N2-Tac-dG | 149989-40-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: N2-Tac-dG
• 英文别名: N-(tert-butyl-phenoxyacetyl)-2'-deoxy-guanosine；N2-((4-tertbutylphenoxy)acetyl)-2'-deoxyguanosine；2-(4-tert-butylphenoxy)-N-[9-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-6-oxo-1H-purin-2-yl]acetamide
• CAS: 149989-40-2
• 化学式: C₂₂H₂₇N₅O₆
• 分子量: 457.486
• InChiKey: HDGGLYASKUSLNP-ZMSDIMECSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.8
• 重原子数：
  33
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  147
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N2-Tac-dG 在 吡啶 、 Novozym 435 、 (benzotriazo-1-yloxy)tris(dimethylamino)phosphonium hexafluorophosphate 、 溶剂黄146 、 三乙胺 、 肼 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 35.92h， 生成 2'-deoxy-N2,3'-O-bis-[[4-tert-butylphenoxy]-acetyl]-guanosine
  参考文献：
  名称：

  Bis-Tac-dG 公斤级生产路线的开发：瓜地他滨的基本组成部分

  摘要：

  瓜德西他滨 (SGI-110) 是一种二核苷酸，是地西他滨的前药。该二核苷酸包含地西他滨（顶部片段）和 2'-脱氧鸟苷（9；dG；底部片段）通过 3' → 5' 磷酸二酯键连接。瓜地西他滨的制造过程需要大量的 N 2 , 3'-O-(4-叔丁基苯氧基乙酰基)-保护的 dG (2; Bis-Tac-dG) 以掺入底部片段。受保护的2是二核苷酸的关键起始材料，对其合成和分离提出了严格的质量要求。本文介绍的是从商业 dG 开始的化合物 2 的实用且可扩展的路线的开发工作。该方法的显着特点包括用 4,4'-二甲氧基三苯甲基 (DMT) 基团以及随后的 3'-O- 对 N 2 -Tac-dG (3) 的 5'-OH 基团进行一锅保护。 Tac 保护为 dG 8 提供全面保护，从而通过更少的分离步骤缩短循环时间并降低溶剂使用量。随后，利用 NaIO 4 从 8 中裂解 DMT 基团，实现了温和、高选择性和稳健的路线，以公斤级生产高纯度

  DOI：

  10.1021/acs.oprd.4c00073
• 作为产物：
  描述：

  2'-脱氧鸟苷 在 吡啶 、 三乙胺 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 10.5h， 生成 N2-Tac-dG
  参考文献：
  名称：

  Bis-Tac-dG 公斤级生产路线的开发：瓜地他滨的基本组成部分

  摘要：

  瓜德西他滨 (SGI-110) 是一种二核苷酸，是地西他滨的前药。该二核苷酸包含地西他滨（顶部片段）和 2'-脱氧鸟苷（9；dG；底部片段）通过 3' → 5' 磷酸二酯键连接。瓜地西他滨的制造过程需要大量的 N 2 , 3'-O-(4-叔丁基苯氧基乙酰基)-保护的 dG (2; Bis-Tac-dG) 以掺入底部片段。受保护的2是二核苷酸的关键起始材料，对其合成和分离提出了严格的质量要求。本文介绍的是从商业 dG 开始的化合物 2 的实用且可扩展的路线的开发工作。该方法的显着特点包括用 4,4'-二甲氧基三苯甲基 (DMT) 基团以及随后的 3'-O- 对 N 2 -Tac-dG (3) 的 5'-OH 基团进行一锅保护。 Tac 保护为 dG 8 提供全面保护，从而通过更少的分离步骤缩短循环时间并降低溶剂使用量。随后，利用 NaIO 4 从 8 中裂解 DMT 基团，实现了温和、高选择性和稳健的路线，以公斤级生产高纯度

  DOI：

  10.1021/acs.oprd.4c00073

文献信息

• [EN] DIARYLSULPHID BACKBONE CONTAINING PHOTOLABILE PROTECTING GROUPS<br/>[FR] GROUPES PROTECTEURS PHOTOLABILES CONTENANT UN SQUELETTE DIARYSULFURE
  申请人：NIMBLEGEN SYSTEMS GMBH

  公开号：WO2012136604A1

  公开（公告）日：2012-10-11

  The present invention relates to photoactivable protecting groups containing a diarylsulphid chromophore, a method for the synthesis thereof and their use as photoactivable protecting groups using maskless photolithography based array synthesis. wherein R2 is [Formula II] or wherein R2 is [Formula III] or [Formula IV] wherein R7 is a natural amino acid, a non-natural amino acid or an amino acid derivative forming an urethan bond to formula Ib, or wherein formula IV represents the carboxy function of a natural amino acid, a non-natural amino acid or an amino acid derivative, forming an ester bond to formula Ib.

  本发明涉及含有二芳基硫代色素基团的光活化保护基团，以及它们的合成方法和它们作为光活化保护基团使用的方法，使用基于无遮罩光刻的阵列合成。其中R2为[Formula II]或R2为[Formula III]或[Formula IV]，其中R7是天然氨基酸、非天然氨基酸或与公式Ib形成脲键的氨基酸衍生物，或者其中公式IV代表天然氨基酸、非天然氨基酸或氨基酸衍生物的羧基，形成与公式Ib的酯键。
• [EN] DINUCLEOSIDE DERIVATIVES AS PRODRUGS OF GEMCITABINE AND CYTARABINE<br/>[FR] DÉRIVÉS DE DINUCLÉOSIDES SOUS FORME DE PROMÉDICAMENTS À BASE DE GEMCITABINE ET DE CYTARABINE
  申请人：ASTEX THERAPEUTICS LTD

  公开号：WO2015044365A1

  公开（公告）日：2015-04-02

  The invention provides a compound of the formula (1): or a salt or tautomer thereof, wherein either (i) R1 is hydroxy and R2 is hydrogen; or (ii) R1 and R2 are both fluorine; and R3 is hydroxy or a group that is convertible under physiological conditions to hydroxy. Also provided are pharmaceutical compositions containing the compounds of formula (1) and the use of the compounds in medicine. The compounds can be used for the treatment of proliferative diseases such as cancer.

  本发明提供了一个公式（1）的化合物：或其盐或互变异构体，其中（i）R1为羟基，R2为氢；或（ii）R1和R2都为氟；且R3为羟基或在生理条件下可转化为羟基的基团。还提供了含有公式（1）化合物的药物组合物以及化合物在医学上的应用。该化合物可用于治疗增生性疾病，如癌症。
• PROCESS FOR THE SYNTHESIS OF OLIGONUCLEOTIDES
  申请人：Leuck Michael

  公开号：US20080064867A1

  公开（公告）日：2008-03-13

  The present invention discloses novel methods for the synthesis of oligonucleotides with nucleoside phosphoramidites on solid supports. The methods comprise the stepwise chain assembly of oligonucleotides on supports with 5′-acyl phosphoramidites. The synthesis cycles consist of a front end deprotection step which is conducted with a solution of a primary amine or a phenolate, a phosphoramidite coupling step with a 5′-acyl nucleoside phosphoramidite in the presence of an activator, a phosphite oxidation step and an optional capping step. The novel methods improve the quality of synthetic oligonucleotides due to the irreversibility of the front end deprotection step, which prevents the formation of deletion sequences, and due to the avoidance of acidic reagents in the synthesis cycles, which prevent the formation of depurination side products. The invention further discloses novel nucleoside phosphoramidite compositions wherein the phosphoramidites carry acyl front end protective groups which are cleavable with primary amines or phenolates. The invention is applicable to the synthesis of oligodeoxyribonucleotides, oligoribonucleotides and oligonucleotides with modifications in their sugar or phosphate groups.

  本发明揭示了一种新的方法，用于在固相支持上合成具有核苷酸磷酰胺酯的寡核苷酸。该方法包括使用5'-酰基磷酰胺酯在支持上逐步组装寡核苷酸链。合成周期包括前端去保护步骤，该步骤使用一种原始胺或酚酸溶液进行，磷酰胺酯偶联步骤使用5'-酰基核苷酸磷酰胺酯在活化剂存在下进行，磷酸酯氧化步骤和可选的帽子步骤。由于前端去保护步骤的不可逆性防止了缺失序列的形成，而避免使用酸性试剂在合成周期中防止了去噻嗪副产物的形成，因此，这种新方法提高了合成寡核苷酸的质量。本发明进一步揭示了新的核苷酸磷酰胺酯组合物，其中磷酰胺酯携带可用原始胺或酚酸裂解的酰基前端保护基团。该发明适用于合成具有糖或磷酸基团修饰的寡脱氧核苷酸，寡核糖核苷酸和寡核苷酸。
• Nucleoside derivatives with photo-unstable protective groups
  申请人：Deutsches Krebsforschungszentrum Stiftund des Offentlichen Rechts

  公开号：US06756492B1

  公开（公告）日：2004-06-29

  The present invention relates to nucleoside derivatives having photolabile protective groups of general formula (I) in which R1=H, NO2, CN, OCH3, halogen, an alkyl, alkoxy or alkoxyalkyl residue having 1 to 4 C atoms or an optionally substituted aryl residue or an aliphatic acyl residue having 2 to 5 atoms, R2=H, NO2, CN, OCH3, halogen, an alkyl, alkoxy or alkoxyalkyl residue having 1 to 4 C atoms or an optionally substituted aryl residue or an aliphatic acyl residue having 2 to 5 atoms, R3=H, halogen, NO2, CN, OCH3, an alkyl, alkoxy or alkoxyalkyl residue having 1 to 4 C atoms or an optionally substituted aryl residue or aliphatic acyl residue having 2 to 5 C atoms, R4=H, halogen, NO2, CN, OCH3, an alkyl, alkoxy, or alkoxyalkyl residue having 1 to 4 C atoms or an optionally substituted aryl residue or aliphatic acyl residue having 2 to 5 atoms, R5=H, dimethoxytrityl or a protective group common in the chemistry of nucleotides or a functional group common for the production of oligonucleotides, R6=H, OH, halogen, or &PSgr;R8, wherein &PSgr;=O or S and R8=alkyl or alkoxyalkyl having 1 to 4 C atoms or an optionally substituted aryl residue or an aliphatic acyl residue having 2 to 5 atoms and a protective group common in the chemistry of nucleotides, R7=H, NO2, CN, OCH3, halogen, an alkyl, alkoxy or alkoxyalkyl residue having 1 to 4 C atoms or an optionally substituted aryl residue or aliphatic acyl residue having 2 to 5 atoms, n =0 or 1, X =SO2, OCO, OCS, B=H, adenine, cytosine, guanine, thymine, uracil, 2,6-diaminopurine-9-yl, hypoxanthine-9-yl, 5-methylcytosine-1-yl, 5-amino-4-imidazole carboxylic acid-1-yl or 5-amino-4-imidazole carboxylic acid amide-3-yl, wherein in case B=adenine, cytosine or guanine the primary amino function optionally has a temporary or permanent protective group and/or thymine or uracil optionally has a permanent protective group at the O4 position. The invention also relates to a method of producing these nucleosides, their use and nucleic acid chips built up therefrom.

  本发明涉及具有光敏保护基的核苷衍生物，其一般式为(I)，其中R1＝H、NO2、CN、OCH3、卤素、具有1至4个C原子的烷基、烷氧基或烷氧基烷基残基，或者是可选取代的芳基残基或具有2至5个原子的脂肪族酰基残基；R2＝H、NO2、CN、OCH3、卤素、具有1至4个C原子的烷基、烷氧基或烷氧基烷基残基，或者是可选取代的芳基残基或具有2至5个原子的脂肪族酰基残基；R3＝H、卤素、NO2、CN、OCH3、具有1至4个C原子的烷基、烷氧基或烷氧基烷基残基，或者是可选取代的芳基残基或具有2至5个C原子的脂肪族酰基残基；R4＝H、卤素、NO2、CN、OCH3、具有1至4个C原子的烷基、烷氧基或烷氧基烷基残基，或者是可选取代的芳基残基或具有2至5个原子的脂肪族酰基残基；R5＝H、二甲氧基三苄基基或在核苷酸化学中常见的保护基或用于寡核苷酸生产的常见功能基；R6＝H、OH、卤素或&PSgr;R8，其中&PSgr;＝O或S，R8＝具有1至4个C原子的烷基或烷氧基烷基，或者是可选取代的芳基残基或具有2至5个原子的脂肪族酰基残基和在核苷酸化学中常见的保护基；R7＝H、NO2、CN、OCH3、卤素、具有1至4个C原子的烷基、烷氧基或烷氧基烷基残基，或者是可选取代的芳基残基或具有2至5个原子的脂肪族酰基残基；n＝0或1；X＝SO2、OCO、OCS；B＝H、腺嘌呤、胞嘧啶、鸟嘌呤、胸腺嘧啶、尿嘧啶、2,6-二氨基嘌呤-9-基、次黄嘌呤-9-基、5-甲基胞嘧啶-1-基、5-氨基-4-咪唑羧酸-1-基或5-氨基-4-咪唑羧酸酰胺-3-基，在B＝腺嘌呤、胞嘧啶或鸟嘌呤的情况下，原始氨基功能可选具有临时或永久的保护基，或者胸腺嘧啶或尿嘧啶可选在O4位置具有永久的保护基。本发明还涉及一种制备这些核苷的方法、它们的用途和由此构建的核酸芯片。
• Process Development of Biocatalytic Regioselective 5′-<i>O</i>-Levulinylation of 2′-Deoxynucleosides
  作者：Alejandro Carnero、Yogesh S. Sanghvi、Vicente Gotor、Susana Fernández、Miguel Ferrero

  DOI：10.1021/acs.oprd.5b00152

  日期：2015.7.17

  An enzymatic process was optimized for regioselective levulinylation of the S'-hydroxyl group in 2'-deoxynucleosides. The results revealed that the nucleobase protecting group influenced the successful outcome of the enzymatic reaction. The enhanced solubility of 4-tert-butylphenoxyacetyl protected 2'-deoxynucleoside played a major role during acylation reaction enabling the starting nucleosides to be the best substrates for Candida antarctica lipase B. Furthermore, we have developed a packed column protocol as a superior alternative to batch process carried-out in a flask, particularly when scale-up is required. The industrial application of this method was demonstrated via the synthesis of 5'-O-levulinylthymidine on a 25 g scale.