1-benzyl-5-methyl-1H-benzo[d]imidazole-2-thiol | 30769-97-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并咪唑类
• 英文名称: 1-benzyl-5-methyl-1H-benzo[d]imidazole-2-thiol
• 英文别名: 1-Benzyl-5-methyl-1H-benzoimidazole-2-thiol；3-benzyl-6-methyl-1H-benzimidazole-2-thione
• CAS: 30769-97-2
• 化学式: C₁₅H₁₄N₂S
• 分子量: 254.356
• InChiKey: ORCFUYYEFBWVOB-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.2
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.13
• 拓扑面积：
  47.4
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  1

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  PCM-0102338 、 1-benzyl-5-methyl-1H-benzo[d]imidazole-2-thiol 在 potassium carbonate 作用下， 以59%的产率得到1-(2-((1-benzyl-5-methyl-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)thio)acetyl)imidazolidin-2-one
  参考文献：
  名称：

  发现 2-硫代苯并咪唑作为 SARS-CoV-2 主要蛋白酶的非共价抑制剂

  摘要：

  针对 SARS-CoV-2 的抗病毒药物的发现是结束 COVID-19 大流行和应对未来爆发的重要一步。在这种情况下，主要蛋白酶 (M pro ) 代表了开发冠状病毒抗病毒药物的理想靶点，它在不同菌株中保守并且对生存至关重要。在这项工作中，我们使用计算机工具创建并验证了一个对接协议，该协议能够预测 M pro催化位点的结合剂。以下基于结构的虚拟筛选 ZINC 库的一个子集（超过 430 万个独特结构），导致鉴定出具有 2-硫代苯并咪唑支架的命中化合物。使用针对重组 M pro的基于 FRET 的蛋白水解测定法确认抑制活性. 在对接姿势分析的指导下，通过合成小型类似物库获得结构-活动关系。我们的努力导致了一种微摩尔 M pro抑制剂 (IC 50 = 14.9 µM)的鉴定 ，其原始支架具有理想的药物样特性（使用 QikProp 函数预测），代表了开发新型冠状病毒的有希望的领先地位抗病毒药。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2022.128867
• 作为产物：
  描述：

  溴甲苯 在 铁粉 、 sodium hydride 、 氯化铵 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醇 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 mineral oil 为溶剂， 反应 16.0h， 生成 1-benzyl-5-methyl-1H-benzo[d]imidazole-2-thiol
  参考文献：
  名称：

  发现 2-硫代苯并咪唑作为 SARS-CoV-2 主要蛋白酶的非共价抑制剂

  摘要：

  针对 SARS-CoV-2 的抗病毒药物的发现是结束 COVID-19 大流行和应对未来爆发的重要一步。在这种情况下，主要蛋白酶 (M pro ) 代表了开发冠状病毒抗病毒药物的理想靶点，它在不同菌株中保守并且对生存至关重要。在这项工作中，我们使用计算机工具创建并验证了一个对接协议，该协议能够预测 M pro催化位点的结合剂。以下基于结构的虚拟筛选 ZINC 库的一个子集（超过 430 万个独特结构），导致鉴定出具有 2-硫代苯并咪唑支架的命中化合物。使用针对重组 M pro的基于 FRET 的蛋白水解测定法确认抑制活性. 在对接姿势分析的指导下，通过合成小型类似物库获得结构-活动关系。我们的努力导致了一种微摩尔 M pro抑制剂 (IC 50 = 14.9 µM)的鉴定 ，其原始支架具有理想的药物样特性（使用 QikProp 函数预测），代表了开发新型冠状病毒的有希望的领先地位抗病毒药。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2022.128867

文献信息

• Novel Benzo[d]imidazole-2(3H)-thiones as Potent Inhibitors of the .ALPHA.-Melanocyte Stimulating Hormone Induced Melanogenesis in Melanoma B16 Cells
  作者：Jee-Hyun Lee、Pillaiyar Thanigaimalai、Ki-Cheul Lee、Seong-Cheol Bang、Min-Seok Kim、Vinay Kumar Sharma、Cheong-Yong Yun、Eunmiri Roh、Youngsoo Kim、Sang-Hun Jung

  DOI：10.1248/cpb.58.918

  日期：——

  In order to determine the optimum size of heterocycle of lead compound 1 (6-methyl-3-phenethyl-3,4-dihydro-1H-quinoline-2-thione; IC50=0.8 μM) for inhibition of melanogenesis, we have synthesized and evaluated some benzimdazole-2(3H)-thiones 5a—e. The preliminary bioassay has shown that the benzimdazole-2(3H)-thione motif of 5 is essential structural unit for their inhibitory activity. Among all thiones 5a—e, the compound 5d strongly inhibited the formation of melanin with IC50 value of 1.3 μM.

  为了确定先导化合物1（6-甲基-3-苯乙基-3,4-二氢-1H-喹啉-2-硫酮；IC50=0.8 μM）抑制黑色素生成的最佳杂环大小，我们合成并评估了一些苯基咪唑-2(3H)-硫酮5a—e。初步生物检测结果表明，化合物5的苯基咪唑-2(3H)-硫酮构型是其抑制活性的必要结构单元。在所有硫酮5a—e中，化合物5d对黑色素的生成具有强烈抑制作用，其IC50值为1.3 μM。
• Discovery of 2-thiobenzimidazoles as noncovalent inhibitors of SARS-CoV-2 main protease
  作者：Davide Deodato、Nadeem Asad、Timothy M. Dore

  DOI：10.1016/j.bmcl.2022.128867

  日期：2022.9

  The discovery of antiviral agents against SARS-CoV-2 is an important step toward ending the COVID-19 pandemic and to tackle future outbreaks. In this context, the main protease (Mpro) represents an ideal target for developing coronavirus antivirals, being conserved among different strains and essential for survival. In this work, using in silico tools, we created and validated a docking protocol able

  针对 SARS-CoV-2 的抗病毒药物的发现是结束 COVID-19 大流行和应对未来爆发的重要一步。在这种情况下，主要蛋白酶 (M pro ) 代表了开发冠状病毒抗病毒药物的理想靶点，它在不同菌株中保守并且对生存至关重要。在这项工作中，我们使用计算机工具创建并验证了一个对接协议，该协议能够预测 M pro催化位点的结合剂。以下基于结构的虚拟筛选 ZINC 库的一个子集（超过 430 万个独特结构），导致鉴定出具有 2-硫代苯并咪唑支架的命中化合物。使用针对重组 M pro的基于 FRET 的蛋白水解测定法确认抑制活性. 在对接姿势分析的指导下，通过合成小型类似物库获得结构-活动关系。我们的努力导致了一种微摩尔 M pro抑制剂 (IC 50 = 14.9 µM)的鉴定 ，其原始支架具有理想的药物样特性（使用 QikProp 函数预测），代表了开发新型冠状病毒的有希望的领先地位抗病毒药。