α-t-butyl β-methyl N-Z-(S)-aspartate | 60079-12-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: α-t-butyl β-methyl N-Z-(S)-aspartate
• 英文别名: 1-(tert-butyl) 4-methyl ((benzyloxy)carbonyl)-L-aspartate；Z-Asp(OMe)-OtBu；1-O-tert-butyl 4-O-methyl (2S)-2-(phenylmethoxycarbonylamino)butanedioate
• CAS: 60079-12-1
• 化学式: C₁₇H₂₃NO₆
• 分子量: 337.373
• InChiKey: RJPJDIHTCANHNF-ZDUSSCGKSA-N

物化性质

• 沸点：
  459.3±45.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.161±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.2
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.47
• 拓扑面积：
  90.9
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  α-t-butyl β-methyl N-Z-(S)-aspartate 在 sodium hydroxide 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 3.0h， 以92%的产率得到(S)-2-benzyloxycarbonylamino-succinic acid 1-tert-butyl ester
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of Optically Active 2-(tert-Butyloxycarbonylamino)-4-dialkoxyphosphorylbutanoate Protected Isosteres ofO-Phosphonoserine for Peptide Synthesis

  摘要：

  描述了从(S)-天冬氨酸制备(S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-4-二烷氧基磷酰丁酸酯的过程。

  DOI：

  10.1055/s-1988-27707
• 作为产物：
  描述：

  氯甲酸苄酯 在 sodium hydroxide 、 硫酸 、 碳酸氢钠 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 24.0h， 生成 α-t-butyl β-methyl N-Z-(S)-aspartate
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and in vitro enzyme activity of aza, oxa and thia derivatives of bacterial cell wall biosynthesis intermediates†

  摘要：

  基于对二氨基庚二酸转氨酶（DAP-AT）的底物特异性及作用机制的了解，设计了机制型抑制剂。在体外抑制实验之前，成功合成了硫酯及酰胺类底物类似物，但酯类类似物过于不稳定，无法分离。硫类底物类似物未表现出抑制作用，但氮类底物类似物12a对DAP-AT显示出可逆抑制性，并且在缺乏天然底物4的情况下显示出时间依赖性抑制作用。底物类似物12a是首个PLP依赖性酶的酰胺类抑制剂示例。同时，也对12a的抗菌特性进行了简要评估。

  DOI：

  10.1039/b105117m

文献信息

• Polypeptides. Part VIII. Variations of the aspartyl position in the C-terminal tetrapeptide amide sequence of the gastrins
  作者：H. Gregory、J. S. Morley、J. M. Smith、M. J. Smithers

  DOI：10.1039/j39680000715

  日期：——

  The synthesis is described of analogues of L-tryptophyl-L-methionyl-L-aspartyl-L-phenylalanine amide (the C-terminal sequence of the gastrins), and its N-benzyloxycarbonyl or N-t-butoxycarbonyl derivatives, wherein the aspartyl residue has undergone replacement by alanyl, β-aspartyl, asparaginyl, cysteinyl, glutamyl, glycyl, lysyl, norvalyl, ornithyl, seryl, threonyl, and other amino-acyl residues

  描述了L-色氨酸-L-甲硫酰基-L-天冬氨酰-L-苯丙氨酸酰胺（胃泌素的C-末端序列）及其N-苄氧羰基或N-叔丁氧羰基衍生物的类似物的合成，其中天冬氨酰残基已被丙氨酰基，β-天冬氨酰，天冬酰胺基，半胱氨酰基，谷氨酰基，甘氨酰基，赖氨酰基，降冰片酰基，鸟氨酸残基，丝氨酰基，苏氨酰基和其他氨基酰基残基取代。
• Design and synthesis of novel P2 substituents in diol-based HIV protease inhibitors
  作者：Jenny Adrian Meredith、Hans Wallberg、Lotta Vrang、Stefan Oscarson、Kevin Parkes、Anders Hallberg、Bertil Samuelsson

  DOI：10.1016/j.ejmech.2009.09.038

  日期：2010.1

  The synthesis and SAR of HIV-1 protease inhibitors containing novel P2 structural elements are presented. The inhibitors were designed having hydrogen bond accepting P2 substituents to probe potential favorable interactions to Asp-29/Asp-30 of the HIV-1 protease backbone utilizing inhibitor 3 as a model template. Several inhibitors were synthesized from an l-Val methyl amide P2 motif by appending hydrogen

  介绍了含有新型P2结构元素的HIV-1蛋白酶抑制剂的合成和SAR。设计抑制剂以具有氢键的P2取代基，以抑制剂3为模型模板来探查与HIV-1蛋白酶骨架的Asp-29 / Asp-30之间潜在的有利相互作用。通过附加来自异丙基侧链或来自甲基酰胺部分的氢键部分，由1- Val甲基酰胺P2基序合成了几种抑制剂。最有希望的抑制剂图4a和4e中显示ķ我分别和EC值为1.0nM和0.7毫微米的50在基于MT4细胞的测定中，其值分别为0.17μM和0.33μM，与铅抑制剂3相比，效力略有下降。还针对带有M46I，V82F和I84V突变的HIV蛋白酶抑制剂抗性菌株测试了这些抑制剂。与HIV野生型相比，抑制剂4a和4e分别显示出3倍和4倍的变化，而铅抑制剂3显示出更高的9倍的变化。这项研究进一步证明了该方法的化学易处理性，其中仅在一个化学步骤中就可以从内酯21引入各种P2取代基，从而可以轻松地改变此类抑制剂的总体性能。
• Mapping the Aspartic Acid Binding Site of <i>Escherichia coli</i> Asparagine Synthetase B Using Substrate Analogs
  作者：Ian B. Parr、Susan K. Boehlein、Anthony B. Dribben、Sheldon M. Schuster、Nigel G. J. Richards

  DOI：10.1021/jm9601009

  日期：1996.1.1

  Novel inhibitors of asparagine synthetase, that will lower circulating levels of blood asparagine, have considerable potential in developing new protocols for the treatment of acute lymphoblastic leukemia. We now report the indirect characterization of the aspartate binding site of Escherichia coli asparagine synthetase B (AS-B) using a number of stereochemically, and conformationally, defined aspartic

  新的天冬酰胺合成酶抑制剂将降低血液中天冬酰胺的循环水平，在开发治疗急性淋巴细胞白血病的新方案方面具有巨大潜力。我们现在报告使用许多立体化学和构象确定的天冬氨酸类似物对大肠杆菌天冬酰胺合成酶B（AS-B）的天冬氨酸结合位点进行间接表征。在针对AS-B的动力学研究中，已发现使用天冬氨酸二酯的立体特异性β-官能化的新反应条件制备的两种化合物是相对于天冬氨酸的竞争性抑制剂。使用[（氟磺酰基）苯甲酰基]腺苷（​​FSBA）（一种ATP类似物）的化学修饰实验表明，两种抑制剂均与AS-B的天冬氨酸结合位点结合。
• Synthesis of desmosine-containing cyclic peptide for the possible elucidation of elastin crosslinking structure
  作者：Keita Ogawa、Takahiro Hayashi、Yong Y. Lin、Toyonobu Usuki

  DOI：10.1016/j.tet.2017.05.045

  日期：2017.7

  elastin and play an important role as crosslinkers. Structural elucidation of elastin has eluded scientists to date, owing to the highly cross-linked structure and insoluble nature. Therefore, in this study, we aimed to synthesize a desmosine-containing cyclic peptide as a partial elastin mimic, in order to eventually facilitate the elucidation of the crosslinking pattern of elastin by mass spectrometric

  弹性蛋白是重要的细胞外基质蛋白，已知在许多组织中具有弹性。它是由弹性蛋白前体原弹性蛋白的自组装和随后的交联形成的。弹力蛋白中仅发现两种基于吡啶鎓的四官能氨基酸的desmosine和isodesmosine，它们在交联剂中起着重要的作用。迄今为止，由于高度交联的结构和不溶性，对弹性蛋白的结构阐明还没有引起科学家的注意。因此，在这项研究中，我们旨在合成一种含去糖素的环肽作为部分弹性蛋白模拟物，以最终通过质谱分析促进阐明弹性蛋白的交联方式。
• Structure-Guided Design of a “Bump-and-Hole” Bromodomain-Based Degradation Tag
  作者：Radosław P. Nowak、Yuan Xiong、Nadia Kirmani、Joann Kalabathula、Katherine A. Donovan、Nicholas A. Eleuteri、J. Christine Yuan、Eric S. Fischer

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.1c00958

  日期：2021.8.12

  Chemical biology tools to modulate protein levels in cells are critical to decipher complex biology. Targeted protein degradation offers the potential for rapid and dose-dependent protein depletion through the use of protein fusion tags toward which protein degraders have been established. Here, we present a newly developed protein degradation tag BRD4BD1L94V along with the corresponding cereblon (CRBN)-based

  调节细胞中蛋白质水平的化学生物学工具对于破译复杂的生物学至关重要。通过使用蛋白质融合标签，靶向蛋白质降解提供了快速和剂量依赖性蛋白质消耗的潜力，蛋白质降解剂已经建立。在这里，我们提出了一种新开发的蛋白质降解标签 BRD4 BD1 L94V 以及基于“凹凸洞”方法的相应基于 cereblon (CRBN) 的异质双功能降解剂。所得到的化合物XY-06-007示出了半降解浓度（DC 50，6小时对BRD4为10nM）BD1 L94V无的脱靶降解，如由整个蛋白质组质谱评估，并演示了合适的药代动力学在体内学习。我们证明 BRD4 BD1 L94V 可以与 dTAG 方法相结合，以同时实现降解剂介导的各自蛋白质融合的消耗。这种正交系统补充了当前可用的蛋白质降解标签，并能够调查先前不可治疗的疾病相关性的快速降解所导致的后果。