PCM-0102338

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 有机碳酸及其衍生物
• 英文名称: PCM-0102338
• 英文别名: 1-(2-Chloroacetyl)imidazolidin-2-one
• 化学式: C₅H₇ClN₂O₂
• mdl: MFCD06363490
• 分子量: 162.576
• InChiKey: GZQIJKIKCCPGKH-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.3
• 重原子数：
  10
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  49.4
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  2

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  PCM-0102338 、 1-benzyl-5-(tert-butyl)-1H-benzo[d]imidazole-2-thiol 在 potassium carbonate 作用下， 以38%的产率得到1-(2-((1-benzyl-5-(tert-butyl)-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)thio)acetyl)imidazolidin-2-one
  参考文献：
  名称：

  发现 2-硫代苯并咪唑作为 SARS-CoV-2 主要蛋白酶的非共价抑制剂

  摘要：

  针对 SARS-CoV-2 的抗病毒药物的发现是结束 COVID-19 大流行和应对未来爆发的重要一步。在这种情况下，主要蛋白酶 (M pro ) 代表了开发冠状病毒抗病毒药物的理想靶点，它在不同菌株中保守并且对生存至关重要。在这项工作中，我们使用计算机工具创建并验证了一个对接协议，该协议能够预测 M pro催化位点的结合剂。以下基于结构的虚拟筛选 ZINC 库的一个子集（超过 430 万个独特结构），导致鉴定出具有 2-硫代苯并咪唑支架的命中化合物。使用针对重组 M pro的基于 FRET 的蛋白水解测定法确认抑制活性. 在对接姿势分析的指导下，通过合成小型类似物库获得结构-活动关系。我们的努力导致了一种微摩尔 M pro抑制剂 (IC 50 = 14.9 µM)的鉴定 ，其原始支架具有理想的药物样特性（使用 QikProp 函数预测），代表了开发新型冠状病毒的有希望的领先地位抗病毒药。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2022.128867
• 作为产物：
  描述：

  2-咪唑烷酮 、 氯乙酰氯 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 2.5h， 以48%的产率得到PCM-0102338
  参考文献：
  名称：

  发现 2-硫代苯并咪唑作为 SARS-CoV-2 主要蛋白酶的非共价抑制剂

  摘要：

  针对 SARS-CoV-2 的抗病毒药物的发现是结束 COVID-19 大流行和应对未来爆发的重要一步。在这种情况下，主要蛋白酶 (M pro ) 代表了开发冠状病毒抗病毒药物的理想靶点，它在不同菌株中保守并且对生存至关重要。在这项工作中，我们使用计算机工具创建并验证了一个对接协议，该协议能够预测 M pro催化位点的结合剂。以下基于结构的虚拟筛选 ZINC 库的一个子集（超过 430 万个独特结构），导致鉴定出具有 2-硫代苯并咪唑支架的命中化合物。使用针对重组 M pro的基于 FRET 的蛋白水解测定法确认抑制活性. 在对接姿势分析的指导下，通过合成小型类似物库获得结构-活动关系。我们的努力导致了一种微摩尔 M pro抑制剂 (IC 50 = 14.9 µM)的鉴定 ，其原始支架具有理想的药物样特性（使用 QikProp 函数预测），代表了开发新型冠状病毒的有希望的领先地位抗病毒药。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2022.128867

文献信息

• US3937612A
  申请人：——

  公开号：US3937612A

  公开（公告）日：1976-02-10
• Discovery of 2-thiobenzimidazoles as noncovalent inhibitors of SARS-CoV-2 main protease
  作者：Davide Deodato、Nadeem Asad、Timothy M. Dore

  DOI：10.1016/j.bmcl.2022.128867

  日期：2022.9

  The discovery of antiviral agents against SARS-CoV-2 is an important step toward ending the COVID-19 pandemic and to tackle future outbreaks. In this context, the main protease (Mpro) represents an ideal target for developing coronavirus antivirals, being conserved among different strains and essential for survival. In this work, using in silico tools, we created and validated a docking protocol able

  针对 SARS-CoV-2 的抗病毒药物的发现是结束 COVID-19 大流行和应对未来爆发的重要一步。在这种情况下，主要蛋白酶 (M pro ) 代表了开发冠状病毒抗病毒药物的理想靶点，它在不同菌株中保守并且对生存至关重要。在这项工作中，我们使用计算机工具创建并验证了一个对接协议，该协议能够预测 M pro催化位点的结合剂。以下基于结构的虚拟筛选 ZINC 库的一个子集（超过 430 万个独特结构），导致鉴定出具有 2-硫代苯并咪唑支架的命中化合物。使用针对重组 M pro的基于 FRET 的蛋白水解测定法确认抑制活性. 在对接姿势分析的指导下，通过合成小型类似物库获得结构-活动关系。我们的努力导致了一种微摩尔 M pro抑制剂 (IC 50 = 14.9 µM)的鉴定 ，其原始支架具有理想的药物样特性（使用 QikProp 函数预测），代表了开发新型冠状病毒的有希望的领先地位抗病毒药。