A computational and laboratory approach for the investigation of interactions of peptide conjugated natural terpenes with EpHA2 receptor
作者:Beatriz G. Goncalves、Ipsita A. Banerjee
DOI:10.1007/s00894-023-05596-3
日期:2023.7
anticancer properties were conjugated with short peptides YSAYP and SWLAY that are known to bind to the LBD of EphA2 receptor. We examined the binding interactions of six terpenes (maslinic acid, levopimaric acid, quinopimaric acid, oleanolic, polyalthic, and hydroxybetulinic acid) conjugated to the above peptides with the ligand-binding domain (LBD) of EphA2 receptor computationally. Additionally, following
语境 Ephrin A 型受体 2 (EphA2) 是众所周知的癌症治疗药物靶点,因为它在多种类型的癌症中过度表达。因此,通过靶向方法确定该受体与配体结合域(LBD)和激酶结合域(KBD)的结合相互作用以调节其活性至关重要。在这项工作中,具有固有抗癌特性的天然萜烯与已知可与 EphA2 受体的 LBD 结合的短肽 YSAYP 和 SWLAY 缀合。我们通过计算检查了与上述肽缀合的六种萜烯(山楂酸、左旋海松酸、喹海松酸、齐墩果酸、多元醇和羟基桦木酸)与 EphA2 受体配体结合域 (LBD) 的结合相互作用。此外,按照“目标跳跃方法”,“我们还研究了缀合物与大骨节病的相互作用。我们的结果表明,与 LBD 相比,大多数缀合物与 EphA2 激酶结构域表现出更高的结合相互作用。此外,当肽与萜烯缀合时,萜烯的结合亲和力增加。为了进一步研究 EphA2 激酶结构域的特异性,我们还检查了与 VPWXE(x