N-[(2R)-(t-Boc-amino)cyclopent-(1S)-yl]-glycine ethyl ester | 721395-16-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N-[(2R)-(t-Boc-amino)cyclopent-(1S)-yl]-glycine ethyl ester
• 英文别名: N-[(1S,2R)-2-[[(1,1-Dimethylethoxy)carbonyl]amino]cyclopentyl]glycine ethyl ester；ethyl 2-[[(1S,2R)-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]cyclopentyl]amino]acetate
• CAS: 721395-16-0
• 化学式: C₁₄H₂₆N₂O₄
• 分子量: 286.371
• InChiKey: SMZWRONELCRCJI-WDEREUQCSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.8
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.86
• 拓扑面积：
  76.7
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-[(2R)-(t-Boc-amino)cyclopent-(1S)-yl]-glycine ethyl ester 在 lithium hydroxide 、 sodium carbonate 、 potassium carbonate 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 5.0h， 生成 N-[(2R)-(t-Boc-amino)cyclopent-(1S)-yl]-N-(thymin-1-yl-acetyl)-glycine
  参考文献：
  名称：

  cis-Cyclopentyl PNA (cpPNA) as constrained chiral PNA analogues: stereochemical dependence of DNA/RNA hybridizationElectronic Supplementary Information (ESI) available: Experimental procedures for the synthesis of compounds, 1H, 13C NMR, mass spectral data, crystal structural data and melting curves for triplexes. See http://www.rsc.org/suppdata/cc/b3/b317000d/

  摘要：

  对具有cis-(1S,2R/1R,2S)-环戊基单元的PNA-T寡聚物进行的DNA/RNA杂交研究表明，结合具有立体化学依赖性，并且能够区分RNA和DNA。

  DOI：

  10.1039/b317000d
• 作为产物：
  描述：

  (1S,2R)-2-(N-tert-butoxycarbonylamino)-1-azidocyclopentane 在 platinum(IV) oxide potassium fluoride 、 Celite 、 氢气 作用下， 以 甲醇 、 乙腈 为溶剂， 20.0~65.0 ℃ 、275.79 kPa 条件下， 反应 6.5h， 生成 N-[(2R)-(t-Boc-amino)cyclopent-(1S)-yl]-glycine ethyl ester
  参考文献：
  名称：

  （1级小号，2 - [R / 1 - [R，2小号） -顺-环戊PNAS（CP的PNA）作为约束PNA类似物的合成与评价一个例如-CP PNA嵌合体和Stereopreferences在与杂交DNA / RNA

  摘要：

  构象受限的手性PNA类似物是基于在aeg PNA的氨基乙基片段上的1，2 - c is-环戊基部分的立体有择的设计而设计的。已知环戊烷环是相对柔性的系统，其中特性起皱决定了取代基的假轴/假赤道位置。因此，当将该部分施加于常规PNA骨架上时，有利的扭转调节有可能获得必要的杂交能力构象。对映体纯的1,2-顺式-环戊基PNA单体（10a和10b）的合成是通过关键中间体酯2的立体选择性酶水解实现的。将手性（1 S，2 R / 1 R，2 S）-氨基环戊基甘氨酰胸腺嘧啶单体在确定的位置并通过整个序列掺入PNA低聚物中。使用UV- T m测量值对互补的DNA和RNA序列进行的杂交研究表明，aeg - cp PNA嵌合体形成的热稳定性比aeg PNA具有更稳定的复合体，且具有立体化学依赖性的cDNA / RNA选择性结合。在aeg - cp PNA与互补DNA杂交时观察到差异的凝胶移位阻滞。

  DOI：

  10.1021/jo049442+

文献信息

• Enzymatic Dynamic Kinetic Resolution of (±)-<i>cis</i>-<i>N</i>-(Alkoxycarbonyl)cyclopentane-1,2-diamines based on Spontaneous Racemization
  作者：F. Javier Quijada、Vicente Gotor、Francisca Rebolledo

  DOI：10.1021/ol101378k

  日期：2010.8.20

  acetylation of different (±)-cis-N-(alkoxycarbonyl)cyclopentane-1,2-diamines. Depending on the alkoxycarbonyl group, a simple kinetic resolution (Boc-derivative) or an interesting dynamic kinetic resolution (DKR with Cbz-, Alloc, and ethoxycarbonyl derivatives) has been developed. Racemization for the DKR occurred due to the N,N′ intramolecular migration of the alkoxycarbonyl group.

  从脂肪酶B南极假丝酵母是用于对映选择性乙酰化的优良催化剂不同（±） -顺式- ñ - （烷氧羰基）环戊烷-1,2-二胺。根据烷氧羰基的不同，已经开发出简单的动力学拆分（Boc衍生物）或有趣的动力学拆分（带有Cbz-，Alloc和乙氧羰基衍生物的DKR）。DKR的外消旋是由于烷氧羰基的N，N '分子内迁移而发生的。
• (1<i>S</i>,2<i>R</i>/1<i>R</i>,2<i>S</i>)-<i>cis</i>-Cyclopentyl PNAs (<i>cp</i>PNAs) as Constrained PNA Analogues:  Synthesis and Evaluation of <i>a</i><i>eg-cp</i>PNA Chimera and Stereopreferences in Hybridization with DNA/RNA
  作者：T. Govindaraju、Vaijayanti A. Kumar、Krishna N. Ganesh

  DOI：10.1021/jo049442+

  日期：2004.8.1

  oligomers at defined positions and through the entire sequence. Hybridization studies with complementary DNA and RNA sequences using UV−Tm measurements indicate that aeg-cpPNA chimera form thermally more stable complexes than aegPNA with stereochemistry-dependent selective binding of cDNA/RNA. Differential gel shift retardation was observed on hybridization of aeg-cpPNAs with complementary DNA.

  构象受限的手性PNA类似物是基于在aeg PNA的氨基乙基片段上的1，2 - c is-环戊基部分的立体有择的设计而设计的。已知环戊烷环是相对柔性的系统，其中特性起皱决定了取代基的假轴/假赤道位置。因此，当将该部分施加于常规PNA骨架上时，有利的扭转调节有可能获得必要的杂交能力构象。对映体纯的1,2-顺式-环戊基PNA单体（10a和10b）的合成是通过关键中间体酯2的立体选择性酶水解实现的。将手性（1 S，2 R / 1 R，2 S）-氨基环戊基甘氨酰胸腺嘧啶单体在确定的位置并通过整个序列掺入PNA低聚物中。使用UV- T m测量值对互补的DNA和RNA序列进行的杂交研究表明，aeg - cp PNA嵌合体形成的热稳定性比aeg PNA具有更稳定的复合体，且具有立体化学依赖性的cDNA / RNA选择性结合。在aeg - cp PNA与互补DNA杂交时观察到差异的凝胶移位阻滞。
• cis-Cyclopentyl PNA (cpPNA) as constrained chiral PNA analogues: stereochemical dependence of DNA/RNA hybridizationElectronic Supplementary Information (ESI) available: Experimental procedures for the synthesis of compounds, 1H, 13C NMR, mass spectral data, crystal structural data and melting curves for triplexes. See http://www.rsc.org/suppdata/cc/b3/b317000d/
  作者：T. Govindaraju、Vaijayanti A. Kumar、Krishna N. Ganesh

  DOI：10.1039/b317000d

  日期：——

  DNA/RNA hybridization studies of PNA-T oligomers with cis-(1S,2R/1R,2S)-cyclopentyl units in the backbone show stereochemistry dependent binding with RNA/DNA discrimination.

  对具有cis-(1S,2R/1R,2S)-环戊基单元的PNA-T寡聚物进行的DNA/RNA杂交研究表明，结合具有立体化学依赖性，并且能够区分RNA和DNA。