preechinulin | 21008-43-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: preechinulin
• 英文别名: (3S,6S)-3-methyl-6-[[2-(2-methylbut-3-en-2-yl)-1H-indol-3-yl]methyl]piperazine-2,5-dione
• CAS: 21008-43-5
• 化学式: C₁₉H₂₃N₃O₂
• 分子量: 325.411
• InChiKey: LVPZJIGICMPWFH-NHYWBVRUSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.2
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.37
• 拓扑面积：
  74
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  2

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  preechinulin 在 calcium chloride 作用下， 反应 0.05h， 生成 、 cyclo-L-2-tert-dimethylallyl-4,5,7-tri-dimethylallyl-Trp-L-Ala
  参考文献：
  名称：

  两种异戊二烯基转移酶控制着连续的异戊烯基级联在棘枝E素和新棘枝ulin素的生物合成中

  摘要：

  来自曲霉的两个异戊二烯基转移酶通过特殊的顺序异戊烯基化作用来控制棘球ulin碱的生物合成。EchPT1催化第一个异戊二烯化步骤，从而导致前弹性蛋白。独特的EchPT2在连续的烯丙基化级联反应中，将多达三个二甲基烯丙基部分连接到preechinulin上，并且其脱水形成新的echinulins A和B，从而形成至少23到2到4倍的prenylated衍生物。在真菌提取物中确认这些产物可以揭示EchPT2对结构多样性的空前催化作用。

  DOI：

  10.1021/acs.orglett.7b02926
• 作为产物：
  描述：

  N-叔丁氧羰基-L-色氨酸 在 甲酸 、 三乙胺 、 magnesium chloride 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 30.33h， 生成 preechinulin
  参考文献：
  名称：

  底物许可二酮哌嗪反向异戊二烯基转移酶 NotF 的数据科学驱动分析：在蛋白质工程和 (−)-Eurotiumin A 的级联生物催化合成中的应用

  摘要：

  异戊二烯转移是一种早期碳氢键 (C–H) 功能化，普遍存在于多种具有生物活性的细菌、真菌、植物和后生动物二酮哌嗪 (DKP) 生物碱的生物合成中。为了开发异戊二烯化 DKP 吲哚生物碱生物催化构建的统一策略，我们试图鉴定和表征底物允许的 C2 反向异戊二烯基转移酶 (PT)。作为细胞毒性诺托酰胺代谢物生物合成中的第一个剪裁事件，PT NotF 催化短维胺 F 的 C2 反向异戊烯转移。解析 NotF 的晶体结构（与天然底物和异戊烯供体模拟物二甲基烯丙基 S-硫代二磷酸 (DMSPP) 形成复合物）揭示了一个大的，暴露于溶剂的活性位点，提示 NotF 可能具有非常广泛的底物范围。为了评估 NotF 的底物选择性，我们合成了一组 30 种空间和电子分化的色氨酸 DKP，其中大部分在合成有用的转化（2 至 >99%）中被 NotF 选择性异戊二烯化。该底物库的定量表示和描述性统计模型的开发提供了对

  DOI：

  10.1021/jacs.2c06631

文献信息

• Synthesis and Biological Activities of Neoechinulin A Derivatives: New Aspects of Structure-Activity Relationships for Neoechinulin A
  作者：Kouji Kuramochi、Kensuke Ohnishi、Satoshi Fujieda、Mitsuhiro Nakajima、Yoshihiko Saitoh、Nobuo Watanabe、Toshifumi Takeuchi、Atsuo Nakazaki、Fumio Sugawara、Takao Arai、Susumu Kobayashi

  DOI：10.1248/cpb.56.1738

  日期：——

  We synthesized a series of neoechinulin A derivatives and examined the structure–activity relationships in terms of their anti-nitration and anti-oxidant activities as well as their cytoprotective activity against peroxynitrite from SIN-1 (3-(4-morpholinyl)sydnonimine hydrochloride) using PC12 cells. Our results showed that the C-8/C-9 double bond, which constitutes a conjugate system with indole and diketopiperazine moieties of neoechinulin A is essential for anti-nitration and anti-oxidant activities as well as protection against SIN-1 cytotoxicity. The presence of an intact diketopiperazine moiety is an additional requirement for anti-nitration activity but not for the cytoprotective action. Our results suggest that the antioxidant activity or electrophilic nature of the C-8 carbon, both of which are afforded by the C-8/C-9 double bond, may play a role in the cytoprotective properties of this alkaloid.

  我们合成了一系列新噌啉 A 衍生物，并利用 PC12 细胞研究了它们在抗硝化和抗氧化活性方面的结构-活性关系，以及它们对 SIN-1（3-(4-吗啉基)嘧啶盐酸盐）产生的过亚硝酸盐的细胞保护活性。我们的研究结果表明，C-8/C-9 双键与 neoechinulin A 的吲哚和二酮哌嗪分子构成共轭体系，对于抗硝化和抗氧化活性以及抵御 SIN-1 的细胞毒性至关重要。完整的二酮哌嗪分子的存在是抗硝化活性的额外要求，但不是细胞保护作用的额外要求。我们的研究结果表明，C-8 碳的抗氧化活性或亲电性（两者均由 C-8/C-9 双键提供）可能在这种生物碱的细胞保护特性中起了一定作用。
• Two Prenyltransferases Govern a Consecutive Prenylation Cascade in the Biosynthesis of Echinulin and Neoechinulin
  作者：Viola Wohlgemuth、Florian Kindinger、Xiulan Xie、Bin-Gui Wang、Shu-Ming Li

  DOI：10.1021/acs.orglett.7b02926

  日期：2017.11.3

  Two prenyltransferases from Aspergillus ruber control the echinulin biosynthesis via exceptional sequential prenylations. EchPT1 catalyzes the first prenylation step, leading to preechinulin. The unique EchPT2 attaches, in a consecutive prenylation cascade, up to three dimethylallyl moieties to preechinulin and its dehydro forms neoechinulins A and B, resulting in the formation of at least 23 2- to

  来自曲霉的两个异戊二烯基转移酶通过特殊的顺序异戊烯基化作用来控制棘球ulin碱的生物合成。EchPT1催化第一个异戊二烯化步骤，从而导致前弹性蛋白。独特的EchPT2在连续的烯丙基化级联反应中，将多达三个二甲基烯丙基部分连接到preechinulin上，并且其脱水形成新的echinulins A和B，从而形成至少23到2到4倍的prenylated衍生物。在真菌提取物中确认这些产物可以揭示EchPT2对结构多样性的空前催化作用。
• Data Science-Driven Analysis of Substrate-Permissive Diketopiperazine Reverse Prenyltransferase NotF: Applications in Protein Engineering and Cascade Biocatalytic Synthesis of (−)-Eurotiumin A
  作者：Samantha P. Kelly、Vikram V. Shende、Autumn R. Flynn、Qingyun Dan、Ying Ye、Janet L. Smith、Sachiko Tsukamoto、Matthew S. Sigman、David H. Sherman

  DOI：10.1021/jacs.2c06631

  日期：2022.10.26

  functionalization prevalent in the biosynthesis of a diverse array of biologically active bacterial, fungal, plant, and metazoan diketopiperazine (DKP) alkaloids. Toward the development of a unified strategy for biocatalytic construction of prenylated DKP indole alkaloids, we sought to identify and characterize a substrate-permissive C2 reverse prenyltransferase (PT). As the first tailoring event within the biosynthesis

  异戊二烯转移是一种早期碳氢键 (C–H) 功能化，普遍存在于多种具有生物活性的细菌、真菌、植物和后生动物二酮哌嗪 (DKP) 生物碱的生物合成中。为了开发异戊二烯化 DKP 吲哚生物碱生物催化构建的统一策略，我们试图鉴定和表征底物允许的 C2 反向异戊二烯基转移酶 (PT)。作为细胞毒性诺托酰胺代谢物生物合成中的第一个剪裁事件，PT NotF 催化短维胺 F 的 C2 反向异戊烯转移。解析 NotF 的晶体结构（与天然底物和异戊烯供体模拟物二甲基烯丙基 S-硫代二磷酸 (DMSPP) 形成复合物）揭示了一个大的，暴露于溶剂的活性位点，提示 NotF 可能具有非常广泛的底物范围。为了评估 NotF 的底物选择性，我们合成了一组 30 种空间和电子分化的色氨酸 DKP，其中大部分在合成有用的转化（2 至 >99%）中被 NotF 选择性异戊二烯化。该底物库的定量表示和描述性统计模型的开发提供了对