Peptidyl-Prolyl Model Study: How Does the Electronic Effect Influence the Amide Bond Conformation?
作者:Pavel K. Mykhailiuk、Vladimir Kubyshkin、Thorsten Bach、Nediljko Budisa
DOI:10.1021/acs.joc.7b00803
日期:2017.9.1
substituent group (electronic effect) without the side-chain conformation being affected by a stereoelectronic effect. These proline analogues were prepared by [2 + 2] photocycloaddition of (2-allylamino)acrylic acid derivatives. Subsequent pKa studies demonstrated a remarkable electronic effect of the 4-fluorine substitution, while the effect of the 4-methyl group was negligible. The trans/cis amide ratio was
胶原蛋白是动物体内最丰富的蛋白质,其三螺旋结构具有一定的稳定性,这归因于其翻译后安装在脯氨酰残基第4位的羟基的稳定性。为了阐明这种现象的性质,我们研究了4-取代基对肽基-脯氨酰基类似物中酰胺异构体的影响。2,4-甲基脯氨酸的刚性双环骨架使我们能够追踪取代基的键合冲击(电子效应),而侧链构象不会受到立体电子效应的影响。这些脯氨酸类似物是通过[2- +烯丙基氨基)丙烯酸衍生物的[2 + 2]光环加成制备的。随后的p K a研究表明4-氟取代具有显着的电子效应,而4-甲基的效应可忽略不计。所述反式/顺式酰胺比在低温条件下的模型化合物进行测定。观察到的反酰胺流行率非常高,就这一点而言,与脯氨酸相比,2,4-甲基脯氨酸更靠近伯α-氨基酸。同时,与N-乙酰脯氨酰相比,酰胺的旋转速度要高3-4个数量级。最后,我们的结果表明4-取代基的电子效应仅影响酰胺异构化的动力学,而不影响反式-旋转异构体的热力学流行度。