9-{2,6-anhydro-3-O-benzyl-4-[(benzyloxy)methyl]-5-deoxy-α-L-lyxo-hexofuranosyl}-N-benzoyl-9H-purin-6-amine | 287737-41-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 9-{2,6-anhydro-3-O-benzyl-4-[(benzyloxy)methyl]-5-deoxy-α-L-lyxo-hexofuranosyl}-N-benzoyl-9H-purin-6-amine
• 英文别名: 3',5'-di-O-benzyl-2'-O,4'-C-ethylene-6-N-benzoyladenosine；N-[9-[(1R,5R,7R,8S)-8-phenylmethoxy-5-(phenylmethoxymethyl)-2,6-dioxabicyclo[3.2.1]octan-7-yl]purin-6-yl]benzamide
• CAS: 287737-41-1
• 化学式: C₃₃H₃₁N₅O₅
• 分子量: 577.64
• InChiKey: QXABOQRJRHTIGF-LNXLNJASSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.6
• 重原子数：
  43
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.27
• 拓扑面积：
  110
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  9-{2,6-anhydro-3-O-benzyl-4-[(benzyloxy)methyl]-5-deoxy-α-L-lyxo-hexofuranosyl}-N-benzoyl-9H-purin-6-amine 在 三氯化硼 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 以1.01 kg的产率得到9-[2,6-anhydro-5-deoxy-4-(hydroxymethyl)-α-L-lyxo-hexofuranosyl]-N-benzoyl-9H-purin-6-amine
  参考文献：
  名称：

  2'-O,4'-C-乙烯桥联核酸 (ENA) 亚磷酰胺的高效发散合成

  摘要：

  2'- O ,4'- C-乙烯桥连核酸（ENA）亚磷酰胺是第一三共发现的极具前景的修饰核酸单体。为了提高生产效率，我们开发了一种高效的 ENA 亚磷酰胺合成方法。新合成路线的基本概念是“发散合成”，用于制备 A、G、C 和 T 四种单体。我们应用立体选择性糖基化反应，不利用相邻基团参与，在下游设置共同的中间体的路线。

  DOI：

  10.1021/acs.oprd.2c00013
• 作为产物：
  描述：

  N6-苯甲酰基腺嘌呤 在 吡啶 、 三氟甲磺酸三甲基硅酯 、 四丁基氟化铵 、 甲基磺酰氯 、 六甲基二硅氮烷 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 甲苯 为溶剂， 反应 26.17h， 生成 9-{2,6-anhydro-3-O-benzyl-4-[(benzyloxy)methyl]-5-deoxy-α-L-lyxo-hexofuranosyl}-N-benzoyl-9H-purin-6-amine
  参考文献：
  名称：

  改进的 2'-O,4'-C-乙烯核酸 (ENA) 合成和含有鸟苷 ENA 单元的双链体形成的热力学研究

  摘要：

  摘要 含有 2'-O,4'-C-乙烯核酸 (ENA) 的寡核苷酸已被证明对反义治疗非常有效。2'-O,4'-C-亚乙基鸟苷及其亚磷酰胺先前是从 3,5-di-O-benzy1-4-C-(p-tollulenesulfonyloxyethyl)-1,2-di-O-acetyl-α- D-呋喃戊糖通过糖基化，但效率有限。使用 3,5-di-O-benzy1-4-C-(2-t-butyldiphenylsilyloxyethyl)-1,2-di-O-acetyl-α-D-erythropentofuranose 作为替代底物，我们开发了几种方法来获得 2 '-O,4'-C-亚乙基鸟苷衍生物的产率比以前报道的高得多。这些方法也适用于合成 2'-O,4'-C-亚乙基腺苷和 2'-O,4'-C-乙烯-5-甲基尿苷衍生物。此外，我们研究了含有 2'-O 的 DNA 链的热力学益处，与互补 RNA 形成双链体期间的

  DOI：

  10.1080/15257770.2019.1708389

文献信息

• Synthesis and properties of 2′-O,4′-C-Ethylene-Bridged nucleic acids (ENA) as effective antisense oligonucleotides
  作者：Koji Morita、Miho Takagi、Chikako Hasegawa、Masakatsu Kaneko、Shinya Tsutsumi、Junko Sone、Tomio Ishikawa、Takeshi Imanishi、Makoto Koizumi

  DOI：10.1016/s0968-0896(03)00115-9

  日期：2003.5

  bridged nucleic acids (2',4'-BNA) or locked nucleic acids (LNA). Both the 2'-O,4'-C-ethylene- and propylene-linkage within these nucleosides restrict the sugar puckering to the N-conformation of RNA as do 2',4'-BNA/LNA. Furthermore, ethylene-bridged nucleic acids (ENA) having 2'-O,4'-C-ethylene nucleosides had considerably increased the affinity to complementary RNA, and were as high as that of 2',4'-BNA/LNA

  合成了新型双环核苷，2'-O，4'-C-乙烯核苷和2'-O，4'-C-丙烯核苷，作为反义寡核苷酸的构建基块，以进一步优化2'-O，4'-桥连核酸（2'，4'-BNA）或锁定核酸（LNA）的C-亚甲基键。这些核苷中的2'-O，4'-C-乙烯-和丙烯键都将糖的褶皱限制为RNA的N-构象，就像2'，4'-BNA / LNA一样。此外，具有2'-O，4'-C-乙烯核苷的乙烯桥连核酸（ENA）大大提高了对互补RNA的亲和力，并且与2'，4'-BNA / LNA（DeltaT （m）＝ + 3，每次修改约5摄氏度。另一方面，添加2'-O，4' 寡核苷酸中的-C-丙烯修饰导致与互补RNA的亲和力降低。至于对核酸酶的稳定性，在寡核苷酸中掺入一个2'-O，4'-C-乙烯或一个2'-O，4'-C-丙烯核苷可显着提高其对核酸外切酶的抗性至大于2'的程度。 ，4'-BNA / LNA。这些结果表明ENA比2'，4'-BNA
• INTERMEDIATE FOR PRODUCTION OF NUCLEOSIDE ANALOGUE, AND METHOD FOR PRODUCING SAME
  申请人：Daiichi Sankyo Company, Limited

  公开号：EP2862868B1

  公开（公告）日：2020-04-08
• NOVEL NUCLEOSIDES AND OLIGONUCLEOTIDE ANALOGUES
  申请人：Daiichi Sankyo Company, Limited

  公开号：EP1152009B2

  公开（公告）日：2017-09-06
• Intermediate for Production of Nucleoside Analog and Method for Producing the Same
  申请人：Daiichi Sankyo Company, Limited

  公开号：US20150152132A1

  公开（公告）日：2015-06-04

  A compound represented by the general formula (III) which serves as an intermediate of an oligonucleotide analog having stable and excellent antisense or antigene activity or having excellent activity as a detection reagent (probe) for a specific gene or as a primer for the initiation of amplification of a specific gene can be produced at high yields regardless of the type of nucleobase by a method comprising reacting a compound represented by the general formula (II) or a salt thereof with a trimethylsilylated compound obtained from a compound represented by the general formula (IVb), wherein X, Y, Z, A, R, and B are as defined in claim 1.
• US9738681B2
  申请人：——

  公开号：US9738681B2

  公开（公告）日：2017-08-22