2,2'-anhydro-[1-((2S)-2-deoxy-4-thio-β-D-ribofuranosyl)uracil] | 457653-25-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 2,2'-anhydro-[1-((2S)-2-deoxy-4-thio-β-D-ribofuranosyl)uracil]
• 英文别名: 2,2'-O-anhydro-4'-thiouridine；2’,2-anhydro-1’-β-(4’-thio-D-ribofuranosyl)uracil；2,2'-anhydro-4'-thio-uridine；(2R,4R,5S,6S)-5-hydroxy-4-(hydroxymethyl)-7-oxa-3-thia-1,9-diazatricyclo[6.4.0.02,6]dodeca-8,11-dien-10-one
• CAS: 457653-25-7
• 化学式: C₉H₁₀N₂O₄S
• 分子量: 242.255
• InChiKey: JMMQOERRAVCXSS-CCXZUQQUSA-N

物化性质

• 沸点：
  476.5±55.0 °C(Predicted)
• 密度：
  2.01±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.4
• 重原子数：
  16
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  108
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2,2'-anhydro-[1-((2S)-2-deoxy-4-thio-β-D-ribofuranosyl)uracil] 在 lithium benzoate 、 苯甲酸 、 sodium methylate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲醇 为溶剂， 反应 5.0h， 生成 4'-硫代尿苷
  参考文献：
  名称：

  立体选择性合成4'-硫代核苷的β-异头物，基于对4-硫呋喃类化合物糖基的亲电糖基化。

  摘要：

  制备了具有不同3,5-O-甲硅烷基保护基的三种类型的4-硫呋喃基糖，并对其亲电性进行了研究。3,5-双-O-（叔丁基二甲基甲硅烷基）-4-硫呋喃类化合物糖基（5）是通过将2-脱氧-4-硫代-D-赤型戊呋喃糖（4）进行甲磺酸化并随后进行碱促进的消除反应而获得的，热消除亚砜衍生物适用于制备3,5-O-（四异丙基二硅氧烷-1,3-二基）（9）和3,5-O-（二叔丁基亚甲硅烷基）（11）4-硫代缩醛。通过使用尿嘧啶，胸腺嘧啶，胞嘧啶和N（6）-苯甲酰腺嘌呤的甲硅烷基化衍生物，在PhSeCl或NIS存在下，进行这些4-硫代糖基的糖基化反应。在这三种4-硫代糖中，有11种是出色的糖基供体，

  DOI：

  10.1021/jo020037x
• 作为产物：
  描述：

  4'-硫代尿苷 在 碳酸二苯酯 、 碳酸氢钠 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 18.0h， 以98%的产率得到2,2'-anhydro-[1-((2S)-2-deoxy-4-thio-β-D-ribofuranosyl)uracil]
  参考文献：
  名称：

  4'-硫代和4'-亚磺酰嘧啶核苷类似物的化学合成

  摘要：

  核酸合成所需的经典核苷类似物在抗病毒和抗癌研究中长期存在并具有经过验证的能力。 4'-硫代核苷结合了用硫对呋喃糖氧进行生物电子等排替换，代表了该领域的重要化学型。本文建立了针对常见 4-硫代核糖结构单元的合成能力，该结构单元能够获得硫代核糖和硫代阿拉伯嘧啶核苷及其 4'-亚磺酰基衍生物。此外，这种构建块方法被模板化以提供已建立的抗癌药物吉西他滨的 4'-硫代和 4'-亚磺酰基类似物。这些新类似物的细胞毒性能力针对人胰腺癌和人原代胶质母细胞瘤细胞系进行了评估，观察到的活性范围从低μM到％3E200μM；与现有的核苷类似物相比，这种活性降低的解释尚不清楚。获得这些具有硫半胺连接的化学型将能够更广泛地探索嘌呤和三磷酸类似物以及此类材料在核酸生物化学中对相关水解酶的潜在抗性的应用。

  DOI：

  10.1039/d1ob02097h

文献信息

• Synthesis and crystal structure of 2′-deoxy-2′-fluoro-4′-thioribonucleosides: substrates for the synthesis of novel modified RNAs
  作者：Mayumi Takahashi、Shunsuke Daidouji、Motoo Shiro、Noriaki Minakawa、Akira Matsuda

  DOI：10.1016/j.tet.2008.02.071

  日期：2008.5

  the synthesis of appropriately protected 2′-deoxy-2′-fluoro-4′-thiouridine (5), -thiocytidine (7), and -thioadenosine (35) derivatives, substrates for the synthesis of novel modified RNAs. The synthesis of 5 and 7 was achieved via the reaction of 2,2′-O-anhydro-4′-thiouridine (3) with HF/pyridine in a manner similar to that of its 4′-O-congener whereas the synthesis of 35 from 4′-thioadenosine derivatives

  我们在此报告了适当保护的2'-脱氧-2'-氟-4'-硫尿苷（5），-硫胞苷（7）和-硫代腺苷（35）衍生物（合成新型修饰RNA的底物）的合成。合成5和7经由2,2'-的反应实现ø -anhydro -4'-硫代尿苷（3）用HF /吡啶的方式类似于其4'-的ö -congener而合成来自4'-硫代腺苷衍生物的35个未成功。因此，35是通孔的糖基化合成氟化4- thiosugar 25与6-氯嘌呤。X射线晶体结构分析显示2'-脱氧-2'-氟-4'-硫代胞苷（8）主要采用与2'-脱氧-2'-氟胞苷相同的C3'-内构象。
• OLIGOMERIC COMPOUNDS COMPRISING 4'-THIONUCLEOSIDES FOR USE IN GENE MODULATION
  申请人：Bhat Balkrishen

  公开号：US20100324277A1

  公开（公告）日：2010-12-23

  The present invention provides modified oligomeric compounds and compositions of oligomeric compounds for use in the RNA interference pathway of gene modulation. The modified oligomeric compounds include siRNA and asRNA having at least one affinity modification.

  本发明提供了修改的寡核苷酸化合物和寡核苷酸化合物组合物，用于基因调节的RNA干扰途径。修改的寡核苷酸化合物包括至少具有一种亲和力修饰的siRNA和asRNA。
• DAST-Mediated Fluorination of 1-[4-Thio-β-d-arabinofuranosyl]uracil: Investigation of Thiolane vs Thietane Formation and Stereoselective Synthesis of 4′-ThioFAC
  作者：Kazuhiro Haraguchi、Noyori Hannda、Mizuki Wakasugi、Madoka Maruyama、Hirokazu Ishii、Daisuke Nagano、Hiroki Kumamoto

  DOI：10.1055/s-0040-1720042

  日期：2022.12

  target thiolane Ns, ring-contracted thietane Ns, and anhydro Ns products. The reaction pathway was determined by the electronic effect of the protecting groups at the sugar and base moieties. The benzoylated uracil starting material gave the 2,2′-anhydronucleoside (anhydro Ns) as a major product, whereas the silylated and benzylated starting materials furnished the corresponding fluorinated products, in

  前所未有的 DAST 介导 (DAST = 二乙基氨基三氟化硫) 苯甲酰-、TBDPS- 和 Bn- 保护的 1-(β-d检查了糖部分的-4-硫代阿拉伯呋喃糖基）尿嘧啶。形成了三种核苷（Ns）产物：靶硫杂环戊烷Ns、环缩硫杂环丁烷Ns和脱水Ns产物。反应途径由糖和碱基部分的保护基团的电子效应决定。苯甲酰化尿嘧啶原料产生 2,2'-脱水核苷 (anhydro Ns) 作为主要产物，而甲硅烷基化和苄基化原料提供相应的氟化产物，其中主要形成环缩硫杂环丁烷。通过添加吡啶衍生物作为添加剂，可以获得所需的硫杂环戊烷作为主要产物。N 3 -苯甲酰化 1-(β-d-4-硫代阿拉伯呋喃糖基）尿嘧啶与 DAST 在 2,4,6-可力丁存在下，可以以 72% 的分离产率获得目标 2'-deoxy-2'-β-fluoro-4'-thiouracil 核苷以及相应的硫杂环丁烷 Ns (7%) 和脱水 Ns (3%)
• [EN] 4'-THIONUCLEOSIDES AND OLIGOMERIC COMPOUNDS<br/>[FR] 4'-THIONUCLEOSIDES ET COMPOSES D'OLIGOMERES
  申请人：ISIS PHARMACEUTICALS INC

  公开号：WO2005027962A3

  公开（公告）日：2007-07-12
• 4'-THIONUCLEOSIDES AND OLIGOMERIC COMPOUNDS
  申请人：Isis Pharmaceuticals, Inc.

  公开号：EP1677822B1

  公开（公告）日：2014-04-23