Design and development of benzoxazole derivatives with toll-like receptor 9 antagonism
作者:Swarnali Roy、Ayan Mukherjee、Barnali Paul、Oindrila Rahaman、Shounak Roy、Gundaram Maithri、Bandaru Ramya、Sourav Pal、Dipyaman Ganguly、Arindam Talukdar
DOI:10.1016/j.ejmech.2017.03.086
日期:2017.7
numerous inflammatory disorders. Development of small molecule inhibitors for TLR9 remains largely empirical due to lack of structural understanding of potential TLR9 antagonism by small molecules and due to the unusual topology of the ligand binding surface of the receptor. To develop a structural model for rational design of small molecule TLR9 antagonists, an enhanced homology model of human TLR9 (hTLR9)
Toll样受体9(TLR9)是许多炎性疾病的主要治疗靶标。由于缺乏对小分子潜在的TLR9拮抗作用的结构性理解以及受体配体结合表面的异常拓扑结构,因此TLR9小分子抑制剂的开发在很大程度上仍是经验性的。为了开发合理设计小分子TLR9拮抗剂的结构模型,构建了人类TLR9(hTLR9)的增强同源性模型。基于与马和牛TLR9结合的抑制性DNA(iDNA)的晶体结构,对一系列具有特征分子几何结构,柔性和碱性的分子进行结合模式分析。已确定与TLR9四个富亮氨酸重复序列(LRR)区域中特定氨基酸残基的相互作用对于小分子的拮抗作用至关重要。TLR9拮抗作用的生物学验证及其与探针-受体相互作用的相关性导致了一个可靠的模型,该模型可用于开发具有强TLR9拮抗作用的新型小分子(IC50 30-100 nM),并对TLR7具有出色的选择性。