(2R,3R,4S,5S)-4-Aminomethyl-5-hydroxymethyl-2-[6-(3-iodo-benzylamino)-purin-9-yl]-tetrahydro-furan-3-ol | 522607-99-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: (2R,3R,4S,5S)-4-Aminomethyl-5-hydroxymethyl-2-[6-(3-iodo-benzylamino)-purin-9-yl]-tetrahydro-furan-3-ol
• 英文别名: (2R,3R,4S,5S)-2-(6-(3-iodobenzylamino)-9H-purin-9-yl)-4-(aminomethyl)-5-(hydroxymethyl)-tetrahydrofuran-3-ol；(2R,3R,4S,5S)-4-(aminomethyl)-5-(hydroxymethyl)-2-[6-[(3-iodophenyl)methylamino]purin-9-yl]oxolan-3-ol
• CAS: 522607-99-4
• 化学式: C₁₈H₂₁IN₆O₃
• 分子量: 496.308
• InChiKey: WNYCSKXAMBKIQP-HOPMXRPOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.8
• 重原子数：
  28
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.39
• 拓扑面积：
  131
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  乙酰氯 、 (2R,3R,4S,5S)-4-Aminomethyl-5-hydroxymethyl-2-[6-(3-iodo-benzylamino)-purin-9-yl]-tetrahydro-furan-3-ol 在 sodium acetate 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 为溶剂， 反应 6.0h， 以63%的产率得到N-{(2S,3S,4R,5R)-4-Hydroxy-2-hydroxymethyl-5-[6-(3-iodo-benzylamino)-purin-9-yl]-tetrahydro-furan-3-ylmethyl}-acetamide
  参考文献：
  名称：

  Exploring human adenosine A3 receptor complementarity and activity for adenosine analogues modified in the ribose and purine moiety

  摘要：

  In this paper we investigated the influence on affinity, selectivity and intrinsic activity upon modification of the adenosine agonist scaffold at the 3- and 5'-positions of the ribofuranosyl moiety and the 2- and N-6-positions of the purine base. This resulted in the synthesis of various analogues, that is, 3-12 and 24-33, with good hA(3)AR selectivity and moderate-to-high affinities (as in 32, K-i = 27 nM). Interesting was the ability to tune the intrinsic activity depending on the substituent introduced at the 3'-position. (C) 2004 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2004.11.044
• 作为产物：
  描述：

  [(3aR,5S,6R,6aR)-6-(azidomethyl)-2,2-dimethyl-3a,5,6,6a-tetrahydrofuro[2,3-d][1,3]dioxol-5-yl]methoxy-tert-butyl-dimethylsilane 在 吡啶 、 甲醇 、 三氟甲磺酸三甲基硅酯 、 四丁基氟化铵 、 氨 、 溶剂黄146 、 三乙胺 、 三苯基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醇 、 1,2-二氯乙烷 为溶剂， 反应 133.0h， 生成 (2R,3R,4S,5S)-4-Aminomethyl-5-hydroxymethyl-2-[6-(3-iodo-benzylamino)-purin-9-yl]-tetrahydro-furan-3-ol
  参考文献：
  名称：

  模拟腺苷受体：比较 A2A 激动剂和拮抗剂的结合域。

  摘要：

  人类 A(2A) 腺苷受体 (AR) 及其对接配体的三维模型是通过与视紫质的同源性构建的，并通过定点诱变和化学互补激动剂的合成进行验证。通过使用 FlexiDock 自动对接程序和手动调整，比较了 A(2A)AR 拮抗剂和激动剂的不同结合模式。激动剂 NECA 3 中的 9H-嘌呤环和拮抗剂 CGS15943 1 中的 1H-[1,2,4] 三唑并[1,5-c] 喹唑啉环的推定结合区域重叠，并且每个的环外氨基都是 H-键合到 N(6.55) 的侧链。对于结合激动剂，核糖 3'-和 5'-取代基与亲水性氨基酸 T(3.36)、S(7.42) 和 H(7.43) 以及 5' 末端甲基之间形成 H 键 -尿醛酰胺与 F(6.44) 的疏水侧链相互作用。激动剂复合物的形成破坏了 A(2A)AR 的基态结构，该结构通过跨膜螺旋结构域 (TM) 区域中的氢键和疏水相互作用网络稳定，促进激活后的构象变化。TM6

  DOI：

  10.1021/jm0300431

文献信息

• Exploring human adenosine A3 receptor complementarity and activity for adenosine analogues modified in the ribose and purine moiety
  作者：Philippe Van Rompaey、Kenneth A. Jacobson、Ariel S. Gross、Zhan-Guo Gao、Serge Van Calenbergh

  DOI：10.1016/j.bmc.2004.11.044

  日期：2005.2

  In this paper we investigated the influence on affinity, selectivity and intrinsic activity upon modification of the adenosine agonist scaffold at the 3- and 5'-positions of the ribofuranosyl moiety and the 2- and N-6-positions of the purine base. This resulted in the synthesis of various analogues, that is, 3-12 and 24-33, with good hA(3)AR selectivity and moderate-to-high affinities (as in 32, K-i = 27 nM). Interesting was the ability to tune the intrinsic activity depending on the substituent introduced at the 3'-position. (C) 2004 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• Modeling the Adenosine Receptors:  Comparison of the Binding Domains of A_2A Agonists and Antagonists
  作者：Soo-Kyung Kim、Zhan-Guo Gao、Philippe Van Rompaey、Ariel S. Gross、Aishe Chen、Serge Van Calenbergh、Kenneth A. Jacobson

  DOI：10.1021/jm0300431

  日期：2003.11.1

  and validated with site-directed mutagenesis and the synthesis of chemically complementary agonists. Different binding modes of A(2A)AR antagonists and agonists were compared by using the FlexiDock automated docking procedure, with manual adjustment. Putative binding regions for the 9H-purine ring in agonist NECA 3 and the 1H-[1,2,4]triazolo[1,5-c]quinazoline ring in antagonist CGS15943 1 overlapped

  人类 A(2A) 腺苷受体 (AR) 及其对接配体的三维模型是通过与视紫质的同源性构建的，并通过定点诱变和化学互补激动剂的合成进行验证。通过使用 FlexiDock 自动对接程序和手动调整，比较了 A(2A)AR 拮抗剂和激动剂的不同结合模式。激动剂 NECA 3 中的 9H-嘌呤环和拮抗剂 CGS15943 1 中的 1H-[1,2,4] 三唑并[1,5-c] 喹唑啉环的推定结合区域重叠，并且每个的环外氨基都是 H-键合到 N(6.55) 的侧链。对于结合激动剂，核糖 3'-和 5'-取代基与亲水性氨基酸 T(3.36)、S(7.42) 和 H(7.43) 以及 5' 末端甲基之间形成 H 键 -尿醛酰胺与 F(6.44) 的疏水侧链相互作用。激动剂复合物的形成破坏了 A(2A)AR 的基态结构，该结构通过跨膜螺旋结构域 (TM) 区域中的氢键和疏水相互作用网络稳定，促进激活后的构象变化。TM6