1-(R)-(2,3-dihydroxypropyl)cytosine | 58274-14-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 1-(R)-(2,3-dihydroxypropyl)cytosine
• 英文别名: 4-amino-1-[(2R)-2,3-dihydroxypropyl]pyrimidin-2-one
• CAS: 58274-14-9
• 化学式: C₇H₁₁N₃O₃
• 分子量: 185.183
• InChiKey: LTTDCEYZEHQDGW-RXMQYKEDSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.4
• 重原子数：
  13
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.43
• 拓扑面积：
  99.2
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-(R)-(2,3-dihydroxypropyl)cytosine 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 ammonium hydroxide 、 三甲基氯硅烷 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 40.0h， 生成 N4-benzoyl-9-(R)-(2-hydroxy-3-triphenylmethoxypropyl)cytosine
  参考文献：
  名称：

  Syntheses of Enantiomeric N-(3-Hydroxy-2-phosphonomethoxypropyl) Derivatives of Purine and Pyrimidine Bases

  摘要：

  描述了制备N-(3-羟基-2-膦甲氧基丙基)（HPMP）衍生物的方法，其中包括（2S）-和（2R）-构型的化合物I和XXVII。一般方法始于相应的N-(2,3-二羟基丙基)衍生物，通过将其转化为（R）-对映体XIII（通过碱与（R）-环氧丙酯（XII）在碳酸铯存在下的反应和随后的甲醇解）或通过在相同试剂存在下，通过碱与（R）-2,2-二甲基-4-对甲苯磺酰氧甲基-1,3-二氧兰（V）烷基化，将其转化为（S）-对映体XI。化合物XI和XIII中的杂环碱基上的氨基被硅烷化后与苯甲酰氯反应，得到的N-苯甲酸酯XV和XVII在与三苯甲基氯反应时生成相应的3'-O-三苯甲基衍生物XVI和XVIII。这些化合物与双(2-丙基)对磺酸氧甲基膦酸酯（XXIII）在二甲基甲酰胺中与氢化钠存在下反应，得到完全保护的二酯体XXIV和XXVIII。这些化合物可以选择性地酸水解以去除三苯甲基基团，仅形成化合物XXXV，或者经甲醇解然后酸水解以去除三苯甲基和N-苯甲酰基团，并导致化合物XXVI和XXX，或者经溴三甲基硅烷处理以去除三苯甲基和2-丙基基团，形成XXXI型膦酸酯。然后将这三种类型的化合物转化为（S）-系列（I）和（R）-系列（XXVII）的自由膦酸酯。制备了胞嘧啶（Ia、XXVIIa）、腺嘌呤（Ib、XXVIIb）、2,6-二氨基嘌呤（Ic、XXVIIc）和鸟嘌呤（Id、XXVIId）的衍生物。部分阻塞的腺嘌呤衍生物XXXV与甲磺酰衍生物XXIII进行缩合反应，随后去保护作用，得到9-(S)-(2,3-二磷酸甲氧基丙基)腺嘌呤（XLIII）。将相同化合物XXXV或其（R）-对映体XXXVIII与二乙基膦酸酯反应，随后去保护，得到3'-O-磷酰化衍生物（S）-HPMPA（XXXVII）和（R）-HPMPA（XL）。

  DOI：

  10.1135/cccc19930649
• 作为产物：
  描述：

  在 sodium methylate 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 16.0h， 生成 1-(R)-(2,3-dihydroxypropyl)cytosine
  参考文献：
  名称：

  Syntheses of Enantiomeric N-(3-Hydroxy-2-phosphonomethoxypropyl) Derivatives of Purine and Pyrimidine Bases

  摘要：

  描述了制备N-(3-羟基-2-膦甲氧基丙基)（HPMP）衍生物的方法，其中包括（2S）-和（2R）-构型的化合物I和XXVII。一般方法始于相应的N-(2,3-二羟基丙基)衍生物，通过将其转化为（R）-对映体XIII（通过碱与（R）-环氧丙酯（XII）在碳酸铯存在下的反应和随后的甲醇解）或通过在相同试剂存在下，通过碱与（R）-2,2-二甲基-4-对甲苯磺酰氧甲基-1,3-二氧兰（V）烷基化，将其转化为（S）-对映体XI。化合物XI和XIII中的杂环碱基上的氨基被硅烷化后与苯甲酰氯反应，得到的N-苯甲酸酯XV和XVII在与三苯甲基氯反应时生成相应的3'-O-三苯甲基衍生物XVI和XVIII。这些化合物与双(2-丙基)对磺酸氧甲基膦酸酯（XXIII）在二甲基甲酰胺中与氢化钠存在下反应，得到完全保护的二酯体XXIV和XXVIII。这些化合物可以选择性地酸水解以去除三苯甲基基团，仅形成化合物XXXV，或者经甲醇解然后酸水解以去除三苯甲基和N-苯甲酰基团，并导致化合物XXVI和XXX，或者经溴三甲基硅烷处理以去除三苯甲基和2-丙基基团，形成XXXI型膦酸酯。然后将这三种类型的化合物转化为（S）-系列（I）和（R）-系列（XXVII）的自由膦酸酯。制备了胞嘧啶（Ia、XXVIIa）、腺嘌呤（Ib、XXVIIb）、2,6-二氨基嘌呤（Ic、XXVIIc）和鸟嘌呤（Id、XXVIId）的衍生物。部分阻塞的腺嘌呤衍生物XXXV与甲磺酰衍生物XXIII进行缩合反应，随后去保护作用，得到9-(S)-(2,3-二磷酸甲氧基丙基)腺嘌呤（XLIII）。将相同化合物XXXV或其（R）-对映体XXXVIII与二乙基膦酸酯反应，随后去保护，得到3'-O-磷酰化衍生物（S）-HPMPA（XXXVII）和（R）-HPMPA（XL）。

  DOI：

  10.1135/cccc19930649

文献信息

• [EN] OLIGONUCLEOTIDE COMPOSITIONS AND METHODS THEREOF<br/>[FR] COMPOSITIONS D'OLIGONUCLÉOTIDES ET PROCÉDÉS ASSOCIÉS
  申请人：WAVE LIFE SCIENCES LTD

  公开号：WO2022099159A1

  公开（公告）日：2022-05-12

  Among other things, the present disclosure provides oligonucleotides and compositions thereof. In some embodiments, provided oligonucleotides and compositions are useful for adenosine modification. In some embodiments, the present disclosure provides methods for treating various conditions, disorders or diseases that can benefit from adenosine modification.

  除其他事项外，本公开提供寡核苷酸及其组合物。在某些实施例中，提供的寡核苷酸及其组合物对腺苷修饰有用。在某些实施例中，本公开提供了治疗各种需要腺苷修饰的疾病、疾病或病症的方法。