6-azido-5'-O-(t-butyldimethylsilyl)-2',3'-O-isopropylideneuridine | 908354-36-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 6-azido-5'-O-(t-butyldimethylsilyl)-2',3'-O-isopropylideneuridine
• 英文别名: 1-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl]-6-azidopyrimidine-2,4-dione
• CAS: 908354-36-9
• 化学式: C₁₈H₂₉N₅O₆Si
• 分子量: 439.544
• InChiKey: YHWHCXUUKCENFD-JUDXGUMMSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.92
• 重原子数：
  30
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.78
• 拓扑面积：
  101
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-azido-5'-O-(t-butyldimethylsilyl)-2',3'-O-isopropylideneuridine 在 吡啶 、 水 、 三氟乙酸 、 三氯氧磷 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 7.0h， 生成 6-azido-5'-UMP
  参考文献：
  名称：

  使用生物等位线置换设计抑烟碱单磷酸脱羧酶抑制剂，并确定抑制动力学。

  摘要：

  酪蛋白单磷酸脱羧酶（ODCase）抑制剂可用于RNA病毒，寄生虫和其他传染病。ODCase催化牛尿苷单磷酸酯（OMP）的脱羧，产生尿苷单磷酸酯（UMP）。根据底物OMP和ODCase抑制剂巴比妥酸单磷酸酯BMP中亚结构的体积设计了新型抑制剂6-氨基-UMP和6-氰基-UMP。为了研究ODCase的抑制动力学，开发了一种使用等温滴定热法（ITC）的新酶分析方法。反应速率是通过监测在酪蛋白单磷酸的酪蛋白的脱羧反应过程中产生的热量来测量的。确定了动力学参数（k（cat）= 21 s（-1），KM = 5 microM）和摩尔焓（DeltaH（app）= 5 kcal / mol），用于通过ODCase进行底物的脱羧。观察到该酶的竞争性抑制，并且对于6-氮杂-UMP和6-氰基-UMP，抑制常数（Ki）被确定为分别为12.4μM和29μM。发现6-氨基-UMP是ODCase的有效抑制剂之一，其抑制常

  DOI：

  10.1021/jm060202r
• 作为产物：
  描述：

  尿嘧啶核苷 在 咪唑 、 sodium azide 、 硫酸 、 碘 、 溶剂黄146 、 lithium diisopropyl amide 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 8.0h， 生成 6-azido-5'-O-(t-butyldimethylsilyl)-2',3'-O-isopropylideneuridine
  参考文献：
  名称：

  NMR-based conformational analysis of 2′,6-disubstituted uridines and antiviral evaluation of new phosphoramidate prodrugs

  摘要：

  Six novel phosphoramidate prodrugs of uridine analogues, with structural modifications introduced at the 6- and 2',6-positions, have been prepared and evaluated for selective antiviral activity against hepatitis C virus, as well as other positive-stranded RNA viruses. An analysis of the conformational properties of the parent nucleosides was carried out using two-dimensional NMR spectroscopy based experiments, highlighting a 3'-endo (North) sugar puckering preference and syn orientation. (C) 2015 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2015.07.003

文献信息

• WO2008/83465
  申请人：——

  公开号：——

  公开（公告）日：——
• WO2007/38859
  申请人：——

  公开号：——

  公开（公告）日：——
• NMR-based conformational analysis of 2′,6-disubstituted uridines and antiviral evaluation of new phosphoramidate prodrugs
  作者：Fábio da Paixão Soares、Elisabetta Groaz、Eveline Lescrinier、Johan Neyts、Pieter Leyssen、Piet Herdewijn

  DOI：10.1016/j.bmc.2015.07.003

  日期：2015.9

  Six novel phosphoramidate prodrugs of uridine analogues, with structural modifications introduced at the 6- and 2',6-positions, have been prepared and evaluated for selective antiviral activity against hepatitis C virus, as well as other positive-stranded RNA viruses. An analysis of the conformational properties of the parent nucleosides was carried out using two-dimensional NMR spectroscopy based experiments, highlighting a 3'-endo (North) sugar puckering preference and syn orientation. (C) 2015 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• Design of Inhibitors of Orotidine Monophosphate Decarboxylase Using Bioisosteric Replacement and Determination of Inhibition Kinetics
  作者：Ewa Poduch、Angelica M. Bello、Sishi Tang、Masahiro Fujihashi、Emil F. Pai、Lakshmi P. Kotra

  DOI：10.1021/jm060202r

  日期：2006.8.1

  Inhibitors of orotidine monophosphate decarboxylase (ODCase) have applications in RNA viral, parasitic, and other infectious diseases. ODCase catalyzes the decarboxylation of orotidine monophosphate (OMP), producing uridine monophosphate (UMP). Novel inhibitors 6-amino-UMP and 6-cyano-UMP were designed on the basis of the substructure volumes in the substrate OMP and in an inhibitor of ODCase, barbituric

  酪蛋白单磷酸脱羧酶（ODCase）抑制剂可用于RNA病毒，寄生虫和其他传染病。ODCase催化牛尿苷单磷酸酯（OMP）的脱羧，产生尿苷单磷酸酯（UMP）。根据底物OMP和ODCase抑制剂巴比妥酸单磷酸酯BMP中亚结构的体积设计了新型抑制剂6-氨基-UMP和6-氰基-UMP。为了研究ODCase的抑制动力学，开发了一种使用等温滴定热法（ITC）的新酶分析方法。反应速率是通过监测在酪蛋白单磷酸的酪蛋白的脱羧反应过程中产生的热量来测量的。确定了动力学参数（k（cat）= 21 s（-1），KM = 5 microM）和摩尔焓（DeltaH（app）= 5 kcal / mol），用于通过ODCase进行底物的脱羧。观察到该酶的竞争性抑制，并且对于6-氮杂-UMP和6-氰基-UMP，抑制常数（Ki）被确定为分别为12.4μM和29μM。发现6-氨基-UMP是ODCase的有效抑制剂之一，其抑制常