gemcitabine-5'-diphosphate | 116371-66-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物 - 有机含氧阴离子化合物
• 英文名称: gemcitabine-5'-diphosphate
• 英文别名: gemcitabine diphosphate；2'-deoxy-2',2'-difluorocytidine 5-diphosphate；dFdCDP；F2CDP；Gemcitabine 5'-diphosphate；[(2R,3R,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-4,4-difluoro-3-hydroxyoxolan-2-yl]methyl phosphono hydrogen phosphate
• CAS: 116371-66-5
• 化学式: C₉H₁₃F₂N₃O₁₀P₂
• 分子量: 423.161
• InChiKey: FRQISCZGNNXEMD-QPPQHZFASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.1
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  201
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  12

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  gemcitabine-5'-diphosphate 生成 胞嘧啶
  参考文献：
  名称：

  BAKER, C. H.;BANZON, J.;BOLLINGER, J. M.;STUBBE, J.;SAMANO, V.;ROBINS, M.+, J. MED. CHEM., 34,(1991) N, C. 1879-1884

  摘要：

  DOI：
• 作为产物：
  描述：

  吉西他滨单磷酸酯 在 1,4-dithio-D,L-threitol 、 UMP-CMP kinase 、 5’-三磷酸腺苷 、 magnesium chloride 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 0.5h， 以56%的产率得到gemcitabine-5'-diphosphate
  参考文献：
  名称：

  2′,2′-二氟-2′-脱氧胞苷 5′-三磷酸灭活莱希曼乳杆菌核糖核苷酸还原酶：共价修饰

  摘要：

  来自莱希曼乳杆菌的核糖核苷酸还原酶 (RNR) 是一种 76 kDa 单体，使用腺苷钴胺素 (AdoCbl) 作为辅助因子，催化核苷三磷酸转化为脱氧核苷酸，并被 1 当量的 2',2'-二氟快速（<30 秒）灭活-2'-脱氧胞苷5'-三磷酸（F 2 CTP）。合成了[1'- 3 H]-和[5- 3 H]F 2 CTP并独立用于灭活RNR。灭活混合物的 Sephadex G-50 色谱显示，0.47 当量的糖与 RNR 共价结合，并且释放了 0.71 当量的胞嘧啶。或者，在未煮沸的情况下通过 SDS-PAGE 对失活的 RNR 进行分析，导致 33% 的 RNR 迁移为 110 kDa 蛋白质。用 [1'- 3 H]F 2 CTP 和 [1'- 2 H]F 2 CTP的混合物灭活 RNR ，然后用 NaBH 4还原，用碘乙酰胺烷基化，胰蛋白酶消化，并对所得肽进行 HPLC 分离通过MALDI-TOF质谱(MS)分离鉴定出RNR

  DOI：

  10.1021/bi902132u

文献信息

• Nucleotide mimics and their prodrugs
  申请人：——

  公开号：US20040059104A1

  公开（公告）日：2004-03-25

  The present invention relates to nucleoside diphosphate mimics and nucleoside triphosphate mimics, which contain diphosphate or triphosphate moiety mimics and optionally sugar-modifications and/or base-modifications. The nucleotide mimics of the present invention, in a form of a pharmaceutically acceptable salt, a pharmaceutically acceptable prodrug, or a pharmaceutical formulation, are useful as antiviral, antimicrobial, and anticancer agents. The present invention provides a method for the treatment of viral infections, microbial infections, and proliferative disorders. The present invention also relates to pharmaceutical compositions comprising the compounds of the present invention optionally in combination with other pharmaceutically active agents.

  本发明涉及核苷二磷酸模拟物和核苷三磷酸模拟物，其中包含二磷酸或三磷酸基团模拟物，以及可选的糖修饰和/或碱基修饰。本发明的核苷酸模拟物，以药学上可接受的盐、药学上可接受的前药或药物配方的形式，可用作抗病毒、抗微生物和抗癌剂。本发明提供了一种治疗病毒感染、微生物感染和增生性疾病的方法。本发明还涉及包含本发明化合物的药物组合物，可选地与其他药理活性剂结合。
• Facile Small Scale Synthesis of Nucleoside 5′-Phosphate Mixtures
  作者：Robert S. Jansen、Hilde Rosing、Jan HM Schellens、Jos H. Beijnen

  DOI：10.1080/15257770903451546

  日期：2010.1

  phosphorylate small amounts of nucleosides (0.05 μmol) into mixtures of their 5′-mono-, di-, and triphosphates in a one-pot reaction. The nucleosides were first converted into their dichlorophosphates using a large excess (15–18 equivalents) of phosphorous oxychloride in trimethylphosphate. The large excess resulted in good dichlorophosphate yields (46–76%) for the four nucleosides tested. Upon the addition

  我们提出了一种简便的方法，可以在一锅反应中将少量的核苷（0.05μmol）磷酸化为5'-单-，二-和三磷酸的混合物。首先使用磷酸三甲酯中大量过量的氯氧化磷（15-18当量）将核苷转化为其二氯磷酸酯。大量过量导致所测试的四种核苷的二氯磷酸酯收率良好（46–76％）。在将磷酸三丁铵与另外的三丁胺（均20当量）一起加入后，将二氯磷酸酯转化为含有等量的单磷酸酯，二磷酸酯和三磷酸酯的混合物。所提出的方法已成功地应用于合成稳定同位素标记的核苷酸的混合物，该混合物可用作定量质谱分析中的内标。
• Selective cellular targeting: multifunctional delivery vehicles, multifunctional prodrugs, use as antineoplastic drugs
  申请人：Drug Innovation & Design, Inc.

  公开号：US20030138432A1

  公开（公告）日：2003-07-24

  The present invention relates to the compositions, methods, and applications of a novel approach to selective cellular targeting. The purpose of this invention is to enable the selective delivery and/or selective activation of effector molecules to target cells for diagnostic or therapeutic purposes. The present invention relates to multi-functional prodrugs or targeting vehicles wherein each functionality is capable of enhancing targeting selectivity, affinity, intracellular transport, activation or detoxification. The present invention also relates to ultra-low dose, multiple target, multiple drug chemotherapy and targeted immunotherapy for cancer treatment.

  本发明涉及一种新的选择性细胞靶向的组合物、方法和应用。本发明的目的是为了实现对目标细胞的选择性输送和/或选择性激活效应分子，以进行诊断或治疗。本发明涉及多功能前药或靶向载体，其中每个功能都能增强靶向选择性、亲和力、细胞内转运、激活或解毒。本发明还涉及超低剂量、多靶点、多药物化疗和靶向免疫疗法，用于癌症治疗。
• New Mechanism of Gemcitabine and Its Phosphates: DNA Polymerization Disruption via 3′–5′ Exonuclease Inhibition
  作者：Shuzhang Yang、Danyan Luo、Na Li、Chuncheng Li、Shuo Tang、Zhen Huang

  DOI：10.1021/acs.biochem.0c00543

  日期：2020.11.17

  Gemcitabine (dFdC), a modified deoxycytidine (dC) widely used in tumor treatment, is a prodrug that is phosphorylated to generate mono-, di-, and triphosphates. The triphosphate (dFdCTP) is incorporated into DNA to terminate DNA synthesis in cancer. Some incorporated dFdC nucleotides can be partially removed by the 3′–5′ exonuclease activity, namely its editing function, and the others escape the editing

  吉西他滨（dFdC）是一种广泛用于肿瘤治疗的修饰的脱氧胞苷（dC），是一种被磷酸化以生成一磷酸，二磷酸和三磷酸的前药。将三磷酸酯（dFdCTP）掺入DNA以终止癌症中的DNA合成。一些掺入的dFdC核苷酸可以通过3'-5'核酸外切酶活性（即其编辑功能）部分除去，而其他的则可以逃避编辑。但是，尚不清楚dFdC是否有逃逸编辑的有效机制。我们首先发现，与dFdC不同，其单磷酸，二磷酸和三磷酸可以抑制DNA聚合酶I的3'–5'核酸外切酶，抑制编辑并允许有效的转义机制，而其聚合酶活性并未受到明显影响。因此，这些磷酸盐可防止去除掺入的dFdC残留物，从而积极阻断DNA的延伸和合成。这些磷酸盐的抑制效率遵循吉西他滨的单磷酸，二磷酸和三磷酸的增加顺序（dFdC
• Specific Therapy and Medicament Using Integrin Ligands for Treating Cancer
  申请人：Merck Patent GmbH

  公开号：EP2578225A1

  公开（公告）日：2013-04-10

  The invention relates to a combination therapy for the treatment of tumors and tumor metastases comprising administration of integrin ligands, preferably integrin antagonists, together with co-therapeutic agents or therapy forms that have synergistic efficacy when administered consecutively with said ligands, such as chemotherapeutic agents and or radiation therapy. The therapy results in a synergistic potential increase of the inhibition effect of each individual therapeutic on tumor cell proliferation, yielding more effective treatment than found by administering an individual component alone, concurrently or not in the dosage regime of the present invention.

  本发明涉及一种治疗肿瘤和肿瘤转移瘤的联合疗法，包括整合素配体（最好是整合素拮抗剂）与与所述配体连续给药时具有协同疗效的共同治疗剂或治疗形式（如化疗剂和或放射治疗）一起给药。这种疗法可使每种治疗剂对肿瘤细胞增殖的抑制作用协同增效，从而产生比单独使用一种成分、同时使用或不使用本发明的剂量机制更有效的治疗效果。