5-(4-phenethyl-5-trifluoromethylpyrimidin-2-ylamino)-1,3-dihydro-indol-2-one | 1360460-87-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: 5-(4-phenethyl-5-trifluoromethylpyrimidin-2-ylamino)-1,3-dihydro-indol-2-one
• 英文别名: 5-[[4-(2-Phenylethyl)-5-(trifluoromethyl)pyrimidin-2-yl]amino]-1,3-dihydroindol-2-one；5-[[4-(2-phenylethyl)-5-(trifluoromethyl)pyrimidin-2-yl]amino]-1,3-dihydroindol-2-one
• CAS: 1360460-87-2
• 化学式: C₂₁H₁₇F₃N₄O
• 分子量: 398.387
• InChiKey: NCCPLOMUQQAFJP-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.1
• 重原子数：
  29
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.19
• 拓扑面积：
  66.9
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  5-氨基-1,3-二氢吲哚-2-酮 在 bis-triphenylphosphine-palladium(II) chloride 、 copper(l) iodide 、 palladium on activated charcoal 、 氢气 、 三乙胺 、 zinc(II) chloride 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 叔丁醇 为溶剂， 反应 1.0h， 生成 5-(4-phenethyl-5-trifluoromethylpyrimidin-2-ylamino)-1,3-dihydro-indol-2-one
  参考文献：
  名称：

  结构动力学关系揭示了 FAK 抑制剂对 PYK2 的选择性机制

  摘要：

  越来越多的证据表明，延长药物靶点停留时间与提高药物疗效之间存在显着相关性。在这里，我们报告了两种密切相关激酶之间动力学选择性的结构原理：粘着斑激酶 (FAK) 和富含脯氨酸的酪氨酸激酶 2 (PYK2)。我们发现缓慢解离的 FAK 抑制剂会在 FAK 的 DFG 基序上诱导螺旋结构，但不会在 PYK2 上诱导螺旋结构。结合动力学数据、高分辨率结构和诱变数据支持抑制剂与 DFG 螺旋区域的疏水相互作用的作用，为 FAK 的缓慢解离速率和 PYK2 的动力学选择性提供了结构原理。我们的实验数据与从分子模拟计算的相对停留时间密切相关，支持合理优化配体停留时间的可行策略。我们认为蛋白质结构迁移率和配体诱导效应之间的相互作用是 FAK 与 PYK2 抑制剂的动力学选择性的关键调节剂。

  DOI：

  10.1016/j.chembiol.2021.01.003

文献信息

• PYRIMIDINE DERIVATIVES AS FAK INHIBITORS
  申请人：Heinrich Timo

  公开号：US20130158005A1

  公开（公告）日：2013-06-20

  Compounds of the formula (I), in which R 1 , R 2 and R 3 have the meanings indicated in Claim 1 , are kinase inhibitors and can be employed, inter alia, for the treatment of tumours.

  公式（I）中的化合物，其中R1、R2和R3具有权利要求1中指示的含义，是激酶抑制剂，可用于治疗肿瘤。
• PYRIMIDINDERIVATE ALS FAK INHIBITOREN
  申请人：Merck Patent GmbH

  公开号：EP2606034B1

  公开（公告）日：2016-03-09
• US8906916B2
  申请人：——

  公开号：US8906916B2

  公开（公告）日：2014-12-09
• Structure-kinetic relationship reveals the mechanism of selectivity of FAK inhibitors over PYK2
  作者：Benedict-Tilman Berger、Marta Amaral、Daria B. Kokh、Ariane Nunes-Alves、Djordje Musil、Timo Heinrich、Martin Schröder、Rebecca Neil、Jing Wang、Iva Navratilova、Joerg Bomke、Jonathan M. Elkins、Susanne Müller、Matthias Frech、Rebecca C. Wade、Stefan Knapp

  DOI：10.1016/j.chembiol.2021.01.003

  日期：2021.5

  There is increasing evidence of a significant correlation between prolonged drug-target residence time and increased drug efficacy. Here, we report a structural rationale for kinetic selectivity between two closely related kinases: focal adhesion kinase (FAK) and proline-rich tyrosine kinase 2 (PYK2). We found that slowly dissociating FAK inhibitors induce helical structure at the DFG motif of FAK but not

  越来越多的证据表明，延长药物靶点停留时间与提高药物疗效之间存在显着相关性。在这里，我们报告了两种密切相关激酶之间动力学选择性的结构原理：粘着斑激酶 (FAK) 和富含脯氨酸的酪氨酸激酶 2 (PYK2)。我们发现缓慢解离的 FAK 抑制剂会在 FAK 的 DFG 基序上诱导螺旋结构，但不会在 PYK2 上诱导螺旋结构。结合动力学数据、高分辨率结构和诱变数据支持抑制剂与 DFG 螺旋区域的疏水相互作用的作用，为 FAK 的缓慢解离速率和 PYK2 的动力学选择性提供了结构原理。我们的实验数据与从分子模拟计算的相对停留时间密切相关，支持合理优化配体停留时间的可行策略。我们认为蛋白质结构迁移率和配体诱导效应之间的相互作用是 FAK 与 PYK2 抑制剂的动力学选择性的关键调节剂。