Binding interaction of quercetin-3-β-galactoside and its synthetic derivatives with SARS-CoV 3CLpro: Structure–activity relationship studies reveal salient pharmacophore features
作者:Lili Chen、Jian Li、Cheng Luo、Hong Liu、Weijun Xu、Gang Chen、Oi Wah Liew、Weiliang Zhu、Chum Mok Puah、Xu Shen、Hualiang Jiang
DOI:10.1016/j.bmc.2006.09.014
日期:2006.12
enzymatic activity of SARS-CoV 3CL(pro) were not affected by the Q189A mutation. With the help of molecular modeling, eight new derivatives of the natural product were designed and synthesized. Bioassay results reveal salient features of the structure-activity relationship of the new compounds: (1) removal of the 7-hydroxy group of the quercetin moiety decreases the bioactivity of the derivatives; (2)
严重急性呼吸综合征相关冠状病毒 (SARS-CoV) 的 3C 样蛋白酶 (3CL(pro)) 是发现抗 SARS 药物最有希望的靶标之一,因为它在病毒生命周期中发挥着关键作用。在这项研究中,通过分子对接、基于 SPR/FRET 的生物测定和诱变研究,一种名为槲皮素-3-β-半乳糖苷的天然化合物被鉴定为蛋白酶的抑制剂。分子模型和 Q189A 突变都表明 Gln189 在结合中起着关键作用。此外,实验证据表明,SARS-CoV 3CL(pro)的二级结构和酶活性不受Q189A突变的影响。在分子建模的帮助下,设计并合成了八种新的天然产物衍生物。生物测定结果揭示了新化合物构效关系的显着特征:(1)槲皮素部分7-羟基的去除降低了衍生物的生物活性;(2)糖部分的乙酰氧基化消除了抑制剂作用;(3)槲皮素7-羟基上引入大的糖取代基是可以耐受的;(4)用其他糖替代半乳糖部分不影响抑制剂效力。这项研究不仅揭示了一类新的化合物作为对抗