hexaprenyl diphosphate | 207513-95-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 异戊烯醇脂质
• 英文名称: hexaprenyl diphosphate
• 英文别名: All-trans-hexaprenyl diphosphate；[(2E,6E,10E,14E,18E)-3,7,11,15,19,23-hexamethyltetracosa-2,6,10,14,18,22-hexaenyl] phosphono hydrogen phosphate
• CAS: 207513-95-9
• 化学式: C₃₀H₅₂O₇P₂
• 分子量: 586.686
• InChiKey: NGFSMHKFTZROKJ-MMSZMYIBSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  8.1
• 重原子数：
  39
• 可旋转键数：
  20
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  113
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  hexaprenyl diphosphate 在 Colletotrichum gloeosporioides colleterpenol synthase 作用下， 生成 colleterpenol
  参考文献：
  名称：

  发现非角鲨烯三萜

  摘要：

  所有已知的三萜类化合物均由来自角鲨烯或氧化角鲨烯1的三萜合酶 (TrTSs) 生成。这种方法与由聚异戊二烯二磷酸酯2,3,4形成的短链 (C 10 –C 25 ) 萜烯的生物合成有根本的不同。在这项研究中，两种真菌嵌合 I 类 TrTS，疣状踝节菌 talaropentaene 合酶 (TvTS) 和 Macrophomina phaseolinamacrophomene 合酶 (MpMS)，进行了表征。这两种酶都使用二甲基烯丙基二磷酸酯和异戊烯二磷酸酯或六戊二烯二磷酸酯作为底物，据我们所知，代表了非角鲨烯依赖性三萜生物合成的第一个例子。在同位素标记实验中研究了 TvTS 和 MpMS 的环化机制及其产物的绝对构型。TvTS 和全长 MpMS 的萜烯环化酶结构域的结构分析提供了对其催化机制的详细见解。开发了基于 AlphaFold2 的筛选平台来挖掘第三种 TrTS，胶孢炭疽菌colleterpenol

  DOI：

  10.1038/s41586-022-04773-3
• 作为产物：
  描述：

  3-甲基丁-2-烯基膦酰磷酸氢酯 、 二磷酸 P-(3-甲基-3-丁烯-1-基)酯 在 prenyl transferase 作用下， 生成 hexaprenyl diphosphate
  参考文献：
  名称：

  发现非角鲨烯三萜

  摘要：

  所有已知的三萜类化合物均由来自角鲨烯或氧化角鲨烯1的三萜合酶 (TrTSs) 生成。这种方法与由聚异戊二烯二磷酸酯2,3,4形成的短链 (C 10 –C 25 ) 萜烯的生物合成有根本的不同。在这项研究中，两种真菌嵌合 I 类 TrTS，疣状踝节菌 talaropentaene 合酶 (TvTS) 和 Macrophomina phaseolinamacrophomene 合酶 (MpMS)，进行了表征。这两种酶都使用二甲基烯丙基二磷酸酯和异戊烯二磷酸酯或六戊二烯二磷酸酯作为底物，据我们所知，代表了非角鲨烯依赖性三萜生物合成的第一个例子。在同位素标记实验中研究了 TvTS 和 MpMS 的环化机制及其产物的绝对构型。TvTS 和全长 MpMS 的萜烯环化酶结构域的结构分析提供了对其催化机制的详细见解。开发了基于 AlphaFold2 的筛选平台来挖掘第三种 TrTS，胶孢炭疽菌colleterpenol

  DOI：

  10.1038/s41586-022-04773-3

文献信息

• [EN] N-GLYCOSYLATION OF PEPTIDES AND PROTEINS<br/>[FR] N-GLYCOSYLATION DE PEPTIDES ET DE PROTÉINES
  申请人：ISIS INNOVATION

  公开号：WO2015056011A1

  公开（公告）日：2015-04-23

  A process for the production of a glycoconjugate by N-glycosylation of a protein or peptide comprising the sequence D/E-X-N-X-S/T, wherein each X is the same or different and is any natural amino acid other than proline, wherein the process comprises reacting the protein or peptide with a polyisoprenyl pyrophosphate of formula (I), or a salt thereof, in the presence of PglB: (I) to produce the glycoconjugate comprising the protein or peptide having a saccharide [SI] linked to the asparagine in the sequence D/E-X-N-X-S/T. Polyisoprenylpyrophosphates used as substrates in the biocatalytic process are also provided, as well as certain glycoconjugates.

  一种通过蛋白质或肽的N-糖基化制备糖蛋白的方法，所述蛋白质或肽包括序列D/E-X-N-X-S/T，其中每个X相同或不同，是任何天然氨基酸，但不包括脯氨酸，该方法包括将蛋白质或肽与式(I)的聚异戊二烯基焦磷酸盐或其盐在PglB的存在下反应，以产生包含与序列D/E-X-N-X-S/T中的天冬氨酸连接的糖蛋白。还提供了作为生物催化过程中底物使用的聚异戊二烯基焦磷酸盐，以及某些糖蛋白。
• METHODS OF GENERATING PROTEIN VARIANTS
  申请人：KEASLING JAY D.

  公开号：US20080318292A1

  公开（公告）日：2008-12-25

  The present invention provides methods of designing and generating polypeptide variants that have altered properties compared to a parent polypeptide. The present invention further provides a computer program product for carrying out the design of a variant polypeptide. The present invention further provides nucleic acids encoding enzyme variants, as well as vectors and host cells comprising the nucleic acids. The present invention further provides variant enzymes; methods of producing the variant enzymes; and methods of producing compounds using the enzymes.

  本发明提供了设计和生成多肽变体的方法，这些变体与母体多肽相比具有改变的性质。本发明还提供了用于进行变体多肽设计的计算机程序产品。本发明还提供了编码酶变体的核酸，以及包含这些核酸的载体和宿主细胞。本发明还提供了变体酶；制备变体酶的方法；以及使用这些酶制备化合物的方法。
• Methods of producing prenyl alcohols
  申请人：Ohto Chikara

  公开号：US20070087425A1

  公开（公告）日：2007-04-19

  A method of producing a prenyl alcohol, comprising creating a recombinant by transferring into a host a recombinant DNA for expression or a DNA for genomic integration each comprising a prenyl diphosphate synthase gene or a mutant thereof, culturing the resultant recombinant, and recovering the prenyl alcohol from the resultant culture.

  一种制备异戊烯醇的方法，包括通过将编码异戊烯二磷酸合酶基因或其突变体的重组DNA转移至宿主细胞中，或者将编码异戊烯二磷酸合酶基因或其突变体的基因组整合DNA转移至宿主细胞中，从而创建重组体，培养所得的重组体，从所得的培养物中回收异戊烯醇。
• POLYNUCLEOTIDES ENCODING ISOPRENOID MODIFYING ENZYMES AND METHODS OF USE THEREOF
  申请人：Ro Dae-Kyun

  公开号：US20100218283A1

  公开（公告）日：2010-08-26

  The present invention provides isolated nucleic acids comprising nucleotide sequences encoding isoprenoid modifying enzymes, as well as recombinant vectors comprising the nucleic acids. The present invention further provides genetically modified host cells comprising a subject nucleic acid or recombinant vector. The present invention further provides a transgenic plant comprising a subject nucleic acid. The present invention further provides methods of producing an isoprenoid compound, the method generally involving culturing a subject genetically modified host cell under conditions that permit synthesis of an isoprenoid compound modifying enzyme encoded by a subject nucleic acid.

  本发明提供了包含编码异戊二烯修饰酶的核酸序列的分离核酸，以及包含该核酸的重组载体。本发明还提供了含有所述核酸或重组载体的基因改造宿主细胞。本发明还提供了含有所述核酸的转基因植物。本发明还提供了生产异戊二烯类化合物的方法，通常包括在条件允许的情况下培养含有由所述核酸编码的异戊二烯类化合物修饰酶的主体基因改造宿主细胞。
• Heptaprenyl diphosphate synthesizing enzyme and dna encoding same
  申请人：TOYOTA JIDOSHA KABUSHIKI KAISHA

  公开号：EP0699761A2

  公开（公告）日：1996-03-06

  Heptaprenyl diphosphate (HDP)-synthetase derived from Bacillus stearothermophilus which enzymes have the amino acid sequences shown as SEQ ID NOs: 1 to 3; 1 and 2; 2 and 3; or 1 and 3, DNA encoding them, and a method of producing the enzymes. According to the invention it is possible to industrially produce HDP-synthesizing enzyme and HPD.

  二磷酸庚烯酯(HDP)合成酶(HDP-synttheaSE)，其来源于嗜硬热菌(Bacillus stearothermophilus)，该酶具有SEQ ID NOs所示的氨基酸序列：1至3；1和2；2和3；或1和3；编码它们的DNA；以及生产该酶的方法。 根据本发明，可以工业化生产HDP合成酶和HPD。