作者:Jarrett M. Pelton、Joshua E. Hochuli、Patric W. Sadecki、Takayuki Katoh、Hiroaki Suga、Leslie M. Hicks、Eugene N. Muratov、Alexander Tropsha、Albert A. Bowers
DOI:10.1021/jacs.3c11306
日期:2024.3.27
macrocyclases, PatG and PCY1, were used to effect the head-to-tail macrocyclization of candidate NPs. This retrobiosynthetic analysis identified a collection of high-priority building blocks that are enriched throughout peptide NPs, yet they had not previously been tested in cell-free translation. To expand the cell-free toolbox into this space, we established, optimized, and characterized the flexizyme-enabled
体外无细胞翻译系统的灵活性和功能已经取得了显着的进步。利用重组酶整合非规范氨基酸和补体翻译的能力不断增强,使得基于肽的天然产物 (NP) 和 NP 样分子的无细胞生产成为可能。我们预计可以通过这种方式获得更多此类化合物和类似物。为了评估当前无细胞技术可直接访问的肽 NP 空间,我们开发了一种肽解析算法,该算法可根据核糖体翻译逻辑将肽 NP 分解为构建块。使用所得数据集,我们广泛分析这些特殊化合物的生物物理特性,并进行逆转录生物合成分析,以预测哪些肽纳米颗粒可以在增强的无细胞翻译反应中直接合成。然后,我们通过准备高度修饰的肽纳米粒子库来测试这些预测。两种大环化酶 PatG 和 PCY1 用于实现候选 NP 的头尾大环化。这种逆转录生物合成分析确定了一系列高优先级构建模块,这些构建模块在肽纳米颗粒中富集,但之前尚未在无细胞翻译中进行过测试。为了将无细胞工具箱扩展到这一领域,我们建立、优化并表征