N-formylglycinamidine ribonucleotide | 6157-85-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: N-formylglycinamidine ribonucleotide
• 英文别名: phosphoribosylformylglycineamidine；[(2R,3S,4R,5R)-5-[(E)-(1-amino-2-formamidoethylidene)amino]-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate
• CAS: 6157-85-3
• 化学式: C₈H₁₆N₃O₈P
• 分子量: 313.204
• InChiKey: PMCOGCVKOAOZQM-XVFCMESISA-N

物化性质

• 物理描述：
  Solid

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.6
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.75
• 拓扑面积：
  184
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-formylglycinamidine ribonucleotide 在 Calf intestinal alkaline phosphatase 作用下， 反应 4.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  嘌呤从头生物合成中间体的质谱分析

  摘要：

  嘌呤是所有形式生命中必不可少的分子。嘌呤除了构成DNA和RNA的骨架外，还在许多代谢途径中发挥作用，例如能量利用，酶活性调节和细胞信号传导。嘌呤的供应通过两种途径提供：挽救途径和从头合成。虽然嘌呤从头合成（PDNS）活性在细胞周期中会发生变化，该途径代表了嘌呤的重要来源，特别是对于快速分裂的细胞。由于分析原因（敏感性）以及由于该化合物在商业上的不实用性，缺乏用于PDNS的详细研究的方法。目的是全面描述新合成的与PDNS相关的代谢物的质谱碎片化行为，并开发一种分析方法。除了四个优先的核糖体PDNS中间体优先失去水或磷酸盐或裂解嘌呤环的形成碱基外，所有其他研究的代谢物均在第一个裂解阶段裂解了糖苷键。在第三到第六阶段可能会出现碎片。开发了一种液相色谱-高分辨率质谱法，并将其用于CRISPR-Cas9基因组编辑的HeLa细胞的分析，这些细胞在PDNS的各个酶促步骤和挽救途径中均存在缺陷。通过比较合

  DOI：

  10.1371/journal.pone.0208947
• 作为产物：
  描述：

  D-ribose 5-phosphate 、 L-谷氨酰胺 在 ammonium hydroxide 、 5’-三磷酸腺苷 、 magnesium chloride 作用下， 以 aq. phosphate buffer 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 N-formylglycinamidine ribonucleotide
  参考文献：
  名称：

  嘌呤从头生物合成中间体的质谱分析

  摘要：

  嘌呤是所有形式生命中必不可少的分子。嘌呤除了构成DNA和RNA的骨架外，还在许多代谢途径中发挥作用，例如能量利用，酶活性调节和细胞信号传导。嘌呤的供应通过两种途径提供：挽救途径和从头合成。虽然嘌呤从头合成（PDNS）活性在细胞周期中会发生变化，该途径代表了嘌呤的重要来源，特别是对于快速分裂的细胞。由于分析原因（敏感性）以及由于该化合物在商业上的不实用性，缺乏用于PDNS的详细研究的方法。目的是全面描述新合成的与PDNS相关的代谢物的质谱碎片化行为，并开发一种分析方法。除了四个优先的核糖体PDNS中间体优先失去水或磷酸盐或裂解嘌呤环的形成碱基外，所有其他研究的代谢物均在第一个裂解阶段裂解了糖苷键。在第三到第六阶段可能会出现碎片。开发了一种液相色谱-高分辨率质谱法，并将其用于CRISPR-Cas9基因组编辑的HeLa细胞的分析，这些细胞在PDNS的各个酶促步骤和挽救途径中均存在缺陷。通过比较合

  DOI：

  10.1371/journal.pone.0208947

文献信息

• Methods for indentifying compounds that modulate an enzyme in the coenzyme a biosynthetic pathway in a pathogenic microoganism
  申请人：Schechter M. Alan

  公开号：US20060094075A1

  公开（公告）日：2006-05-04

  A method for the identification and treatment of pathogenic microorganism infections by inhibiting one or more enzymes in a metabolic pathway by inhibiting the conversion of substrate to produce the penultimate or ultimate product particularly by inhibiting the activity of one or more of the enzymes in the pathway, and compounds and pharmaceutical compositions for inhibiting infections of pathogenic microorganisms by inhibiting such enzymes.

  一种通过抑制代谢途径中一个或多个酶的活性，抑制底物转化为产生次终产物或终产物的过程，特别是通过抑制途径中一个或多个酶的活性，来识别和治疗病原微生物感染的方法，以及用于抑制这些酶而抑制病原微生物感染的化合物和药物组合物。
• Method for the identification and treatment of pathogenic microorganism infections by inhibiting one or more enzymes in an essential metabolic pathway
  申请人：Pyro Pharmaceuticals, Inc.

  公开号：US20030180830A1

  公开（公告）日：2003-09-25

  A method for the identification and treatment of pathogenic microorganism infections by inhibiting one or more enzymes in a metabolic pathway by inhibiting the conversion of substrate to produce the penultimate or ultimate product particularly by inhibiting the activity of one or more of the enzymes in the pathway

  一种通过抑制代谢途径中一个或多个酶的活性，从而抑制底物转化产生次终产物或最终产物，特别是通过抑制代谢途径中一个或多个酶的活性来识别和治疗病原微生物感染的方法。
• Method for the identification and treatment of pathogenic microorganism infections by inhibiting one or more enzymes in an essential metabolic pathway and compounds and pharmaceutical compositions useful therefor
  申请人：Pyro Pharmaceuticals, Inc.

  公开号：US20040006040A1

  公开（公告）日：2004-01-08

  A method for the identification and treatment of pathogenic microorganism infections by inhibiting one or more enzymes in a metabolic pathway by inhibiting the conversion of substrate to produce the penultimate or ultimate product particularly by inhibiting the activity of one or more of the enzymes in the pathway, and compounds and pharmaceutical compositions for inhibiting infections of pathogenic microorganisms by inhibiting such enzymes.

  一种通过抑制代谢途径中的一个或多个酶，抑制底物转化为产生次终产物或终产物的方法，特别是通过抑制途径中一个或多个酶的活性，用于鉴定和治疗病原微生物感染，以及用于抑制这些酶的化合物和制药组合物，用于抑制病原微生物感染。
• Methods for indentifying compounds that modulate an enzyme involved in reductive carboxylation in a pathogenic microorganism
  申请人：Schechter M. Alan

  公开号：US20060178321A1

  公开（公告）日：2006-08-10

  A method for the identification and treatment of pathogenic microorganism infections by inhibiting one or more enzymes in a metabolic pathway by inhibiting the conversion of substrate to produce the penultimate or ultimate product particularly by inhibiting the activity of one or more of the enzymes in the pathway, and compounds and pharmaceutical compositions for inhibiting infections of pathogenic microorganisms by inhibiting such enzymes.

  一种通过抑制代谢途径中的一个或多个酶来抑制底物转化为产生次终产物或终产物的方法，特别是通过抑制途径中一个或多个酶的活性，用于鉴定和治疗病原微生物感染，以及用于抑制这些酶的化合物和制药组合物以抑制病原微生物感染的方法。
• Methods for indentifying compounds that modulate an enzyme involved in riboflavin metabolism in a pathogenic microorganism
  申请人：Schechter M. Alan

  公开号：US20060178322A1

  公开（公告）日：2006-08-10

  A method for the identification and treatment of pathogenic microorganism infections by inhibiting one or more enzymes in a metabolic pathway by inhibiting the conversion of substrate to produce the penultimate or ultimate product particularly by inhibiting the activity of one or more of the enzymes in the pathway, and compounds and pharmaceutical compositions for inhibiting infections of pathogenic microorganisms by inhibiting such enzymes.

  一种通过抑制代谢途径中的一个或多个酶，抑制底物转化为产生次终产物或终产物的方法，特别是通过抑制途径中一个或多个酶的活性，以识别和治疗致病微生物感染，以及用于抑制这些酶而抑制致病微生物感染的化合物和制药组合物。