5-[3-(trifluoroacetamido)propynyl]cytidine | 480439-97-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 5-[3-(trifluoroacetamido)propynyl]cytidine
• 英文别名: 5-[3-(Trifluoroacetamido)propynyl]cytidine；N-[3-[4-amino-1-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-2-oxopyrimidin-5-yl]prop-2-ynyl]-2,2,2-trifluoroacetamide
• CAS: 480439-97-2
• 化学式: C₁₄H₁₅F₃N₄O₆
• 分子量: 392.292
• InChiKey: YMUJYCHHEUHPFP-TURQNECASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.8
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  158
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-[3-(trifluoroacetamido)propynyl]cytidine 在 三乙基硅烷 、 ammonium hydroxide 、 palladium hydroxide, 20 wt% on carbon 作用下， 以 甲醇 、 水 为溶剂， 反应 27.0h， 生成 5-(3-aminopropyl)cytidine
  参考文献：
  名称：

  Site-specific fluorescence labelling of RNA using bio-orthogonal reaction of trans-cyclooctene and tetrazine

  摘要：

  一种带有trans-环辛烯基团修饰的胞嘧啶三磷酸核苷类似物被通过体外转录嵌入miR-122的序列中。

  DOI：

  10.1039/c4cc02435d
• 作为产物：
  描述：

  N-三氟乙酰基炔丙基胺 、 5-碘胞苷 在 copper(l) iodide 、 四(三苯基膦)钯 、 三乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 18.0h， 以85%的产率得到5-[3-(trifluoroacetamido)propynyl]cytidine
  参考文献：
  名称：

  Site-specific fluorescence labelling of RNA using bio-orthogonal reaction of trans-cyclooctene and tetrazine

  摘要：

  一种带有trans-环辛烯基团修饰的胞嘧啶三磷酸核苷类似物被通过体外转录嵌入miR-122的序列中。

  DOI：

  10.1039/c4cc02435d

文献信息

• MODIFIED NUCLEOTIDES METHODS AND KITS
  申请人：Etienne Christopher L.

  公开号：US20120252691A1

  公开（公告）日：2012-10-04

  Modified nucleotides, and methods to modify nucleotides with a moiety or label, such as biotin, that permits their detection and results in a modified nucleotide, and methods of use of the modified nucleotide in quantitative and qualitative assays.

  修饰核苷酸及其修饰方法，使用含有生物素等标记的基团修饰核苷酸，使其能够被检测，从而得到修饰后的核苷酸，并且使用修饰后的核苷酸进行定量和定性分析的方法。
• Modified Nucleotides Methods and Kits
  申请人：Pierce Biotechnology, Inc.

  公开号：EP2669291A1

  公开（公告）日：2013-12-04

  Modified nucleotides, and methods to modify nucleotides with a moiety or label, such as biotin, that permits their detection and results in a modified nucleotide, and methods of use of the modified nucleotide in quantitative and qualitative assays. The modified nucleotide compound having the structure (I): (P1)(P2)-Nucleoside(Nus)-Connecting Group (Alk)-Linking Group (Lnk)-Observable Label (Obs) (I).

  修改核苷酸，以及使用可以检测它们并导致修改核苷酸的基团或标签（例如生物素）来修改核苷酸的方法，以及在定量和定性分析中使用修改核苷酸的方法。具有结构（I）的修改核苷酸化合物：（P1）（P2）-核苷（Nus）-连接基团（Alk）-连接基团（Lnk）-可观察标签（Obs）（I）。
• MODIFIED NUCLEOTIDES
  申请人：Opperman Kay

  公开号：US20110262917A1

  公开（公告）日：2011-10-27

  Modified nucleotides, and methods to modify nucleotides with a moiety or label, such as biotin, that permits their detection and results in a modified nucleotide, and methods of use of the modified nucleotide in quantitative and qualitative assays.

  修改核苷酸，以及使用分子或标记（如生物素）修饰核苷酸的方法，使其能够被检测并产生修改的核苷酸，以及在定量和定性分析中使用修改的核苷酸的方法。
• Modified nucleotides
  申请人：Opperman Kay

  公开号：US08536323B2

  公开（公告）日：2013-09-17

  Modified nucleotides, and methods to modify nucleotides with a moiety or label, such as biotin, that permits their detection and results in a modified nucleotide, and methods of use of the modified nucleotide in quantitative and qualitative assays.

  修改核苷酸及其修饰方法，其中修饰物或标签（如生物素）使其可以检测，并导致修改后的核苷酸，并且使用修改后的核苷酸进行定量和定性分析的方法。
• Modified nucleotides methods and kits
  申请人：Etienne Christopher L.

  公开号：US09206216B2

  公开（公告）日：2015-12-08

  Modified nucleotides, and methods to modify nucleotides with a moiety or label, such as biotin, that permits their detection and results in a modified nucleotide, and methods of use of the modified nucleotide in quantitative and qualitative assays.

  修改核苷酸及其修饰方法，包括使用生物素等标记或基团修饰核苷酸以便检测，从而得到修饰的核苷酸，以及利用修饰的核苷酸进行定量和定性检测的方法。