)-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)propanoate | 1269631-36-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: methyl (S)-3-(4-(2-bromoethoxy)phenyl)-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)propanoate
• 英文别名: (S)-Methyl 3-(4-(2-bromoethoxy)phenyl)-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)propanoate；methyl (2S)-3-[4-(2-bromoethoxy)phenyl]-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]propanoate
• CAS: 1269631-36-8
• 化学式: C₁₇H₂₄BrNO₅
• 分子量: 402.285
• InChiKey: GFMRTAHZSZGWHF-AWEZNQCLSA-N

物化性质

• 沸点：
  502.7±50.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.307±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.8
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.53
• 拓扑面积：
  73.9
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl (S)-3-(4-(2-bromoethoxy)phenyl)-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)propanoate 在 水 、 三氟乙酸 、 sodium iodide 、 lithium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 丙酮 为溶剂， 反应 9.0h， 生成 O-(2-iodoethyl)-L-tyrosine
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of a cyclic peptide/protein using the NEXT-A reaction followed by cyclization

  摘要：

  通过 NEXT-A 反应，我们在含有半胱氨酸单元的肽/蛋白质的 N 端引入了一个非天然氨基酸。引入的氨基酸侧链自发地与半胱氨酸发生反应，生成环肽/蛋白质。

  DOI：

  10.1039/c1cc12196k
• 作为产物：
  描述：

  Boc-L-酪氨酸 在 18-冠醚-6 、 potassium carbonate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 22.57h， 生成 methyl (S)-3-(4-(2-bromoethoxy)phenyl)-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)propanoate
  参考文献：
  名称：

  氟化嘌呤霉素类似物的合成、体外评价和放射性标记：蛋白质合成的 PET 成像的潜在候选者。

  摘要：

  目前没有理想的放射性示踪剂用于通过正电子发射断层扫描 (PET) 对蛋白质合成率 (PSR) 进行成像。现有的基于氟 18 标记的氨基酸放射性示踪剂主要可视化氨基酸转运蛋白过程，并且在许多情况下它们根本没有并入新生蛋白质中。其他的则用半衰期短的正电子发射体碳 11 进行放射性标记，这对于许多 PET 中心来说是相当不切实际的。基于嘌呤霉素 (6) 结构流形，通过威廉姆森醚合成，从一个常见的中间体制备了一系列 6 的 10 种新型衍生物。使用生物发光测定来研究它们对蛋白质合成的抑制作用，确定氟乙基类似物 7b 为先导化合物。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.6b00968

文献信息

• Synthesis and Incorporation of Unnatural Amino Acids To Probe and Optimize Protein Bioconjugations
  作者：Johnathan C. Maza、Jaclyn R. McKenna、Benjamin K. Raliski、Matthew T. Freedman、Douglas D. Young

  DOI：10.1021/acs.bioconjchem.5b00424

  日期：2015.9.16

  The utilization of unnatural amino acids (UAAs) in bioconjugations is ideal due to their ability to confer a degree of bioorthogonality and specificity. In order to elucidate optimal conditions for the preparation of bioconjugates with UAAs, we synthesized 9 UAAs with variable methylene tethers (2–4) and either an azide, alkyne, or halide functional group. All 9 UAAs were then incorporated into green

  由于非天然氨基酸（UAA）具有一定程度的生物正交性和特异性，因此它们在生物结合中的应用是理想的。为了阐明制备具有UAA的生物共轭物的最佳条件，我们合成了9个带有可变亚甲基系链（2-4）和叠氮化物，炔烃或卤化物官能团的UAA。然后使用混杂的氨酰基-tRNA合成酶将所有9个UAA掺入绿色荧光蛋白（GFP）中。然后通过与荧光团或衍生化的树脂反应，分析不同的生物共轭物的最佳系链长度。有趣的是，发现最佳的系链长度取决于反应的类型。总的来说，这些发现提供了对各种参数的更好的理解，这些参数可以被优化以有效地制备生物缀合物。
• Synthesis and Biological Evaluation of Novel Pentacyclic Triterpene Derivatives as Potential PPARγ Agonists
  作者：Liying Zhang、Jizhe Dong、Jun Liu、Luyong Zhang、Lingyi Kong、Hequan Yao、Hongbin Sun

  DOI：10.2174/157340613804488413

  日期：2013.2.1

  Synthesis and biological evaluation of a novel series of substituted pentacyclic triterpene derivatives as potential PPARγ agoinsts and glycogen phosphorylase inhibitors have been described. Compounds 11 and 17 showed potent PPARγ agonistic activity and activated the transcription activity of PPARγ in a dose-dependent manner. On the other hand, eleven compounds exhibited moderate inhibitory activity against rabbit muscle glycogen phosphorylase a (RMGPa), and triterpene 10 was the best one. Structure-activity relationship (SAR) is also discussed.

  研究人员合成了一系列新的取代五环三萜衍生物，并对其进行了生物学评价，这些衍生物可能是 PPARγ 激动剂和糖原磷酸化酶抑制剂。化合物 11 和 17 显示出了强效的 PPARγ 激动活性，并以剂量依赖的方式激活了 PPARγ 的转录活性。另一方面，11 个化合物对兔肌糖原磷酸化酶 a（RMGPa）表现出中等程度的抑制活性，其中三萜 10 的抑制活性最佳。此外，还讨论了结构-活性关系（SAR）。
• Methods and compositions for labeling polypeptides
  申请人：President and Fellows of Harvard College

  公开号：US09212381B2

  公开（公告）日：2015-12-15

  Synthesis of many proteins is tightly controlled at the level of translation and plays an essential role in fundamental processes such as cell growth and proliferation, signaling, differentiation or death. Methods that allow imaging and identification of nascent proteins allow for dissecting regulation of translation, both spatially and temporally, including in whole organisms. Described herein are robust chemical methods for imaging and affinity-purifying nascent polypeptides in cells and in animals, based on puromycin analogs. Puromycin analogs of the present invention form covalent conjugates with nascent polypeptide chains, which are rapidly turned over by the proteasome and can be visualized and specifically captured by a bioorthogonal reaction (e.g., [3+2] cycloaddition). The methods of the present invention have broad applicability for imaging protein synthesis and for identifying proteins synthesized under various physiological and pathological conditions in vivo.

  许多蛋白质的合成在翻译水平上受到严格控制，并在细胞生长和增殖、信号传导、分化或死亡等基本过程中发挥着重要作用。允许成像和识别新生蛋白质的方法有助于解析翻译的调控，无论是在空间上还是时间上，包括在整个生物体中。本文介绍了一种在细胞和动物中成像和亲和纯化新生多肽的强大化学方法，该方法基于链霉素类似物。本发明的链霉素类似物与新生多肽链形成共价结合物，这些结合物被蛋白酶体迅速降解，并可以通过生物正交反应（例如[3+2]环加成）进行可视化和特异捕获。本发明的方法在成像蛋白质合成和鉴定在不同生理和病理条件下体内合成的蛋白质方面具有广泛适用性。
• Proximity‐Enabled Protein Crosslinking through Genetically Encoding Haloalkane Unnatural Amino Acids
  作者：Zheng Xiang、Vanessa K. Lacey、Haiyan Ren、Jing Xu、David J. Burban、Patricia A. Jennings、Lei Wang

  DOI：10.1002/anie.201308794

  日期：2014.2.17

  covalent bonds between and within proteins would provide new avenues for studying protein function and engineering proteins with new properties. New covalent bonds were genetically introduced into proteins by enabling an unnatural amino acid (Uaa) to selectively react with a proximal natural residue. This proximity‐enabled bioreactivity was expanded to a series of haloalkane Uaas. Orthogonal tRNA/synthetase

  蛋白质之间和蛋白质内共价键的选择性生成将为研究蛋白质功能和工程化具有新特性的蛋白质提供新途径。通过使非天然氨基酸 (Uaa) 选择性地与邻近的天然残基反应，新的共价键被遗传性地引入蛋白质中。这种接近使能的生物反应性扩展到一系列卤代烷烃 Uaas。正交 tRNA/合成酶对被进化为包含这些 Uaas，当它们靠近时，它们仅与半胱氨酸形成共价硫醚键。通过使用 Uaa 和半胱氨酸，在亲和体与其底物 Z 蛋白之间证明了自发共价键形成，从而导致不可逆的结合，并在亲和体内增加其热稳定性。
• METHODS AND COMPOSITIONS FOR LABELING POLYPEPTIDES
  申请人：President and Fellows of Harvard College

  公开号：US20130122535A1

  公开（公告）日：2013-05-16

  Synthesis of many proteins is tightly controlled at the level of translation and plays an essential role in fundamental processes such as cell growth and proliferation, signaling, differentiation or death. Methods that allow imaging and identification of nascent proteins allow for dissecting regulation of translation, both spatially and temporally, including in whole organisms. Described herein are robust chemical methods for imaging and affinity-purifying nascent polypeptides in cells and in animals, based on puromycin analogs. Puromycin analogs of the present invention form covalent conjugates with nascent polypeptide chains, which are rapidly turned over by the proteasome and can be visualized and specifically captured by a bioorthogonal reaction (e.g., [3+2]cycloaddition). The methods of the present invention have broad applicability for imaging protein synthesis and for identifying proteins synthesized under various physiological and pathological conditions in vivo.

  许多蛋白质的合成在翻译水平上受到严格的控制，并在细胞生长和增殖、信号传递、分化或死亡等基本过程中发挥着重要作用。允许成像和鉴定新生蛋白质的方法可以在整个生物体内解剖翻译调控的空间和时间，包括在细胞和动物中。本文介绍了一种基于普鲁霉素类似物的成像和亲和纯化新生多肽的强大化学方法。本发明的普鲁霉素类似物与新生多肽链形成共价结合物，这些共价结合物被蛋白酶体迅速降解，并可以通过生物正交反应（例如[3+2]环加成）进行可视化和特异性捕获。本发明的方法具有广泛的适用性，可用于成像蛋白质合成并在体内识别在各种生理和病理条件下合成的蛋白质。