The Nitrogen Atom of Vitamin B6 Is Essential for the Catalysis of Radical Aminomutases
作者:Amarendra Nath Maity、Jun-Ru Chen、Quan-Yuan Li、Shyue-Chu Ke
DOI:10.3390/ijms23095210
日期:——
Radical aminomutases are pyridoxal 5′-phosphate (PLP, a B6 vitamer)-dependent enzymes that require the generation of a 5′-deoxyadenosyl radical to initiate the catalytic cycle, to perform a 1,2 amino group shift reaction. The role of the nitrogen atom of PLP in radical aminomutases has not been investigated extensively yet. We report an alternative synthetic procedure to provide easy access to 1-deazaPLP
自由基氨基变位酶是 5'-磷酸吡哆醛 (PLP, a B 6维生素)依赖性酶,需要产生 5'-脱氧腺苷自由基来启动催化循环,以进行 1,2 氨基转移反应。PLP 的氮原子在自由基氨基变位酶中的作用尚未得到广泛研究。我们报告了一种替代合成程序,可轻松访问 1-deazaPLP (dAPLP),这是一种 PLP 的等排类似物,可作为研究氮原子作用的探针。我们的研究结果表明,用 dAPLP 重组的自由基氨基变位酶赖氨酸 5,6-氨基变位酶 (5,6-LAM) 不能翻转底物,这表明氮原子对于自由基氨基变位酶至关重要。相比之下,对用 PLP 重组的 S238A 变体的生化和光谱研究显示活性损失很小。这种明显的异常可以通过水介导的 S238A 活性挽救来解释,就好像模仿赖氨酸 2,3-氨基变位酶的活性位点一样。这项研究有助于更好地理解酶如何利用 PLP 的最佳能力来实现催化。