cyclo[-Arg(Pbf)-Gly-Asp(OtBu)-D-Phe-Val-] | 1305310-97-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: cyclo[-Arg(Pbf)-Gly-Asp(OtBu)-D-Phe-Val-]
• 英文别名: cyclo[Arg(Pbf)(Pbf)-Gly-Asp(OtBu)(OtBu)-D-Phe-Val]；tert-butyl 2-[(2S,5R,8S,11S)-11-[3-[[amino-[(2,2,4,6,7-pentamethyl-3H-1-benzofuran-5-yl)sulfonylamino]methylidene]amino]propyl]-5-benzyl-3,6,9,12,15-pentaoxo-8-propan-2-yl-1,4,7,10,13-pentazacyclopentadec-2-yl]acetate
• CAS: 1305310-97-7
• 化学式: C₄₃H₆₂N₈O₁₀S
• 分子量: 883.079
• InChiKey: SJTVMIQYIDJJHH-HHISBTQYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.4
• 重原子数：
  62
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  274
• 氢给体数：
  7
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  cyclo[-Arg(Pbf)-Gly-Asp(OtBu)-D-Phe-Val-] 在 三甲基溴硅烷 、 茴香硫醚 、 1,2-乙二硫醇 、 间甲酚 作用下， 以 三氟乙酸 为溶剂， 反应 0.25h， 以87%的产率得到cilengitide
  参考文献：
  名称：

  idine型肽键等位基因的设计与合成：腈类衍生物作为活性酯当量在肽和拟肽合成中的应用†

  摘要：

  基于肽键羰基（C O）基团被亚氨基（C NH）基团取代，设计了idine型肽键等位基因。等规部分的带正电性质类似于还原的酰胺型拟肽。通过还原关键的mid胺肟（N-羟基am）前体来合成肽基am单元，该关键的ox胺肟前体是由作为腈酰基或肽基当量的腈氧化物组分制备的。这种由一氧化氮介导的C–N键的形成也用于肽大环化，其中a胺肟基团在温和的酸性条件下转化为肽键。提出了使用两种方法合成环状RGD肽和拟肽的方法，以及它们对整联蛋白介导的细胞附着的抑制活性。

  DOI：

  10.1039/c0ob01193b
• 作为产物：
  描述：

  H-Asp(OtBu)-D-Phe-Val-Arg(Pbf)-Gly-aldoxime 在 N-氯代丁二酰亚胺 、 溶剂黄146 、 三乙胺 、 sodium nitrite 作用下， 以 甲醇 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 cyclo[-Arg(Pbf)-Gly-Asp(OtBu)-D-Phe-Val-]
  参考文献：
  名称：

  idine型肽键等位基因的设计与合成：腈类衍生物作为活性酯当量在肽和拟肽合成中的应用†

  摘要：

  基于肽键羰基（C O）基团被亚氨基（C NH）基团取代，设计了idine型肽键等位基因。等规部分的带正电性质类似于还原的酰胺型拟肽。通过还原关键的mid胺肟（N-羟基am）前体来合成肽基am单元，该关键的ox胺肟前体是由作为腈酰基或肽基当量的腈氧化物组分制备的。这种由一氧化氮介导的C–N键的形成也用于肽大环化，其中a胺肟基团在温和的酸性条件下转化为肽键。提出了使用两种方法合成环状RGD肽和拟肽的方法，以及它们对整联蛋白介导的细胞附着的抑制活性。

  DOI：

  10.1039/c0ob01193b

文献信息

• Synthesis of a Chloroalkene Dipeptide Isostere-Containing Peptidomimetic and Its Biological Application
  作者：Takuya Kobayakawa、Yudai Matsuzaki、Kentaro Hozumi、Wataru Nomura、Motoyoshi Nomizu、Hirokazu Tamamura

  DOI：10.1021/acsmedchemlett.7b00234

  日期：2018.1.11

  synthesis of a cyclic Arg-Gly-Asp (RGD) peptide containing a chloroalkene dipeptide isostere (CADI) is reported. By a developed synthetic method, an N-tert-butylsulfonyl protected CADI was obtained utilizing diastereoselective allylic alkylation as a key reaction. This CADI was also transformed into an N-Fmoc protected CADI in a few steps. The CADI was used in Fmoc-based solid-phase peptide synthesis.

  据报道，首次快速，有效地化学合成了包含氯烯二肽等排物（CADI）的环状Arg-Gly-Asp（RGD）肽。由发达合成法，ñ -叔-butylsulfonyl保护得到CADI利用非对映选择性烯丙基烷基化作为关键反应。只需几个步骤，该CADI也已转换为N- Fmoc保护的CADI。CADI用于基于Fmoc的固相肽合成中。含CADI的环状RGD肽的首次合成成功，并且发现所合成的含CADI的拟肽比亲本环状肽对整合素介导的细胞附着的抑制作用更强。
• Design and synthesis of amidine-type peptide bond isosteres: application of nitrile oxide derivatives as active ester equivalents in peptide and peptidomimetics synthesis
  作者：Eriko Inokuchi、Ai Yamada、Kentaro Hozumi、Kenji Tomita、Shinya Oishi、Hiroaki Ohno、Motoyoshi Nomizu、Nobutaka Fujii

  DOI：10.1039/c0ob01193b

  日期：——

  peptidomimetic. The peptidyl amidine units were synthesized by the reduction of a key amidoxime (N-hydroxyamidine) precursor, which was prepared from nitrile oxide components as an aminoacyl or peptidyl equivalent. This nitrile oxide-mediated C–N bond formation was also used for peptide macrocyclization, in which the amidoxime group was converted to peptide bonds under mild acidic conditions. Syntheses of

  基于肽键羰基（C O）基团被亚氨基（C NH）基团取代，设计了idine型肽键等位基因。等规部分的带正电性质类似于还原的酰胺型拟肽。通过还原关键的mid胺肟（N-羟基am）前体来合成肽基am单元，该关键的ox胺肟前体是由作为腈酰基或肽基当量的腈氧化物组分制备的。这种由一氧化氮介导的C–N键的形成也用于肽大环化，其中a胺肟基团在温和的酸性条件下转化为肽键。提出了使用两种方法合成环状RGD肽和拟肽的方法，以及它们对整联蛋白介导的细胞附着的抑制活性。
• Rapid, Traceless, Ag ^I ‐Promoted Macrocyclization of Peptides Possessing an N‐Terminal Thioamide
  作者：Varsha J. Thombare、Craig A. Hutton

  DOI：10.1002/anie.201900243

  日期：2019.4

  Peptide macrocyclization is often a slow process, plagued by epimerization and cyclodimerization. Herein, we describe a new method for peptide macrocyclization employing the AgI‐promoted transformation of peptide thioamides. The AgI has a dual function: chemoselectively activating the thioamide and tethering the N‐terminal thioamide to the C‐terminal carboxylate. Extrusion of Ag2S generates an isoimide

  肽大环化通常是一个缓慢的过程，受到差向异构和环二聚化的困扰。在本文中，我们描述了一种新的肽大环化方法，该方法采用了由Ag I促进的肽硫酰胺转化的肽大环化方法。Ag I具有双重功能：化学选择性活化硫酰胺，并将N末端的硫酰胺束缚到C末端的羧酸酯上。Ag 2 S的挤出产生异酰亚胺中间体，该中间体进行酰基转移以生成天然环肽，从而导致快速，无痕的大环化过程。1小时内可以高产率提供环肽，没有差向异构和环二聚。