5-(4-benzoylthiobut-1-ynyl)-3',5'-O-bis(tert-butyldimethylsilyl)-2'-deoxyuridine | 1342885-24-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 5-(4-benzoylthiobut-1-ynyl)-3',5'-O-bis(tert-butyldimethylsilyl)-2'-deoxyuridine
• CAS: 1342885-24-8
• 化学式: C₃₂H₄₈N₂O₆SSi₂
• 分子量: 644.98
• InChiKey: PNQXNNKLPLPJMA-OYUWMTPXSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.55
• 重原子数：
  43.0
• 可旋转键数：
  9.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.59
• 拓扑面积：
  99.62
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  8.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-(4-benzoylthiobut-1-ynyl)-3',5'-O-bis(tert-butyldimethylsilyl)-2'-deoxyuridine 在 吡啶 、 四丁基氟化铵 、 氟化氢吡啶 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 31.0h， 生成 5-(4-benzoylthiobut-1-ynyl)-2'-deoxy-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)uridine
  参考文献：
  名称：

  链内锁增加了双链体的稳定性和碱基配对的选择性。

  摘要：

  在相邻核苷碱基之间具有二硫键的寡脱氧核苷酸探针显示，RNA双链的双链体的熔点升高，最高可达7.6摄氏度。通过自动合成，弱配对的TT二聚体被锁定的2'-脱氧-5-（硫代炔基）尿苷残基取代。

  DOI：

  10.1039/c1cc14008f
• 作为产物：
  描述：

  叔丁基二甲基氯硅烷 在 咪唑 、 copper(l) iodide 、 四(三苯基膦)钯 、 三乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 35.17h， 生成 5-(4-benzoylthiobut-1-ynyl)-3',5'-O-bis(tert-butyldimethylsilyl)-2'-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  链内锁增加了双链体的稳定性和碱基配对的选择性。

  摘要：

  在相邻核苷碱基之间具有二硫键的寡脱氧核苷酸探针显示，RNA双链的双链体的熔点升高，最高可达7.6摄氏度。通过自动合成，弱配对的TT二聚体被锁定的2'-脱氧-5-（硫代炔基）尿苷残基取代。

  DOI：

  10.1039/c1cc14008f