6-4TT

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 6-4TT
• 英文别名: 5'-T(6-4)T-3'；5'-(d(5Ht)p*(6-4)t)-3'；(2R,4S,5R,10S,11R,13R,18R,19S)-4,8,18-trihydroxy-11-(hydroxymethyl)-18,24-dimethyl-8-oxo-7,9,12,26-tetraoxa-1,14,16,21-tetraza-8λ5-phosphapentacyclo[18.2.2.12,5.110,13.014,19]hexacosa-20,23-diene-15,17,22-trione
• 化学式: C₂₀H₂₇N₄O₁₂P
• 分子量: 546.428
• InChiKey: PRFQJBLUTUYASX-IWBSTULPSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.6
• 重原子数：
  37
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.7
• 拓扑面积：
  217
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  12

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-4TT 在 溶剂黄146 、 N,N'-二甲基乙二胺 作用下， 生成 [(2R,3S,5R)-2-(hydroxymethyl)-5-[(5R,6S)-5-hydroxy-5-methyl-6-(5-methyl-2-oxo-1H-pyrimidin-6-yl)-2,4-dioxo-1,3-diazinan-1-yl]oxolan-3-yl] dihydrogen phosphate
  参考文献：
  名称：

  在中性pH下含（6–4）个光产物的DNA的链断裂及其被ERCC1–XPF蛋白复合物修复†

  摘要：

  （6–4）光产物是紫外线在DNA中引起的主要损伤之一。我们先前显示，当用NaOH水溶液处理该光产物时，会发生5'碱的水解开环和3'组分的糖苷键的随后水解。在这项研究中，我们发现在0.1 M的N，N溶液中将（6–4）光产物在90°C下加热6 h时，会得到另一种产物。用乙酸将'-二甲基-1，2-乙二胺调节至pH 7.4。对该产物的化学结构的分析表明，5'碱基是完整的，而3'组分上的糖苷键则以相同的方式水解。在使用上述溶液或其他含有生物胺（如亚精胺和精胺）的pH 7.4溶液处理后，检测到含有（6–4）光产物的30聚体寡核苷酸的链断裂。对于亚精idine，速率常数经计算为1.4×10 -8 s -1在37°C下。即使将寡核苷酸在90 M的0.1 M磷酸钠（pH 7.0）中加热，也会发生链断裂，尽管这种处理产生了几种类型的5'片段。杜瓦价键异构体对该反应呈惰性。从（6–4）个含光产物的30-mer中

  DOI：

  10.1039/c3ob00012e

文献信息

• Mechanism of the alkali degradation of (6–4) photoproduct-containing DNA
  作者：Norihito Arichi、Aki Inase、Sachise Eto、Toshimi Mizukoshi、Junpei Yamamoto、Shigenori Iwai

  DOI：10.1039/c2ob06966k

  日期：——

  The (6–4) photoproduct is one of the major damaged bases produced by ultraviolet light in DNA. This lesion is known to be alkali-labile, and strand breaks occur at its sites when UV-irradiated DNA is treated with hot alkali. We have analyzed the product obtained by the alkali treatment of a dinucleoside monophosphate containing the (6–4) photoproduct, by HPLC, NMR spectroscopy, and mass spectrometry

  （6–4）光产物是紫外线在DNA中产生的主要受损碱基之一。已知该损伤是碱不稳定的，当用热碱处理紫外线照射的DNA时，在其部位会发生链断裂。我们已经分析了通过碱处理得到的产品。二磷酸核苷通过HPLC，NMR光谱和质谱分析，含有（6–4）个光产物。我们先前发现5'组分的N3-C4键通过弱碱处理而水解，并且本研究表明以下反应是3'组分上糖苷键的水解。即使不存在3'侧翼核苷酸，该成分的糖部分也会丢失。对于二聚体和三聚体，还观察到糖苷键水解。5-甲基-2-嘧啶酮，它被用作（6–4）光产物的3'成分的类似物，并阐明了其机理。最后，对四聚物d（GT（6–4）TC）进行碱处理，得到了2'-脱氧胞苷5'-单磷酸酯， 尽管 2'-脱氧鸟苷3'-单磷酸酯未检测到。该结果证明了（6–4）光产物3'组分上糖苷键的水解以及随后的β消除导致链断裂。还显示出，杜瓦价异构体3'组分的糖苷键比（6-4）光产物的碱不稳定。