methyl (4R, 7S)-7-amino-12,14-bis(tert-butyldimethylsilyloxy)-1,3,4,5,6,7,8,10-octahydro-11-methyl-6,10-dioxo-9,2,5-benzoxathiaazacyclododecine-4-carboxylate | 147216-49-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: methyl (4R, 7S)-7-amino-12,14-bis(tert-butyldimethylsilyloxy)-1,3,4,5,6,7,8,10-octahydro-11-methyl-6,10-dioxo-9,2,5-benzoxathiaazacyclododecine-4-carboxylate
• 英文别名: methyl (5R,8S)-8-amino-14,16-bis[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy]-13-methyl-7,11-dioxo-10-oxa-3-thia-6-azabicyclo[10.4.0]hexadeca-1(16),12,14-triene-5-carboxylate
• CAS: 147216-49-7
• 化学式: C₂₈H₄₈N₂O₇SSi₂
• 分子量: 612.935
• InChiKey: HUMKMWJTQRAOCA-PMACEKPBSA-N

物化性质

• 沸点：
  686.8±55.0 °C(predicted)
• 密度：
  1.078±0.06 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.15
• 重原子数：
  40
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.68
• 拓扑面积：
  152
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl (4R, 7S)-7-amino-12,14-bis(tert-butyldimethylsilyloxy)-1,3,4,5,6,7,8,10-octahydro-11-methyl-6,10-dioxo-9,2,5-benzoxathiaazacyclododecine-4-carboxylate 在 N-甲基吗啉 、 氟化铵 、 sodium hydroxide 、 N-羟基丁二酰亚胺 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 17.92h， 生成 (2S)-2-[[(5S,8R)-5-[[(2S,3R)-1-(2-氨基-3-羟基丙酰基)-3-羟基吡咯烷-2-羰基]氨基]-13,15-二羟基-16-甲基-2,6-二氧代3-氧杂-10-硫杂-7-氮杂双环[10.4.0]十六-1(16),12,14-三烯-8-羰基]氨基]丙酸
  参考文献：
  名称：

  环丁胺的全合成

  摘要：

  描述了从硫链霉菌分离出的一种新的DNA促旋酶抑制剂cyclothialidine（1）的总合成。通过制备内酯13（方案2）来测试合成的概念，该内酯13包含特征性双环核心实体1。合成1的关键特征是：通过两个连续的曼尼希氨基甲基化/氢化序列，由3,5-二羟基苯甲酸（19）制备3,5-二羟基-2,6-二甲基苯甲酸（23）；酯衍生物的苄基N-溴琥珀酰亚胺溴化25其及其随后与Boc-Ser-Cys-OMe的偶联（11）；使用优选的Mitsunobu条件将ω-羟基酸29 29环化为12元内酯30；的肽侧链的完成1使用Boc策略（路线4）。通过外消旋物通过含有脂肪酶催化的对映体特异性乙酸酯水解的有效反应序列拆分，得到旋光纯的顺式-N-（叔丁氧基羰基）-3-羟基-L-脯氨酸（（-）- 14）（方案3） 。自然结构1通过与合成材料比较确认。描述的合成路线还提供方便的类似物1，例如经由中间30。

  DOI：

  10.1002/hlca.19960790816
• 作为产物：
  描述：

  3,5-二羟基苯甲酸 在 palladium on activated charcoal 哌啶 、 sodium hydroxide 、 N-溴代丁二酰亚胺(NBS) 、 氢气 、 三乙胺 、 三苯基膦 、 三氟乙酸 、 偶氮二甲酸二乙酯 、 四甲基胍 作用下， 以 甲醇 、 四氯化碳 、 乙醇 、 二氯甲烷 、 水 、 乙酸乙酯 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 为溶剂， 25.0 ℃ 、10.0 kPa 条件下， 反应 89.08h， 生成 methyl (4R, 7S)-7-amino-12,14-bis(tert-butyldimethylsilyloxy)-1,3,4,5,6,7,8,10-octahydro-11-methyl-6,10-dioxo-9,2,5-benzoxathiaazacyclododecine-4-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  环丁胺的全合成

  摘要：

  描述了从硫链霉菌分离出的一种新的DNA促旋酶抑制剂cyclothialidine（1）的总合成。通过制备内酯13（方案2）来测试合成的概念，该内酯13包含特征性双环核心实体1。合成1的关键特征是：通过两个连续的曼尼希氨基甲基化/氢化序列，由3,5-二羟基苯甲酸（19）制备3,5-二羟基-2,6-二甲基苯甲酸（23）；酯衍生物的苄基N-溴琥珀酰亚胺溴化25其及其随后与Boc-Ser-Cys-OMe的偶联（11）；使用优选的Mitsunobu条件将ω-羟基酸29 29环化为12元内酯30；的肽侧链的完成1使用Boc策略（路线4）。通过外消旋物通过含有脂肪酶催化的对映体特异性乙酸酯水解的有效反应序列拆分，得到旋光纯的顺式-N-（叔丁氧基羰基）-3-羟基-L-脯氨酸（（-）- 14）（方案3） 。自然结构1通过与合成材料比较确认。描述的合成路线还提供方便的类似物1，例如经由中间30。

  DOI：

  10.1002/hlca.19960790816

文献信息

• Process for the preparation of DNA gyrase inhibitors
  申请人：Hoffmann-La Roche Inc.

  公开号：US05486466A1

  公开（公告）日：1996-01-23

  Bicyclic derivatives of the general formula ##STR1## wherein X.sup.1 is --S-- or --SO--; X.sup.2 is --CO-- or --CS--; R.sup.1 is hydrogen, halogen or lower alkyl optionally substituted by halogen or lower alkoxy; R.sup.2 and R.sup.3 are each independently hydrogen, lower alkyl, halogen, amino, lower alkylamino, di-lower alkylamino, acylamino, lower alkexy, lower alkoxymethoxy or a group OR.sup.4 ; R.sup.4 is hydrogen or an easily hydrolyzable group; R.sup.5 is hydrogen, optionally esterified carboxy or amidated (thio)carboxy, optionally substituted alkyl, optionally substituted alkenyl, optionally substituted acyl or heterocyclyl; R.sup.6 and R.sup.7a are each independently hydrogen or lower alkyl; R.sup.7b is hydrogen, optionally substituted hydroxy, --NR--A or --N.dbd.B, in which R is hydrogen or lower alkyl, A is hydrogen, optionally substituted alkyl, lower cycloalkyl, iminoyl, (thio)acyl, esterified carboxy or amidated (thio)carboxy and B is lower alkylidene; R.sup.7a and R.sup.7b together represent oxo, lower alkoxycarbonylmethylidene or optionally substituted hydroxyimino; and R.sup.8 is hydrogen, optionally substituted alkyl, optionally esterified carboxy or amidated (thio)carboxy; provided that no more than two of R.sup.1 -R.sup.3 are nitrogen-containing groups; no more than two of R.sup.1 -R.sup.3 are oxygen containing groups and no more than two of R.sup.1 -R.sup.3 are either nitrogen containing or oxygen containing groups; and pharmaceutically acceptable salts of the compounds of formula I carrying an acidic and/or basic substituent. The products are antimicrobially active.

  通式为##STR1##的二环衍生物，其中X.sup.1为--S--或--SO--;X.sup.2为--CO--或--CS--;R.sup.1为氢、卤素或低碳基，可选择地被卤素或低烷氧基取代;R.sup.2和R.sup.3各自独立地为氢、低烷基、卤素、氨基、低烷基氨基、双低烷基氨基、酰胺基、低烷氧基、低烷氧甲氧基或OR.sup.4基；R.sup.4为氢或易水解的基团；R.sup.5为氢、可选择酯化的羧基或酰胺化的(硫)羧基、可选择地被取代的烷基、可选择地被取代的烯基、可选择地被取代的酰基或杂环基；R.sup.6和R.sup.7a各自独立地为氢或低烷基；R.sup.7b为氢、可选择地被取代的羟基、--NR--A或--N.dbd.B，其中R为氢或低烷基，A为氢、可选择地被取代的烷基、低环烷基、亚胺基、(硫)酰基、酯化的羧基或酰胺化的(硫)羧基，B为低烷基亚甲基；R.sup.7a和R.sup.7b共同表示氧、低烷氧羰基甲基或可选择地被取代的羟亚胺基；R.sup.8为氢、可选择地被取代的烷基、可选择酯化的羧基或酰胺化的(硫)羧基；前提是R.sup.1-R.sup.3中最多有两个含氮基团；R.sup.1-R.sup.3中最多有两个含氧基团；R.sup.1-R.sup.3中最多有两个含氮基团或含氧基团；以及携带酸性和/或碱性取代基的通式I化合物的药物可接受的盐。该产品具有抗微生物活性。
• New Antibacterial Agents Derived from the DNA Gyrase Inhibitor Cyclothialidine
  作者：Peter Angehrn、Stefan Buchmann、Christoph Funk、Erwin Goetschi、Hans Gmuender、Paul Hebeisen、Dirk Kostrewa、Helmut Link、Thomas Luebbers、Raffaello Masciadri、Joergen Nielsen、Peter Reindl、Fabienne Ricklin、Anne Schmitt-Hoffmann、Frank-Peter Theil

  DOI：10.1021/jm0310232

  日期：2004.3.1

  Cyclothialidine (1, Ro 09-1437) is a potent DNA gyrase inhibitor that was isolated from Streptomyces filipinensis NR0484 and is a member of a new family of natural products. It acts by competitively inhibiting the ATPase activity exerted by the B subunit of DNA gyrase but barely exhibits any growth inhibitory activity against intact bacterial cells, presumably due to insufficient permeation of the cytoplasmic membrane. To explore the antibacterial potential of 1, we developed a flexible synthetic route allowing for the systematic modification of its structure. From a first set of analogues, structure-activity relationships (SAR) were established for different substitution patterns, and the 14-hydroxylated, bicyclic core (X) of 1 seemed to be the structural prerequisite for DNA gyrase inhibitory activity. The variation of the lactone ring size, however, revealed that activity can be found among 11- to 16-membered lactones, and even seco-analogues were shown to maintain some enzyme inhibitory properties, thereby reducing the minimal structural requirements to a rather simple, hydroxylated benzyl sulfide (XI). On the basis of these "minimal structures" a modification program afforded a number of inhibitors that showed in vitro activity against Gram-positive bacteria. The best activities were displayed by 14-membered lactones, and representatives of this subclass exhibit excellent and broad in vitro antibacterial activity against Gram-positive pathogens, including Staphylococcus aureus, Streptococcus pyogenes, and Enterococcus faecalis, and overcome resistance against clinically used drugs. By improving the pharmacokinetic properties of the most active compounds (94, 97), in particular by lowering their lipophilic properties, we were able to identify congeners of cyclothialidine (1) that showed efficacy in vivo.
• Total Synthesis of Cyclothialidine
  作者：Erwin Götschi、Christian-Johannes Jenny、Peter Reindl、Fabienne Ricklin

  DOI：10.1002/hlca.19960790816

  日期：1996.12.11

  ester derivative 25 thereof and its subsequent coupling with Boc-Ser-Cys-OMe (11); cyclization of the ω-hydroxy acid 2929 to the 12-membered lactone 30 using preferably Mitsunobu conditions; completion of the peptidic side chains of 1 using Boc strategy (Scheme 4). Optically pure cis-N-(tert-butoxycarbonyl)-3-hydroxy-L-proline ((–)-14) was obtained by resolution of the racemate via an efficient reaction

  描述了从硫链霉菌分离出的一种新的DNA促旋酶抑制剂cyclothialidine（1）的总合成。通过制备内酯13（方案2）来测试合成的概念，该内酯13包含特征性双环核心实体1。合成1的关键特征是：通过两个连续的曼尼希氨基甲基化/氢化序列，由3,5-二羟基苯甲酸（19）制备3,5-二羟基-2,6-二甲基苯甲酸（23）；酯衍生物的苄基N-溴琥珀酰亚胺溴化25其及其随后与Boc-Ser-Cys-OMe的偶联（11）；使用优选的Mitsunobu条件将ω-羟基酸29 29环化为12元内酯30；的肽侧链的完成1使用Boc策略（路线4）。通过外消旋物通过含有脂肪酶催化的对映体特异性乙酸酯水解的有效反应序列拆分，得到旋光纯的顺式-N-（叔丁氧基羰基）-3-羟基-L-脯氨酸（（-）- 14）（方案3） 。自然结构1通过与合成材料比较确认。描述的合成路线还提供方便的类似物1，例如经由中间30。