作者:Daniel A. Erlanson、Robert S. McDowell、Molly M. He、Mike Randal、Robert L. Simmons、Jenny Kung、Andrew Waight、Stig K. Hansen
DOI:10.1021/ja034440c
日期:2003.5.1
both a masked thiol and a known pY mimetic. The extender is then cleaved to release the pY mimetic, unmasking the thiol. The resulting protein is screened against a library of disulfide-containing small molecule fragments; any molecules with inherent affinity for the pY binding site will preferentially form disulfides with the extender, allowing for their identification by mass spectrometry. The ability
蛋白质酪氨酸磷酸酶在涉及人类疾病的许多信号级联反应中发挥重要作用。鉴定这些靶标的类药物抑制剂是一项重大挑战,而发现合适的磷酸酪氨酸 (pY) 模拟物仍然是主要困难之一。在这里,我们描述了网络共享技术的扩展,“分离网络共享”,它非常适合发现这种新的化学实体。该方法首先涉及使用包含掩蔽硫醇和已知 pY 模拟物的扩展剂不可逆地修饰蛋白质。然后将扩展剂裂解以释放 pY 模拟物,暴露硫醇。得到的蛋白质针对含有二硫键的小分子片段文库进行筛选;任何对 pY 结合位点具有内在亲和力的分子将优先与扩展剂形成二硫化物,从而可以通过质谱法对其进行鉴定。从已知底物开始的能力最大限度地减少了蛋白质结构的扰动,并增加了使用束缚探测活性位点的机会。我们将这种方法应用于抗糖尿病蛋白 PTP1B,以发现一种 pY 模拟物,它属于一个新的分子类别并以一种新的方式结合。