5-chloropyridin-3-yl 1H-indole-5-carboxylate | 1026559-41-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: 5-chloropyridin-3-yl 1H-indole-5-carboxylate
• 英文别名: (5-chloropyridin-3-yl) 1H-indole-5-carboxylate
• CAS: 1026559-41-0
• 化学式: C₁₄H₉ClN₂O₂
• 分子量: 272.691
• InChiKey: TYLOEMFGLQBHPE-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.7
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.0
• 拓扑面积：
  55
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-chloropyridin-3-yl 1H-indole-5-carboxylate 、 乙酸酐 在 吡啶 作用下， 以95%的产率得到5-chloropyridin-3-yl 1-acetyl-1H-indole-5-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  一系列有效的氯吡啶酯衍生的 SARS-CoV 3CLpro 抑制剂的设计、合成和抗病毒功效。

  摘要：

  描述了一系列5-氯吡啶酯衍生的严重急性呼吸综合征-冠状病毒糜蛋白酶样蛋白酶抑制剂的设计、合成和生物学评价。羧酸酯官能团的位置对于效力至关重要。吲哚环 4 位具有 5-氯吡啶酯的抑制剂 10 是最有效的抑制剂，其 SARS-CoV 3CLpro IC(50) 值为 30 nM，抗病毒 EC(50) 值为 6.9 microM。分子对接研究提供了这些抑制剂可能的结合模式。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2008.08.082
• 作为产物：
  描述：

  吲哚-5-甲酸甲酯 在 4-二甲氨基吡啶 、 1,2-二氯乙烷 、 lithium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 为溶剂， 反应 28.0h， 生成 5-chloropyridin-3-yl 1H-indole-5-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  吲哚氯吡啶酯衍生的 SARS-CoV-2 3CLpro 抑制剂：酶抑制、抗病毒功效、构效关系和 X 射线结构研究

  摘要：

  在此，我们报告了 5-氯吡啶基吲哚羧酸酯衍生物作为一类有效的 SARS-CoV-2 胰凝乳蛋白酶样蛋白酶抑制剂的合成、构效关系研究、酶抑制、抗病毒活性和 X 射线晶体学研究。化合物1在 VeroE6 细胞中表现出 SARS-CoV-2 3CLpro 抑制 IC 50值为 250 nM，抗病毒 EC 50值为 2.8 μM。Remdesivir 是一种 RNA 依赖性 RNA 聚合酶抑制剂，在同一测定中显示出抗病毒 EC 50值为 1.2 μM。在免疫细胞化学测定中，化合物1显示出与瑞德西韦相当的抗病毒活性。具有N-烯丙基衍生物的化合物7d显示出最有效的酶抑制IC 50值为73nM。为了从分子角度了解这些分子的结合特性，确定了与 SARS-CoV 3CLpro 结合的化合物2、7b和9d的 X 射线晶体结构，并比较了它们的结合特性。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.1c01214

文献信息

• Targeting the Main Protease of SARS‐CoV‐2: From the Establishment of High Throughput Screening to the Design of Tailored Inhibitors
  作者：Julian Breidenbach、Carina Lemke、Thanigaimalai Pillaiyar、Laura Schäkel、Ghazl Al Hamwi、Miriam Diett、Robin Gedschold、Nina Geiger、Vittoria Lopez、Salahuddin Mirza、Vigneshwaran Namasivayam、Anke C. Schiedel、Katharina Sylvester、Dominik Thimm、Christin Vielmuth、Lan Phuong Vu、Maria Zyulina、Jochen Bodem、Michael Gütschow、Christa E. Müller

  DOI：10.1002/anie.202016961

  日期：2021.4.26

  The main protease of SARS‐CoV‐2 (Mpro), the causative agent of COVID‐19, constitutes a significant drug target. A new fluorogenic substrate was kinetically compared to an internally quenched fluorescent peptide and shown to be ideally suitable for high throughput screening with recombinantly expressed Mpro. Two classes of protease inhibitors, azanitriles and pyridyl esters, were identified, optimized

  SARS-CoV-2 (M pro ) 的主要蛋白酶是 COVID-19 的病原体，是一个重要的药物靶点。一种新的荧光底物与内部淬灭的荧光肽进行了动力学比较，结果表明它非常适合用重组表达的 M pro进行高通量筛选。两类蛋白酶抑制剂，氮腈和吡啶酯，经过鉴定、优化并进行了深入的生化表征。配备独特氮腈弹头的定制肽同时抑制 M pro和组织蛋白酶 L（一种与病毒细胞进入相关的蛋白酶）。通过位置扫描分析吡啶基吲哚酯。事实证明，我们针对 M pro抑制剂的重点方法优于虚拟筛选。使用两种不可逆抑制剂，氮腈8 (k inac /K=37 500 m -1 s -1 , K=24.0 nm ) 和吡啶酯17 (k inac /K=29 100 m -1 s -1 , K=10.0 nm ），已经发现了有希望进一步开发的候选药物。
• Peptidomimetics for the treatment of coronavirus and picornavirus infections
  申请人：Emory University

  公开号：US11207370B2

  公开（公告）日：2021-12-28

  Compounds, compositions and methods for preventing, treating or curing a coronavirus, picornavirus, and/or hepeviridae virus infection in human subjects or other animal hosts. Specific viruses that can be treated include enteroviruses. In one embodiment, the compounds can be used to treat an infection with a severe acute respiratory syndrome virus, such as human coronavirus 229E, SARS, MERS, SARS-CoV-1 (OC43), and SARS-CoV-2. In another embodiment, the methods are used to treat a patient co-infected with two or more of these viruses, or a combination of one or more of these viruses and norovirus.

  用于预防、治疗或治愈人类或其他动物宿主冠状病毒、皮卡病毒和/或肝病毒科病毒感染的化合物、组合物和方法。可治疗的特定病毒包括肠道病毒。在一个实施方案中，化合物可用于治疗严重急性呼吸系统综合征病毒感染，如人冠状病毒 229E、SARS、MERS、SARS-CoV-1（OC43）和 SARS-CoV-2。在另一个实施方案中，这些方法用于治疗合并感染两种或两种以上这些病毒的患者，或合并感染一种或多种这些病毒和诺如病毒的患者。
• Heteroaromatic ester inhibitors of hepatitis A virus 3C proteinase: Evaluation of mode of action
  作者：Carly Huitema、Jianmin Zhang、Jiang Yin、Michael N.G. James、John C. Vederas、Lindsay D. Eltis

  DOI：10.1016/j.bmc.2008.03.059

  日期：2008.5

  The related 3C and 3C-like proteinase (3C(pro) and 3CL(pro)) of picornaviruses and coronaviruses, respectively, are good drug targets. As part of an effort to generate broad-spectrum inhibitors of these enzymes, we screened a library of inhibitors based on a halopyridinyl ester from a previous study of the severe acute respiratory syndrome (SARS) 3CL proteinase against Hepatitis A virus (HAV) 3C(pro). Three of the compounds, which also had furan rings, inhibited the cleavage activity of HAV 3C(pro) with K-icS of 120-240 nM. HPLC-based assays revealed that the inhibitors were slowly hydrolyzed by both HAV 3C(pro) and SARS 3CL(pro), confirming the identity of the expected products. Mass spectrometric analyses indicated that this hydrolysis proceeded via an acylenzyme intermediate. Modeling studies indicated that the halopyridinyl moiety of the inhibitor fits tightly into the S1-binding pocket, consistent with the lack of tolerance of the inhibitors to modi. cation in this portion of the molecule. These compounds are among the most potent non-peptidic inhibitors reported to date against a 3C(pro). (C) 2008 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• PEPTIDOMIMETICS FOR THE TREATMENT OF CORONAVIRUS AND PICORNAVIRUS INFECTIONS
  申请人：Emory University

  公开号：US20210008150A1

  公开（公告）日：2021-01-14

  Compounds, compositions and methods for preventing, treating or curing a coronavirus, picornavirus, and/or hepeviridae virus infection in human subjects or other animal hosts. Specific viruses that can be treated include enteroviruses. In one embodiment, the compounds can be used to treat an infection with a severe acute respiratory syndrome virus, such as human coronavirus 229E, SARS, MERS, SARS-CoV-1 (OC43), and SARS-CoV-2. In another embodiment, the methods are used to treat a patient co-infected with two or more of these viruses, or a combination of one or more of these viruses and norovirus.