1-methoxycarbonylmethyl-3-nitropyrrole | 250647-51-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: 1-methoxycarbonylmethyl-3-nitropyrrole
• 英文别名: Methyl 2-(3-nitro-1H-pyrrol-1-yl)acetate；methyl 2-(3-nitropyrrol-1-yl)acetate
• CAS: 250647-51-9
• 化学式: C₇H₈N₂O₄
• 分子量: 184.152
• InChiKey: OSGPXQBCKGYHJB-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  301.4±22.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.35±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.5
• 重原子数：
  13
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.29
• 拓扑面积：
  77
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-methoxycarbonylmethyl-3-nitropyrrole 在 一水合肼 、 溶剂黄146 作用下， 以 乙醇 为溶剂， 生成
  参考文献：
  名称：

  使用新型支架鉴定，结构修饰和表征潜在的小分子SGK3抑制剂。

  摘要：

  血清和糖皮质激素调节激酶（SGK）家族已参与PI3K途径下游许多细胞过程的调节。它在PI3K介导的肿瘤发生中起着至关重要的作用，使其成为潜在的癌症治疗靶标。SGK家族由三种同工型（SGK1，SGK2和SGK3）组成，它们在激酶结构域具有高度的序列同源性，并且与AKT家族具有相似的底物特异性。为了鉴定能够抑制SGK3活性的新型化合物，使用Z'因子大于0.5的基于荧光的激酶测定法针对50,400个小分子进行了高通量筛选。它用IC 50鉴定了15种命中化合物（包括含氮芳族化合物，黄酮，和萘衍生物）值在低微摩尔至亚微摩尔范围内。选择了具有相似支架（即a核）的四种化合物进行结构修饰，并合成了18种衍生物。然后使用分子模型研究结构-活性关系（SAR）和潜在的蛋白质-配体相互作用。结果，开发了对SGK1和SGK3均具有活性的一系列SGK抑制剂，并确定了控制其抑制活性的重要官能团。

  DOI：

  10.1038/s41401-018-0087-6
• 作为产物：
  描述：

  3-硝基吡咯 、 溴乙酸甲酯 在 potassium carbonate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 1-methoxycarbonylmethyl-3-nitropyrrole
  参考文献：
  名称：

  使用新型支架鉴定，结构修饰和表征潜在的小分子SGK3抑制剂。

  摘要：

  血清和糖皮质激素调节激酶（SGK）家族已参与PI3K途径下游许多细胞过程的调节。它在PI3K介导的肿瘤发生中起着至关重要的作用，使其成为潜在的癌症治疗靶标。SGK家族由三种同工型（SGK1，SGK2和SGK3）组成，它们在激酶结构域具有高度的序列同源性，并且与AKT家族具有相似的底物特异性。为了鉴定能够抑制SGK3活性的新型化合物，使用Z'因子大于0.5的基于荧光的激酶测定法针对50,400个小分子进行了高通量筛选。它用IC 50鉴定了15种命中化合物（包括含氮芳族化合物，黄酮，和萘衍生物）值在低微摩尔至亚微摩尔范围内。选择了具有相似支架（即a核）的四种化合物进行结构修饰，并合成了18种衍生物。然后使用分子模型研究结构-活性关系（SAR）和潜在的蛋白质-配体相互作用。结果，开发了对SGK1和SGK3均具有活性的一系列SGK抑制剂，并确定了控制其抑制活性的重要官能团。

  DOI：

  10.1038/s41401-018-0087-6

文献信息

• Nitroazole Universal Bases in Peptide Nucleic Acids
  作者：Hemavathi Challa、Melanie L. Styers、Stephen A. Woski

  DOI：10.1021/ol990270q

  日期：1999.11.1

  properties of these PNAs with complementary oligodeoxynucleotides were evaluated by thermal denaturation experiments. Both novel residues exhibited little variation in Tm (< or = 1.5 degrees C) when positioned against any of the four nucleoside bases. The capability to incorporate degenerate sites should further expand the utility of PNA in applications where precise sequence information is not available

  [分子式：见正文]含有潜在的含糊的核碱基类似物，即3-硝基吡咯和5-硝基吲哚的PNA低聚物的合成已经完成。通过热变性实验评估了这些PNA与互补寡聚脱氧核苷酸的杂交特性。当与四个核苷碱基中的任何一个相对定位时，两个新的残基在Tm（<或= 1.5摄氏度）中均表现出很小的变化。整合简并位点的能力应进一步扩大PNA在无法获得精确序列信息的应用中的效用。